62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_33562 on replicon NC_009047
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009047  PICST_33562  predicted protein  100 
 
 		 505 aa  1044    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.884137  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06864  translation initiation factor eif-2b delta subunit (AFU_orthologue; AFUA_5G13040)  43.35 
 
 		 539 aa  332  1e-89  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0293863 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01390  hypothetical protein  31.52 
 
 		 472 aa  220  5e-56  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_14255  predicted protein  32.47 
 
 		 326 aa  208  2e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42770  predicted protein  25.65 
 
 		 489 aa  157  4e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00451975  normal  0.119284 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2067  translation initiation factor IF-2B subunit delta  24 
 
 		 309 aa  79  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2966  translation initiation factor, aIF-2BII family  21.77 
 
 		 351 aa  78.2  0.0000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00871533  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0673  translation initiation factor IF-2B subunit delta  28.64 
 
 		 313 aa  68.2  0.0000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2762  translation initiation factor IF-2B subunit delta  21.21 
 
 		 331 aa  67.8  0.0000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00225031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0331  translation initiation factor, aIF-2BII family  22.52 
 
 		 309 aa  67.8  0.0000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1262  translation initiation factor IF-2B subunit delta  26.9 
 
 		 302 aa  66.6  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.156828  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0557  translation initiation factor IF-2B subunit delta  25.58 
 
 		 319 aa  65.5  0.000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0282254 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0384  translation initiation factor IF-2B subunit delta  27.23 
 
 		 331 aa  64.7  0.000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.111584  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2269  translation initiation factor IF-2B subunit delta  21.76 
 
 		 323 aa  63.2  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0752053 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0074  initiation factor 2B related  24.31 
 
 		 292 aa  62.4  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0571  translation initiation factor, aIF-2BII family  19.44 
 
 		 327 aa  61.6  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1571  initiation factor 2B related protein  28.19 
 
 		 283 aa  60.5  0.00000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL06080  eukaryotic translation initiation factor 2B, subunit 2, putative  26.4 
 
 		 453 aa  59.7  0.0000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.261461  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1938  translation initiation factor IF-2B subunit delta  28.43 
 
 		 321 aa  58.9  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0385  initiation factor 2B related  24.81 
 
 		 319 aa  57.8  0.0000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.14036  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2432  translation initiation factor IF-2B subunit delta  23.41 
 
 		 320 aa  57.4  0.0000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0921  translation initiation factor, aIF-2BI family  24.5 
 
 		 342 aa  57  0.0000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2704  initiation factor 2B related  24.88 
 
 		 312 aa  56.6  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10674  predicted protein  24.29 
 
 		 290 aa  56.6  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.337525  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3347  initiation factor 2B related protein  27.03 
 
 		 283 aa  56.6  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.151547  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2012  initiation factor 2B related  23.68 
 
 		 310 aa  55.8  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_61090  translation initiation factor eIF-2B alpha subunit (GCN3)  22.92 
 
 		 311 aa  53.9  0.000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.571907 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0793  translation initiation factor IF-2B subunit delta  24.66 
 
 		 307 aa  53.1  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.618819 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0257  translation initiation factor IF-2B subunit delta  22.65 
 
 		 318 aa  52.8  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.374492  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00167  translation initiation factor eIF-2B alpha subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G11340)  24.14 
 
 		 352 aa  51.2  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0246  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized proteins  22.89 
 
 		 345 aa  50.8  0.00006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21290  predicted protein  26.9 
 
 		 385 aa  50.8  0.00006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0888  translation initiation factor, aIF-2BI family  23.08 
 
 		 343 aa  50.4  0.00007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.332412  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3300  translation initiation factor, aIF-2BI family  22.11 
 
 		 342 aa  49.7  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3447  translation initiation factor, aIF-2BI family  22.68 
 
 		 342 aa  49.7  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.653614  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0846  methylthioribose-1-phosphate isomerase  23.22 
 
 		 356 aa  48.9  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3027  initiation factor 2B related  21.57 
 
 		 320 aa  49.3  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.390862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2147  initiation factor 2B related  27.21 
 
 		 309 aa  48.5  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000266151  hitchhiker  0.00589649 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6765  translation initiation factor, aIF-2BI family  24.39 
 
 		 369 aa  48.1  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1992  translation initiation factor 2B subunit I  20.95 
 
 		 348 aa  48.1  0.0004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.337411 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0945  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  21.76 
 
 		 342 aa  47.8  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_23811  predicted protein  22.58 
 
 		 817 aa  46.6  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3765  translation initiation factor, aIF-2BI family  20.64 
 
 		 345 aa  46.6  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0692423  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0016  aIF-2BI family translation initiation factor  20.87 
 
 		 343 aa  45.4  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.339634  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3179  eIF-2B alpha/beta/delta family protein  23.4 
 
 		 346 aa  46.2  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0016  aIF-2BI family translation initiation factor  20.87 
 
 		 343 aa  45.4  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.570831  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3749  putative translation initiation factor, aIF-2BI/5-methylthioribose-1-phosphate isomerase  20.77 
 
 		 354 aa  45.4  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2314  translation initiation factor IF-2B subunit delta  21.78 
 
 		 318 aa  45.8  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3318  aIF-2BI family translation initiation factor  23.4 
 
 		 346 aa  46.2  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3328  eIF-2B alpha/beta/delta family protein  23.4 
 
 		 346 aa  46.2  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3517  translation initiation factor, aIF-2BI family  23.08 
 
 		 338 aa  45.8  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.574995  normal  0.0784956 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2613  translation initiation factor, aIF-2BI family  21.74 
 
 		 349 aa  45.1  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0169  aIF-2BI family translation initiation factor  20.29 
 
 		 345 aa  44.7  0.004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00178496 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2276  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  25.19 
 
 		 348 aa  44.7  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0419  translation initiation factor 2B subunit I family (IF-2BI)  23.89 
 
 		 347 aa  44.3  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.04546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2269  translation initiation factor 2B subunit I  21.41 
 
 		 349 aa  44.3  0.006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1741  methylthioribose-1-phosphate isomerase  20.41 
 
 		 355 aa  43.5  0.008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0595  translation initiation factor, aIF-2BI family  23.24 
 
 		 328 aa  43.5  0.008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1140  translation initiation factor 2B subunit I  22.93 
 
 		 342 aa  43.5  0.008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2064  aIF-2BI family translation initiation factor  25.81 
 
 		 346 aa  43.5  0.008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000777983  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0403  translation initiation factor 2B subunit I  26.85 
 
 		 344 aa  43.5  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1099  methylthioribose-1-phosphate isomerase  20.75 
 
 		 353 aa  43.1  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.767768 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>