54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNL06080 on replicon NC_006681
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006681  CNL06080  eukaryotic translation initiation factor 2B, subunit 2, putative  100 
 
 		 453 aa  928    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.261461  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01344  translation regulator GCD7 (AFU_orthologue; AFUA_1G09450)  32.67 
 
 		 433 aa  210  5e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.528894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21290  predicted protein  46.05 
 
 		 385 aa  196  8.000000000000001e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59263  translation initiation factor eIF2b  35.62 
 
 		 359 aa  146  6e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_5458  predicted protein  35.29 
 
 		 301 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0354619  decreased coverage  0.00000724978 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1262  translation initiation factor IF-2B subunit delta  30.41 
 
 		 302 aa  89.7  8e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.156828  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0793  translation initiation factor IF-2B subunit delta  31.37 
 
 		 307 aa  87.8  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.618819 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2269  translation initiation factor IF-2B subunit delta  26.13 
 
 		 323 aa  87  6e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0752053 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1938  translation initiation factor IF-2B subunit delta  28.7 
 
 		 321 aa  87  7e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2314  translation initiation factor IF-2B subunit delta  29.1 
 
 		 318 aa  80.1  0.00000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_14255  predicted protein  23.74 
 
 		 326 aa  79.7  0.00000000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2966  translation initiation factor, aIF-2BII family  24.28 
 
 		 351 aa  78.6  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00871533  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0384  translation initiation factor IF-2B subunit delta  28.8 
 
 		 331 aa  77.4  0.0000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.111584  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10674  predicted protein  28.14 
 
 		 290 aa  77.4  0.0000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.337525  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0331  translation initiation factor, aIF-2BII family  26.01 
 
 		 309 aa  77.4  0.0000000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2762  translation initiation factor IF-2B subunit delta  25.6 
 
 		 331 aa  76.6  0.0000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00225031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0571  translation initiation factor, aIF-2BII family  23.68 
 
 		 327 aa  73.6  0.000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01390  hypothetical protein  28.94 
 
 		 472 aa  72.8  0.00000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_61090  translation initiation factor eIF-2B alpha subunit (GCN3)  34.45 
 
 		 311 aa  70.5  0.00000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.571907 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01730  hypothetical protein  32.56 
 
 		 386 aa  70.1  0.00000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.199105  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2067  translation initiation factor IF-2B subunit delta  26.32 
 
 		 309 aa  68.2  0.0000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0074  initiation factor 2B related  28.26 
 
 		 292 aa  67.8  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0385  initiation factor 2B related  25.37 
 
 		 319 aa  67.8  0.0000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.14036  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33562  predicted protein  26.4 
 
 		 505 aa  67.4  0.0000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.884137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0557  translation initiation factor IF-2B subunit delta  26.32 
 
 		 319 aa  67  0.0000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0282254 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2432  translation initiation factor IF-2B subunit delta  24.65 
 
 		 320 aa  66.6  0.0000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42770  predicted protein  26.27 
 
 		 489 aa  65.9  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00451975  normal  0.119284 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0257  translation initiation factor IF-2B subunit delta  26.29 
 
 		 318 aa  64.7  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.374492  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06864  translation initiation factor eif-2b delta subunit (AFU_orthologue; AFUA_5G13040)  24.05 
 
 		 539 aa  63.9  0.000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0293863 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00167  translation initiation factor eIF-2B alpha subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G11340)  25.78 
 
 		 352 aa  61.2  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1571  initiation factor 2B related protein  28.14 
 
 		 283 aa  60.5  0.00000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2012  initiation factor 2B related  26.15 
 
 		 310 aa  60.1  0.00000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2704  initiation factor 2B related  34.48 
 
 		 312 aa  59.3  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3347  initiation factor 2B related protein  27.18 
 
 		 283 aa  58.9  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.151547  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3027  initiation factor 2B related  30.61 
 
 		 320 aa  57  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.390862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2477  initiation factor 2B related  27.23 
 
 		 288 aa  56.6  0.0000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.385124  normal  0.789729 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0673  translation initiation factor IF-2B subunit delta  22.73 
 
 		 313 aa  56.6  0.000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2147  initiation factor 2B related  27.51 
 
 		 309 aa  55.1  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000266151  hitchhiker  0.00589649 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1491  translation initiation factor, aIF-2BI family  27.18 
 
 		 353 aa  53.1  0.000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.626941  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0775  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  25.68 
 
 		 357 aa  52.4  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.369946  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1178  initiation factor 2B related  28.36 
 
 		 216 aa  51.6  0.00003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2293  initiation factor 2B alpha/beta/delta  30.69 
 
 		 348 aa  49.7  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3292  methylthioribose-1-phosphate isomerase  29.82 
 
 		 356 aa  47.4  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.178535  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0027  aIF-2BI family translation initiation factor  30.34 
 
 		 337 aa  47  0.0006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0913  translation initiation factor 2B subunit I  27.36 
 
 		 346 aa  47.4  0.0006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.659043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1881  aIF-2BI family translation initiation factor  24.43 
 
 		 345 aa  47  0.0007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0169  aIF-2BI family translation initiation factor  27.95 
 
 		 345 aa  45.4  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00178496 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2170  aIF-2BI family translation initiation factor  31.71 
 
 		 344 aa  45.1  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2269  translation initiation factor 2B subunit I  24.89 
 
 		 349 aa  44.7  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0964  translation initiation factor, aIF-2BI family  29.57 
 
 		 351 aa  44.3  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.518904  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1576  initiation factor 2B related protein  26.92 
 
 		 467 aa  43.9  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.649962  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1186  translation initiation factor, aIF-2BI family  28.09 
 
 		 345 aa  43.5  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000144196  normal  0.031954 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3948  methylthioribose-1-phosphate isomerase  25.25 
 
 		 358 aa  43.5  0.008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0029579  normal  0.0349514 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1357  methylthioribose-1-phosphate isomerase  25.76 
 
 		 358 aa  43.1  0.01  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.759333 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>