109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1178 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1178  initiation factor 2B related  100 
 
 		 216 aa  432  1e-120  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1332  initiation factor 2B related  39.3 
 
 		 234 aa  115  5e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0126468  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1354  initiation factor 2B related  41.3 
 
 		 234 aa  112  5e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000372175  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2012  initiation factor 2B related  29.41 
 
 		 310 aa  69.7  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1262  translation initiation factor IF-2B subunit delta  27.27 
 
 		 302 aa  58.5  0.00000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.156828  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_61090  translation initiation factor eIF-2B alpha subunit (GCN3)  25.49 
 
 		 311 aa  57  0.0000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.571907 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3027  initiation factor 2B related  23.91 
 
 		 320 aa  56.6  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.390862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0673  translation initiation factor IF-2B subunit delta  31.53 
 
 		 313 aa  56.6  0.0000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01730  hypothetical protein  28.91 
 
 		 386 aa  55.8  0.0000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.199105  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2147  initiation factor 2B related  25 
 
 		 309 aa  56.2  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000266151  hitchhiker  0.00589649 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0793  translation initiation factor IF-2B subunit delta  33.33 
 
 		 307 aa  55.8  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.618819 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0074  initiation factor 2B related  26.9 
 
 		 292 aa  55.8  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1398  initiation factor 2B related  28.57 
 
 		 414 aa  55.1  0.0000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2966  translation initiation factor, aIF-2BII family  34.44 
 
 		 351 aa  53.9  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00871533  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1951  initiation factor 2B related  24.82 
 
 		 259 aa  53.9  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2269  translation initiation factor IF-2B subunit delta  24.65 
 
 		 323 aa  52.8  0.000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0752053 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10674  predicted protein  30.08 
 
 		 290 aa  52.4  0.000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.337525  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0964  translation initiation factor, aIF-2BI family  29.61 
 
 		 351 aa  52  0.000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.518904  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2314  translation initiation factor IF-2B subunit delta  27.52 
 
 		 318 aa  51.2  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1938  translation initiation factor IF-2B subunit delta  31.36 
 
 		 321 aa  51.2  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0779  S-methyl-5-thioribose-1-phosphate isomerase  26.18 
 
 		 346 aa  50.8  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.404257  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2613  translation initiation factor, aIF-2BI family  26.46 
 
 		 349 aa  50.4  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3861  methylthioribose-1-phosphate isomerase  34.62 
 
 		 349 aa  50.8  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.583783  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1099  methylthioribose-1-phosphate isomerase  31.54 
 
 		 353 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.767768 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0978  translation initiation factor 2B subunit I  32.29 
 
 		 338 aa  50.1  0.00003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0893546  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4098  methylthioribose-1-phosphate isomerase  25.93 
 
 		 351 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.463174  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0927  aIF-2BI family translation initiation factor  37.11 
 
 		 323 aa  48.9  0.00005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4139  methylthioribose-1-phosphate isomerase  30.77 
 
 		 353 aa  49.3  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.196624  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0331  translation initiation factor, aIF-2BII family  27.64 
 
 		 309 aa  48.9  0.00006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1052  aIF-2BI family translation initiation factor  35 
 
 		 321 aa  48.9  0.00006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0571  translation initiation factor, aIF-2BII family  30.68 
 
 		 327 aa  48.5  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0365  translation initiation factor IF-2B subunit alpha  47.17 
 
 		 339 aa  48.5  0.00008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1694  aIF-2BI family translation initiation factor  30.69 
 
 		 353 aa  48.5  0.00008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2762  translation initiation factor IF-2B subunit delta  30 
 
 		 331 aa  48.5  0.00008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00225031  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00167  translation initiation factor eIF-2B alpha subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G11340)  24.5 
 
 		 352 aa  48.1  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1041  translation initiation factor IF-2B subunit alpha  26.39 
 
 		 362 aa  47.8  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0557  translation initiation factor IF-2B subunit delta  30.85 
 
 		 319 aa  47.8  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0282254 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1791  translation initiation factor 2B subunit I  53.33 
 
 		 321 aa  47.8  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0865  aIF-2BI family translation initiation factor  53.33 
 
 		 321 aa  47.8  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0114166 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0257  translation initiation factor IF-2B subunit delta  25.77 
 
 		 318 aa  48.1  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.374492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1140  translation initiation factor 2B subunit I  41.27 
 
 		 342 aa  47  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4159  methylthioribose-1-phosphate isomerase  25.1 
 
 		 351 aa  47  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.109098  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3789  methylthioribose-1-phosphate isomerase  30 
 
 		 351 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.700016  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1944  translation initiation factor 2B subunit I  31 
 
 		 352 aa  46.6  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00466755  normal  0.570212 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0929  translation initiation factor, aIF-2BI family  53.33 
 
 		 344 aa  46.6  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.119435  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3942  methylthioribose-1-phosphate isomerase  30 
 
 		 351 aa  46.2  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4251  methylthioribose-1-phosphate isomerase  30 
 
 		 351 aa  46.2  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2067  translation initiation factor IF-2B subunit delta  24.83 
 
 		 309 aa  46.2  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0945  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  48.89 
 
 		 342 aa  46.2  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3560  translation initiation factor, aIF-2BI family  31.36 
 
 		 357 aa  46.2  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3774  methylthioribose-1-phosphate isomerase  40.26 
 
 		 351 aa  45.8  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0385  initiation factor 2B related  28.75 
 
 		 319 aa  45.8  0.0005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.14036  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3179  eIF-2B alpha/beta/delta family protein  46.67 
 
 		 346 aa  45.8  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3328  eIF-2B alpha/beta/delta family protein  46.67 
 
 		 346 aa  45.8  0.0005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3318  aIF-2BI family translation initiation factor  46.67 
 
 		 346 aa  45.8  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1381  translation initiation factor, aIF-2BI family  29.31 
 
 		 362 aa  45.8  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.705402  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4053  methylthioribose-1-phosphate isomerase  40.26 
 
 		 351 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2170  aIF-2BI family translation initiation factor  31.9 
 
 		 344 aa  45.4  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0246  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized proteins  25.71 
 
 		 345 aa  45.4  0.0006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1015  translation initiation factor, aIF-2BI family  31.25 
 
 		 350 aa  45.4  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.253315  unclonable  0.0000000000388932 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0893  translation initiation factor, putative, aIF-2BI family  31.25 
 
 		 350 aa  45.4  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.592347  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0810  aIF-2BI family translation initiation factor  33.33 
 
 		 349 aa  45.4  0.0007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3544  methylthioribose-1-phosphate isomerase  31.62 
 
 		 347 aa  45.1  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3447  translation initiation factor, aIF-2BI family  46.67 
 
 		 342 aa  45.1  0.0008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.653614  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0027  aIF-2BI family translation initiation factor  48.89 
 
 		 337 aa  45.1  0.0009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3300  translation initiation factor, aIF-2BI family  46.67 
 
 		 342 aa  45.1  0.0009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0485  aIF-2BI family translation initiation factor  40.98 
 
 		 353 aa  44.7  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.646058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2704  initiation factor 2B related  32.41 
 
 		 312 aa  44.7  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1036  translation initiation factor, aIF-2BI family  53.49 
 
 		 347 aa  44.7  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.313313  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0921  translation initiation factor, aIF-2BI family  48.89 
 
 		 342 aa  44.3  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1400  translation initiation factor, aIF-2BI family  29.03 
 
 		 354 aa  44.7  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0211329  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06080  eukaryotic translation initiation factor 2B, subunit 2, putative  28.36 
 
 		 453 aa  43.5  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.261461  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3749  putative translation initiation factor, aIF-2BI/5-methylthioribose-1-phosphate isomerase  28.21 
 
 		 354 aa  44.3  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0621  translation initiation factor 2B subunit I  31.78 
 
 		 342 aa  43.5  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0997628  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4687  methylthioribose-1-phosphate isomerase  36.59 
 
 		 350 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2541  translation initiation factor, aIF-2BI family  27.55 
 
 		 350 aa  43.5  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0888  translation initiation factor, aIF-2BI family  46.67 
 
 		 343 aa  43.9  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.332412  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1646  translation initiation factor, aIF-2BI family  43.4 
 
 		 340 aa  44.3  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1491  translation initiation factor, aIF-2BI family  31.36 
 
 		 353 aa  44.3  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.626941  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2064  aIF-2BI family translation initiation factor  26.97 
 
 		 346 aa  43.1  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000777983  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0156  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  42.62 
 
 		 354 aa  43.1  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0327  methylthioribose-1-phosphate isomerase  31.63 
 
 		 348 aa  43.5  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0648  aIF-2BI family translation initiation factor  33.67 
 
 		 348 aa  43.5  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674044  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4924  methylthioribose-1-phosphate isomerase  31.63 
 
 		 348 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.64519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2173  translation initiation factor IF-2B subunit alpha  26.32 
 
 		 366 aa  42.7  0.004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1840  aIF-2BI family translation initiation factor  35.21 
 
 		 348 aa  42.7  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.635739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0623  putative translation initiation factor, aIF-2BI/5-methylthioribose-1-phosphate isomerase  28.19 
 
 		 354 aa  42.4  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.242304  normal  0.23951 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2731  methylthioribose-1-phosphate isomerase  27.75 
 
 		 349 aa  42.4  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0228866  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4334  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  50 
 
 		 337 aa  42.7  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0676  translation initiation factor, aIF-2BI family  44.44 
 
 		 339 aa  42.4  0.005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0103604  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3765  translation initiation factor, aIF-2BI family  46.15 
 
 		 345 aa  42.4  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0692423  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0491  translation initiation factor 2B subunit I  44.68 
 
 		 337 aa  42.4  0.006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.23967 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2118  translation initiation factor IF-2B subunit alpha  45.45 
 
 		 339 aa  42.4  0.006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4322  aIF-2BI family translation initiation factor  29.46 
 
 		 346 aa  42.4  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.394096  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4186  translation initiation factor 2B subunit I  47.62 
 
 		 339 aa  42  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3564  initiation factor 2B related protein  26.09 
 
 		 505 aa  42  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4317  translation initiation factor, aIF-2BI family  47.62 
 
 		 339 aa  42  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4339  translation initiation factor, aIF-2BI family  47.62 
 
 		 339 aa  42  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1360  translation initiation factor, aIF-2BI family  48.08 
 
 		 342 aa  42  0.007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0559648  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0316  methylthioribose-1-phosphate isomerase  44.26 
 
 		 348 aa  41.6  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>