237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1398 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_1398  initiation factor 2B related  100 
 
 
414 aa  803    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3564  initiation factor 2B related protein  44.83 
 
 
505 aa  323  4e-87  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1576  initiation factor 2B related protein  45.43 
 
 
467 aa  284  2.0000000000000002e-75  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.649962  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1290  NUDIX domain-containing protein  41.27 
 
 
138 aa  95.9  1e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1073  NUDIX hydrolase domain protein  40.48 
 
 
137 aa  94.7  2e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.467829  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2704  initiation factor 2B related  27.68 
 
 
312 aa  89.4  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2269  translation initiation factor IF-2B subunit delta  31.62 
 
 
323 aa  88.2  2e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0752053 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2762  translation initiation factor IF-2B subunit delta  34.9 
 
 
331 aa  88.6  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00225031  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0385  initiation factor 2B related  37.19 
 
 
319 aa  87.4  4e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.14036  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0331  translation initiation factor, aIF-2BII family  33.05 
 
 
309 aa  86.7  8e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0673  translation initiation factor IF-2B subunit delta  28.89 
 
 
313 aa  85.1  0.000000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3027  initiation factor 2B related  32.14 
 
 
320 aa  85.5  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.390862  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1101  NUDIX hydrolase  39.52 
 
 
136 aa  85.1  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3347  initiation factor 2B related protein  33.8 
 
 
283 aa  84.7  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.151547  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02410  translation initiation factor eIF-2B subunit family protein (AFU_orthologue; AFUA_2G14290)  25.54 
 
 
548 aa  83.2  0.000000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.347502 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6765  translation initiation factor, aIF-2BI family  38.61 
 
 
369 aa  81.3  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0793  translation initiation factor IF-2B subunit delta  29.87 
 
 
307 aa  80.9  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.618819 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1262  translation initiation factor IF-2B subunit delta  33.85 
 
 
302 aa  80.1  0.00000000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.156828  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0571  translation initiation factor, aIF-2BII family  33.21 
 
 
327 aa  79.3  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2147  initiation factor 2B related  30.28 
 
 
309 aa  78.6  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000266151  hitchhiker  0.00589649 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0074  initiation factor 2B related  31.72 
 
 
292 aa  78.2  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0775  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  28.28 
 
 
357 aa  77.8  0.0000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.369946  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2012  initiation factor 2B related  29.25 
 
 
310 aa  77.8  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1571  initiation factor 2B related protein  31.41 
 
 
283 aa  78.2  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2966  translation initiation factor, aIF-2BII family  31.93 
 
 
351 aa  77.4  0.0000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00871533  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1938  translation initiation factor IF-2B subunit delta  30.83 
 
 
321 aa  77  0.0000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2064  aIF-2BI family translation initiation factor  26.37 
 
 
346 aa  77  0.0000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000777983  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2043  methylthioribose-1-phosphate isomerase  38.27 
 
 
354 aa  76.3  0.0000000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2124  methylthioribose-1-phosphate isomerase  37.65 
 
 
354 aa  75.5  0.000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.369854  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1041  translation initiation factor IF-2B subunit alpha  26.67 
 
 
362 aa  74.7  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2717  methylthioribose-1-phosphate isomerase  26.42 
 
 
349 aa  73.9  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.143544  normal  0.136837 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3396  methylthioribose-1-phosphate isomerase  26.42 
 
 
349 aa  73.9  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1840  aIF-2BI family translation initiation factor  32.3 
 
 
348 aa  73.6  0.000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.635739  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0846  methylthioribose-1-phosphate isomerase  32.42 
 
 
356 aa  73.6  0.000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0544  NUDIX hydrolase  32.54 
 
 
134 aa  73.6  0.000000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.788518 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2078  methylthioribose-1-phosphate isomerase  27.99 
 
 
353 aa  73.2  0.000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.424406 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1491  translation initiation factor, aIF-2BI family  38.46 
 
 
353 aa  72.8  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.626941  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0770  translation initiation factor, aIF-2BI family  31.54 
 
 
366 aa  72  0.00000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.301181  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1186  translation initiation factor, aIF-2BI family  27.06 
 
 
345 aa  71.6  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000144196  normal  0.031954 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1694  aIF-2BI family translation initiation factor  37.65 
 
 
353 aa  72  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3816  methylthioribose-1-phosphate isomerase  29 
 
 
350 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.732544 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2432  translation initiation factor IF-2B subunit delta  28.52 
 
 
320 aa  72  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2613  translation initiation factor, aIF-2BI family  26.09 
 
 
349 aa  71.2  0.00000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1519  aIF-2BI family translation initiation factor  28.3 
 
 
350 aa  71.2  0.00000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.889993  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0254  aIF-2BI family translation initiation factor  31.29 
 
 
346 aa  71.2  0.00000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0396  translation initiation factor IF-2B subunit alpha  32.89 
 
 
370 aa  71.2  0.00000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.359627  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1667  methylthioribose-1-phosphate isomerase  24.51 
 
 
352 aa  70.9  0.00000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000944772  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3544  methylthioribose-1-phosphate isomerase  26.12 
 
 
347 aa  70.1  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1643  translation initiation factor  26.12 
 
 
344 aa  69.7  0.00000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.226672  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1971  translation initiation factor, aIF-2BI family  29.86 
 
 
345 aa  69.7  0.00000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00568517  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4098  methylthioribose-1-phosphate isomerase  38.52 
 
 
351 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.463174  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2579  methylthioribose-1-phosphate isomerase  36.05 
 
 
354 aa  69.3  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2477  initiation factor 2B related  31.94 
 
 
288 aa  69.3  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.385124  normal  0.789729 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1741  methylthioribose-1-phosphate isomerase  30.77 
 
 
355 aa  69.3  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2173  translation initiation factor IF-2B subunit alpha  31.33 
 
 
366 aa  69.3  0.0000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2731  methylthioribose-1-phosphate isomerase  29.38 
 
 
349 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0228866  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3789  methylthioribose-1-phosphate isomerase  38.52 
 
 
351 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.700016  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4159  methylthioribose-1-phosphate isomerase  38.52 
 
 
351 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.109098  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0557  translation initiation factor IF-2B subunit delta  26.71 
 
 
319 aa  68.9  0.0000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0282254 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1373  methylthioribose-1-phosphate isomerase  29.63 
 
 
358 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0008  translation initiation factor IF-2B subunit alpha  31.58 
 
 
351 aa  68.6  0.0000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.679741  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2279  initiation factor 2B related  28.39 
 
 
312 aa  68.6  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.14439  normal  0.124168 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3948  methylthioribose-1-phosphate isomerase  34.5 
 
 
358 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0029579  normal  0.0349514 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4334  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  31.17 
 
 
337 aa  68.2  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1357  methylthioribose-1-phosphate isomerase  30.56 
 
 
358 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.759333 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1960  methylthioribose-1-phosphate isomerase  32.06 
 
 
358 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4053  methylthioribose-1-phosphate isomerase  37.7 
 
 
351 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23250  methylthioribose-1-phosphate isomerase  32.06 
 
 
358 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0078361 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3942  methylthioribose-1-phosphate isomerase  37.7 
 
 
351 aa  67  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3774  methylthioribose-1-phosphate isomerase  37.7 
 
 
351 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4251  methylthioribose-1-phosphate isomerase  37.7 
 
 
351 aa  67  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0623  putative translation initiation factor, aIF-2BI/5-methylthioribose-1-phosphate isomerase  28.41 
 
 
354 aa  67.4  0.0000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.242304  normal  0.23951 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0403  translation initiation factor 2B subunit I  30.22 
 
 
344 aa  67.4  0.0000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1400  translation initiation factor, aIF-2BI family  34.1 
 
 
354 aa  67  0.0000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0211329  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1773  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  25.63 
 
 
343 aa  67  0.0000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3861  methylthioribose-1-phosphate isomerase  38.52 
 
 
349 aa  66.6  0.0000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.583783  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0929  translation initiation factor, aIF-2BI family  28.24 
 
 
344 aa  66.6  0.0000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.119435  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00735  methylthioribose-1-phosphate isomerase  35.1 
 
 
354 aa  66.6  0.0000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.214802  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0485  aIF-2BI family translation initiation factor  32.57 
 
 
353 aa  66.2  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.646058  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0648  aIF-2BI family translation initiation factor  29.41 
 
 
348 aa  66.2  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674044  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4869  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  28.12 
 
 
359 aa  65.9  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0005  translation initiation factor IF-2B subunit alpha  30.46 
 
 
365 aa  65.9  0.000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4687  methylthioribose-1-phosphate isomerase  26.28 
 
 
350 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1744  initiation factor 2 subunit family  34.5 
 
 
358 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0441  methylthioribose-1-phosphate isomerase  33.33 
 
 
348 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2170  aIF-2BI family translation initiation factor  34.12 
 
 
344 aa  65.5  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3560  translation initiation factor, aIF-2BI family  30.98 
 
 
357 aa  65.1  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0169  aIF-2BI family translation initiation factor  32.21 
 
 
345 aa  65.5  0.000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00178496 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2349  aIF-2BI family translation initiation factor  32.28 
 
 
358 aa  65.5  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.944221  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4317  translation initiation factor, aIF-2BI family  35.58 
 
 
339 aa  65.5  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4139  methylthioribose-1-phosphate isomerase  36.07 
 
 
353 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.196624  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0156  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  30.08 
 
 
354 aa  64.3  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232234  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4339  translation initiation factor, aIF-2BI family  34.1 
 
 
339 aa  64.7  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4186  translation initiation factor 2B subunit I  34.97 
 
 
339 aa  64.3  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2033  aIF-2BI family translation initiation factor  32.69 
 
 
354 aa  63.9  0.000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0964  translation initiation factor, aIF-2BI family  31.82 
 
 
351 aa  64.3  0.000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.518904  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3648  methylthioribose-1-phosphate isomerase  33.92 
 
 
365 aa  63.9  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.295966  normal  0.479816 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0703  translation initiation factor 2B subunit I  37.4 
 
 
351 aa  63.9  0.000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000787843 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0810  aIF-2BI family translation initiation factor  29.45 
 
 
349 aa  63.5  0.000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18480  putative translation initiation factor, aIF-2BI family  27.67 
 
 
355 aa  63.5  0.000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0224403  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>