246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_1576 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_1576  initiation factor 2B related protein  100 
 
 
467 aa  902    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.649962  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3564  initiation factor 2B related protein  64.92 
 
 
505 aa  552  1e-156  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1398  initiation factor 2B related  45.43 
 
 
414 aa  307  3e-82  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02410  translation initiation factor eIF-2B subunit family protein (AFU_orthologue; AFUA_2G14290)  27.24 
 
 
548 aa  114  5e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.347502 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23250  methylthioribose-1-phosphate isomerase  30.05 
 
 
358 aa  101  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0078361 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1357  methylthioribose-1-phosphate isomerase  40.36 
 
 
358 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.759333 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3948  methylthioribose-1-phosphate isomerase  40.36 
 
 
358 aa  96.7  9e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0029579  normal  0.0349514 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1960  methylthioribose-1-phosphate isomerase  29.78 
 
 
358 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15800  methylthioribose-1-phosphate isomerase  38.2 
 
 
358 aa  95.1  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3648  methylthioribose-1-phosphate isomerase  38.76 
 
 
365 aa  94.7  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.295966  normal  0.479816 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1766  methylthioribose-1-phosphate isomerase  38.55 
 
 
358 aa  94  5e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.3152  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1373  methylthioribose-1-phosphate isomerase  37.08 
 
 
358 aa  94  5e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1290  NUDIX domain-containing protein  38.52 
 
 
138 aa  94  6e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1744  initiation factor 2 subunit family  38.2 
 
 
358 aa  93.6  6e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3396  methylthioribose-1-phosphate isomerase  28.93 
 
 
349 aa  91.7  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4079  methylthioribose-1-phosphate isomerase  34.76 
 
 
358 aa  91.7  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.256868 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2717  methylthioribose-1-phosphate isomerase  28.93 
 
 
349 aa  91.7  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.143544  normal  0.136837 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1847  methylthioribose-1-phosphate isomerase  38.76 
 
 
358 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0721435  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2064  aIF-2BI family translation initiation factor  28.52 
 
 
346 aa  91.3  4e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000777983  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3544  methylthioribose-1-phosphate isomerase  33.02 
 
 
347 aa  89  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1360  translation initiation factor, aIF-2BI family  31.82 
 
 
342 aa  89  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0559648  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3517  translation initiation factor, aIF-2BI family  33.82 
 
 
338 aa  89  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.574995  normal  0.0784956 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0331  translation initiation factor, aIF-2BII family  32.08 
 
 
309 aa  89  2e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1073  NUDIX hydrolase domain protein  36.3 
 
 
137 aa  88.6  2e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.467829  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2276  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  35.02 
 
 
348 aa  87.8  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1643  translation initiation factor  36.31 
 
 
344 aa  87.8  4e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.226672  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2579  methylthioribose-1-phosphate isomerase  33.22 
 
 
354 aa  87.8  4e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0984  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  38.54 
 
 
343 aa  87  6e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2269  translation initiation factor 2B subunit I  28.78 
 
 
349 aa  87  7e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1101  NUDIX hydrolase  37.69 
 
 
136 aa  86.7  8e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0503  translation initiation factor, aIF-2BI family  33.83 
 
 
350 aa  86.7  9e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1491  translation initiation factor, aIF-2BI family  39.39 
 
 
353 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.626941  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2078  methylthioribose-1-phosphate isomerase  34.12 
 
 
353 aa  84.7  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.424406 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0385  initiation factor 2B related  33.33 
 
 
319 aa  84.7  0.000000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.14036  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4687  methylthioribose-1-phosphate isomerase  34.52 
 
 
350 aa  84.7  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2704  initiation factor 2B related  28.06 
 
 
312 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2349  aIF-2BI family translation initiation factor  35.63 
 
 
358 aa  84.7  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.944221  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2731  methylthioribose-1-phosphate isomerase  34.43 
 
 
349 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0228866  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1992  translation initiation factor 2B subunit I  32.36 
 
 
348 aa  84  0.000000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.337411 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1694  aIF-2BI family translation initiation factor  36.21 
 
 
353 aa  83.6  0.000000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0394  methylthioribose-1-phosphate isomerase  34.94 
 
 
348 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0929  translation initiation factor, aIF-2BI family  29.61 
 
 
344 aa  83.2  0.00000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.119435  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2269  translation initiation factor IF-2B subunit delta  33.2 
 
 
323 aa  82.4  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0752053 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2043  methylthioribose-1-phosphate isomerase  32.71 
 
 
354 aa  82.8  0.00000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1840  aIF-2BI family translation initiation factor  33.73 
 
 
348 aa  82  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.635739  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2762  translation initiation factor IF-2B subunit delta  35.53 
 
 
331 aa  81.6  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00225031  normal 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_14255  predicted protein  33.33 
 
 
326 aa  82  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00735  methylthioribose-1-phosphate isomerase  36.84 
 
 
354 aa  82  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.214802  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2613  translation initiation factor, aIF-2BI family  31.43 
 
 
349 aa  81.6  0.00000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2314  translation initiation factor IF-2B subunit delta  30.68 
 
 
318 aa  81.3  0.00000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3749  putative translation initiation factor, aIF-2BI/5-methylthioribose-1-phosphate isomerase  33.33 
 
 
354 aa  81.3  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3347  initiation factor 2B related protein  34.12 
 
 
283 aa  81.6  0.00000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.151547  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0621  translation initiation factor 2B subunit I  33.73 
 
 
342 aa  81.3  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0997628  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1186  translation initiation factor, aIF-2BI family  30.96 
 
 
345 aa  81.6  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000144196  normal  0.031954 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0491  translation initiation factor 2B subunit I  33.07 
 
 
337 aa  81.3  0.00000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.23967 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1036  translation initiation factor, aIF-2BI family  32.61 
 
 
347 aa  80.9  0.00000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.313313  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0676  translation initiation factor, aIF-2BI family  28.52 
 
 
339 aa  81.3  0.00000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0103604  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2966  translation initiation factor, aIF-2BII family  31.35 
 
 
351 aa  81.3  0.00000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00871533  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0964  translation initiation factor, aIF-2BI family  33.52 
 
 
351 aa  80.9  0.00000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.518904  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1400  translation initiation factor, aIF-2BI family  38.12 
 
 
354 aa  80.9  0.00000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0211329  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0571  translation initiation factor, aIF-2BII family  33.58 
 
 
327 aa  80.9  0.00000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0419  translation initiation factor 2B subunit I family (IF-2BI)  28.15 
 
 
347 aa  80.5  0.00000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.04546  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4924  methylthioribose-1-phosphate isomerase  34.34 
 
 
348 aa  80.1  0.00000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.64519  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1881  aIF-2BI family translation initiation factor  33.94 
 
 
345 aa  80.1  0.00000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2124  methylthioribose-1-phosphate isomerase  33.09 
 
 
354 aa  79.7  0.00000000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.369854  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0332  methylthioribose-1-phosphate isomerase  34.34 
 
 
348 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4139  methylthioribose-1-phosphate isomerase  30.73 
 
 
353 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.196624  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0347  methylthioribose-1-phosphate isomerase  34.34 
 
 
347 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0327  methylthioribose-1-phosphate isomerase  34.34 
 
 
348 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2012  initiation factor 2B related  32.8 
 
 
310 aa  79.7  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0379  methylthioribose-1-phosphate isomerase  34.34 
 
 
348 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0518  aIF-2BI family translation initiation factor  33.74 
 
 
334 aa  79  0.0000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.294825  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3774  methylthioribose-1-phosphate isomerase  31.87 
 
 
351 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0319  methylthioribose-1-phosphate isomerase  33.73 
 
 
347 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1099  methylthioribose-1-phosphate isomerase  30 
 
 
353 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.767768 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0893  translation initiation factor, putative, aIF-2BI family  32.93 
 
 
350 aa  79  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.592347  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4186  translation initiation factor 2B subunit I  38.65 
 
 
339 aa  78.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3560  translation initiation factor, aIF-2BI family  36.59 
 
 
357 aa  79  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2235  translation initiation factor, aIF-2BI family  29.21 
 
 
350 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0441  methylthioribose-1-phosphate isomerase  33.73 
 
 
348 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0384  translation initiation factor IF-2B subunit delta  31.4 
 
 
331 aa  79  0.0000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.111584  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0169  aIF-2BI family translation initiation factor  28.62 
 
 
345 aa  78.6  0.0000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00178496 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4053  methylthioribose-1-phosphate isomerase  32.8 
 
 
351 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1015  translation initiation factor, aIF-2BI family  32.93 
 
 
350 aa  79  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.253315  unclonable  0.0000000000388932 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2541  translation initiation factor, aIF-2BI family  30.6 
 
 
350 aa  78.6  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3942  methylthioribose-1-phosphate isomerase  32.04 
 
 
351 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3789  methylthioribose-1-phosphate isomerase  32.04 
 
 
351 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.700016  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0544  NUDIX hydrolase  32.26 
 
 
134 aa  78.2  0.0000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.788518 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4251  methylthioribose-1-phosphate isomerase  32.04 
 
 
351 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_459  methylthioribose-1-phosphate isomerase  34.36 
 
 
332 aa  78.2  0.0000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.14852  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0846  methylthioribose-1-phosphate isomerase  32.97 
 
 
356 aa  78.2  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0999  aIF-2BI family translation initiation factor  31.25 
 
 
327 aa  78.2  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.260098  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1741  methylthioribose-1-phosphate isomerase  35.06 
 
 
355 aa  77.8  0.0000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0016  aIF-2BI family translation initiation factor  31.51 
 
 
343 aa  77.8  0.0000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.570831  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0254  aIF-2BI family translation initiation factor  32.58 
 
 
346 aa  77.8  0.0000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1647  translation initiation factor, aIF-2BI family  32.12 
 
 
329 aa  77.8  0.0000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42770  predicted protein  33.92 
 
 
489 aa  77.8  0.0000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00451975  normal  0.119284 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0016  aIF-2BI family translation initiation factor  31.51 
 
 
343 aa  77.8  0.0000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.339634  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1519  aIF-2BI family translation initiation factor  32.97 
 
 
350 aa  77.8  0.0000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.889993  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1571  initiation factor 2B related protein  34.51 
 
 
283 aa  77.4  0.0000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>