236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_3347 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_3347  initiation factor 2B related protein  100 
 
 
283 aa  570  1.0000000000000001e-162  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.151547  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1571  initiation factor 2B related protein  81.98 
 
 
283 aa  476  1e-133  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2477  initiation factor 2B related  64.06 
 
 
288 aa  352  5e-96  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.385124  normal  0.789729 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2279  initiation factor 2B related  54.84 
 
 
312 aa  303  3.0000000000000004e-81  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.14439  normal  0.124168 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2269  translation initiation factor IF-2B subunit delta  35.25 
 
 
323 aa  124  1e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0752053 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2067  translation initiation factor IF-2B subunit delta  32.64 
 
 
309 aa  122  7e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0557  translation initiation factor IF-2B subunit delta  31.25 
 
 
319 aa  115  8.999999999999998e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0282254 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2432  translation initiation factor IF-2B subunit delta  29.9 
 
 
320 aa  114  1.0000000000000001e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0331  translation initiation factor, aIF-2BII family  34.36 
 
 
309 aa  111  1.0000000000000001e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0793  translation initiation factor IF-2B subunit delta  31.38 
 
 
307 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.618819 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0385  initiation factor 2B related  30.45 
 
 
319 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.14036  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3027  initiation factor 2B related  30.74 
 
 
320 aa  110  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.390862  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1262  translation initiation factor IF-2B subunit delta  31.82 
 
 
302 aa  109  5e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.156828  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0257  translation initiation factor IF-2B subunit delta  33.2 
 
 
318 aa  108  7.000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.374492  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2966  translation initiation factor, aIF-2BII family  32.1 
 
 
351 aa  108  8.000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00871533  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2147  initiation factor 2B related  30.45 
 
 
309 aa  108  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000266151  hitchhiker  0.00589649 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0571  translation initiation factor, aIF-2BII family  32.16 
 
 
327 aa  108  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1938  translation initiation factor IF-2B subunit delta  29.35 
 
 
321 aa  106  5e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2012  initiation factor 2B related  31.6 
 
 
310 aa  104  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0673  translation initiation factor IF-2B subunit delta  27.49 
 
 
313 aa  101  1e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2314  translation initiation factor IF-2B subunit delta  31.03 
 
 
318 aa  100  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2762  translation initiation factor IF-2B subunit delta  32.76 
 
 
331 aa  99.4  6e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00225031  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1041  translation initiation factor IF-2B subunit alpha  31.6 
 
 
362 aa  97.8  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4322  aIF-2BI family translation initiation factor  28.33 
 
 
346 aa  94  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.394096  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1186  translation initiation factor, aIF-2BI family  30.68 
 
 
345 aa  92.8  6e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000144196  normal  0.031954 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0623  putative translation initiation factor, aIF-2BI/5-methylthioribose-1-phosphate isomerase  29.84 
 
 
354 aa  92.4  7e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.242304  normal  0.23951 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0072  translation initiation factor 2B subunit I  28.67 
 
 
346 aa  90.5  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.25912 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2064  aIF-2BI family translation initiation factor  28.02 
 
 
346 aa  88.6  9e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000777983  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3596  translation initiation factor, aIF-2BI family  29 
 
 
346 aa  87.8  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.82629  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0770  translation initiation factor, aIF-2BI family  27.96 
 
 
366 aa  86.7  5e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.301181  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3379  aIF-2BI family translation initiation factor  28.76 
 
 
346 aa  86.3  5e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0074  initiation factor 2B related  29.03 
 
 
292 aa  86.3  5e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0384  translation initiation factor IF-2B subunit delta  27.66 
 
 
331 aa  85.9  7e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.111584  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2704  initiation factor 2B related  25.7 
 
 
312 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1840  aIF-2BI family translation initiation factor  27.24 
 
 
348 aa  84.7  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.635739  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3749  putative translation initiation factor, aIF-2BI/5-methylthioribose-1-phosphate isomerase  28.76 
 
 
354 aa  82.8  0.000000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01730  hypothetical protein  36.64 
 
 
386 aa  82.8  0.000000000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.199105  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1543  translation initiation factor, aIF-2BI family  25.41 
 
 
333 aa  82  0.000000000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0321135  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0510  aIF-2BI family translation initiation factor  26.82 
 
 
346 aa  81.3  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2118  translation initiation factor IF-2B subunit alpha  27.99 
 
 
339 aa  80.1  0.00000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0365  translation initiation factor IF-2B subunit alpha  26.57 
 
 
339 aa  79.7  0.00000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1773  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  26.09 
 
 
343 aa  80.1  0.00000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1360  translation initiation factor, aIF-2BI family  29.44 
 
 
342 aa  79.7  0.00000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0559648  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2276  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  33.2 
 
 
348 aa  79.7  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0016  aIF-2BI family translation initiation factor  27.27 
 
 
343 aa  79.3  0.00000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.570831  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0016  aIF-2BI family translation initiation factor  27.27 
 
 
343 aa  79.3  0.00000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.339634  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1400  translation initiation factor, aIF-2BI family  30.42 
 
 
354 aa  78.6  0.0000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0211329  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1694  aIF-2BI family translation initiation factor  28.11 
 
 
353 aa  78.2  0.0000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2349  aIF-2BI family translation initiation factor  23.49 
 
 
358 aa  77.8  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.944221  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2170  aIF-2BI family translation initiation factor  33.51 
 
 
344 aa  77.8  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0246  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized proteins  28.24 
 
 
345 aa  77.8  0.0000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1992  translation initiation factor 2B subunit I  28.62 
 
 
348 aa  77  0.0000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.337411 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2078  methylthioribose-1-phosphate isomerase  27.14 
 
 
353 aa  77  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.424406 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0621  translation initiation factor 2B subunit I  29 
 
 
342 aa  77.4  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0997628  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4687  methylthioribose-1-phosphate isomerase  26.2 
 
 
350 aa  77  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0169  aIF-2BI family translation initiation factor  25 
 
 
345 aa  76.6  0.0000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00178496 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0027  aIF-2BI family translation initiation factor  25.42 
 
 
337 aa  76.6  0.0000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0929  translation initiation factor, aIF-2BI family  31.42 
 
 
344 aa  76.6  0.0000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.119435  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1519  aIF-2BI family translation initiation factor  32.11 
 
 
350 aa  76.3  0.0000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.889993  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3544  methylthioribose-1-phosphate isomerase  25.74 
 
 
347 aa  76.3  0.0000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1881  aIF-2BI family translation initiation factor  26.22 
 
 
345 aa  76.3  0.0000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2124  methylthioribose-1-phosphate isomerase  29.46 
 
 
354 aa  76.3  0.0000000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.369854  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18480  putative translation initiation factor, aIF-2BI family  27.31 
 
 
355 aa  75.5  0.0000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0224403  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0810  aIF-2BI family translation initiation factor  28.52 
 
 
349 aa  75.5  0.0000000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3753  translation initiation factor, aIF-2BI family  28.04 
 
 
346 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3646  translation initiation factor, aIF-2BI family  28.06 
 
 
346 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2613  translation initiation factor, aIF-2BI family  23.32 
 
 
349 aa  74.7  0.000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3564  initiation factor 2B related protein  33.2 
 
 
505 aa  74.7  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2717  methylthioribose-1-phosphate isomerase  26.72 
 
 
349 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.143544  normal  0.136837 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3396  methylthioribose-1-phosphate isomerase  26.72 
 
 
349 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1491  translation initiation factor, aIF-2BI family  29.27 
 
 
353 aa  73.9  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.626941  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0964  translation initiation factor, aIF-2BI family  32.8 
 
 
351 aa  73.2  0.000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.518904  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1015  translation initiation factor, aIF-2BI family  30.6 
 
 
350 aa  72.8  0.000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.253315  unclonable  0.0000000000388932 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0893  translation initiation factor, putative, aIF-2BI family  30.6 
 
 
350 aa  72.8  0.000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.592347  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2043  methylthioribose-1-phosphate isomerase  32.24 
 
 
354 aa  72.8  0.000000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1647  translation initiation factor, aIF-2BI family  26.3 
 
 
329 aa  72.8  0.000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2173  translation initiation factor IF-2B subunit alpha  24.92 
 
 
366 aa  72.4  0.000000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0775  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  26.8 
 
 
357 aa  71.6  0.00000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.369946  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1398  initiation factor 2B related  32.4 
 
 
414 aa  71.6  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4098  methylthioribose-1-phosphate isomerase  24.27 
 
 
351 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.463174  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10674  predicted protein  27.78 
 
 
290 aa  71.2  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.337525  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1646  translation initiation factor, aIF-2BI family  30.28 
 
 
340 aa  71.2  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1741  methylthioribose-1-phosphate isomerase  30.94 
 
 
355 aa  71.2  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4334  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  27.06 
 
 
337 aa  70.5  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4053  methylthioribose-1-phosphate isomerase  24.27 
 
 
351 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0648  aIF-2BI family translation initiation factor  28.52 
 
 
348 aa  69.7  0.00000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674044  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3774  methylthioribose-1-phosphate isomerase  24.27 
 
 
351 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3789  methylthioribose-1-phosphate isomerase  24.27 
 
 
351 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.700016  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4159  methylthioribose-1-phosphate isomerase  24.27 
 
 
351 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.109098  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_14255  predicted protein  26.16 
 
 
326 aa  69.7  0.00000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0491  translation initiation factor 2B subunit I  27.31 
 
 
337 aa  69.3  0.00000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.23967 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3385  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  32.45 
 
 
357 aa  69.3  0.00000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2269  translation initiation factor 2B subunit I  26 
 
 
349 aa  69.3  0.00000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3942  methylthioribose-1-phosphate isomerase  24.27 
 
 
351 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3335  methylthioribose-1-phosphate isomerase  27.33 
 
 
362 aa  68.6  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000368125 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4251  methylthioribose-1-phosphate isomerase  24.27 
 
 
351 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2541  translation initiation factor, aIF-2BI family  31.84 
 
 
350 aa  68.9  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1643  translation initiation factor  25.08 
 
 
344 aa  68.6  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.226672  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_459  methylthioribose-1-phosphate isomerase  28.51 
 
 
332 aa  68.2  0.0000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.14852  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0254  aIF-2BI family translation initiation factor  30.69 
 
 
346 aa  68.6  0.0000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>