247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0384 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_0384  translation initiation factor IF-2B subunit delta  100 
 
 
331 aa  664    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.111584  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0793  translation initiation factor IF-2B subunit delta  52.48 
 
 
307 aa  291  1e-77  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.618819 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2432  translation initiation factor IF-2B subunit delta  48.4 
 
 
320 aa  285  5e-76  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1938  translation initiation factor IF-2B subunit delta  48.51 
 
 
321 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2067  translation initiation factor IF-2B subunit delta  47.85 
 
 
309 aa  277  2e-73  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0673  translation initiation factor IF-2B subunit delta  48.71 
 
 
313 aa  270  2e-71  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0331  translation initiation factor, aIF-2BII family  49.33 
 
 
309 aa  257  2e-67  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1262  translation initiation factor IF-2B subunit delta  50.17 
 
 
302 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.156828  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2314  translation initiation factor IF-2B subunit delta  48.82 
 
 
318 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0257  translation initiation factor IF-2B subunit delta  47.17 
 
 
318 aa  253  3e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.374492  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0557  translation initiation factor IF-2B subunit delta  45.03 
 
 
319 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0282254 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2762  translation initiation factor IF-2B subunit delta  42.11 
 
 
331 aa  216  2.9999999999999998e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00225031  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2269  translation initiation factor IF-2B subunit delta  41.76 
 
 
323 aa  213  3.9999999999999995e-54  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0752053 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0571  translation initiation factor, aIF-2BII family  41.59 
 
 
327 aa  209  4e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2966  translation initiation factor, aIF-2BII family  39.02 
 
 
351 aa  193  4e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00871533  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0254  aIF-2BI family translation initiation factor  38.67 
 
 
346 aa  179  4e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0072  translation initiation factor 2B subunit I  39.4 
 
 
346 aa  172  5.999999999999999e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.25912 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0621  translation initiation factor 2B subunit I  39.14 
 
 
342 aa  172  7.999999999999999e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0997628  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3379  aIF-2BI family translation initiation factor  38.26 
 
 
346 aa  166  5e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0846  methylthioribose-1-phosphate isomerase  37.58 
 
 
356 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6765  translation initiation factor, aIF-2BI family  39.3 
 
 
369 aa  165  1.0000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0419  translation initiation factor 2B subunit I family (IF-2BI)  35.2 
 
 
347 aa  165  1.0000000000000001e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.04546  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2613  translation initiation factor, aIF-2BI family  37.42 
 
 
349 aa  164  2.0000000000000002e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1543  translation initiation factor, aIF-2BI family  38.98 
 
 
333 aa  164  2.0000000000000002e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0321135  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0518  aIF-2BI family translation initiation factor  37.33 
 
 
334 aa  162  5.0000000000000005e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.294825  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_459  methylthioribose-1-phosphate isomerase  37.67 
 
 
332 aa  162  5.0000000000000005e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.14852  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0810  aIF-2BI family translation initiation factor  36.94 
 
 
349 aa  161  1e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0016  aIF-2BI family translation initiation factor  36.75 
 
 
343 aa  160  3e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.570831  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0016  aIF-2BI family translation initiation factor  36.75 
 
 
343 aa  160  3e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.339634  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0494  translation initiation factor 2B subunit I  38.33 
 
 
332 aa  160  4e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.93452  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4322  aIF-2BI family translation initiation factor  36.03 
 
 
346 aa  160  4e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.394096  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0623  putative translation initiation factor, aIF-2BI/5-methylthioribose-1-phosphate isomerase  37.04 
 
 
354 aa  159  5e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.242304  normal  0.23951 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3596  translation initiation factor, aIF-2BI family  37.37 
 
 
346 aa  159  6e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.82629  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0169  aIF-2BI family translation initiation factor  33.99 
 
 
345 aa  157  2e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00178496 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2877  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized proteins  37.12 
 
 
350 aa  157  3e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0191  translation initiation factor, aIF-2BI family  36.71 
 
 
348 aa  156  4e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0246  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized proteins  38.13 
 
 
345 aa  156  4e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0327  methylthioribose-1-phosphate isomerase  35.84 
 
 
348 aa  155  8e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0510  aIF-2BI family translation initiation factor  36.91 
 
 
346 aa  155  9e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3646  translation initiation factor, aIF-2BI family  37.87 
 
 
346 aa  154  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0648  aIF-2BI family translation initiation factor  36.18 
 
 
348 aa  154  2.9999999999999998e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674044  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4687  methylthioribose-1-phosphate isomerase  34.81 
 
 
350 aa  153  4e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0441  methylthioribose-1-phosphate isomerase  34.81 
 
 
348 aa  152  5e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1643  translation initiation factor  36.81 
 
 
344 aa  152  7e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.226672  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2269  translation initiation factor 2B subunit I  35.95 
 
 
349 aa  152  8e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1519  aIF-2BI family translation initiation factor  35.53 
 
 
350 aa  151  2e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.889993  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3753  translation initiation factor, aIF-2BI family  37.21 
 
 
346 aa  151  2e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0676  translation initiation factor, aIF-2BI family  39.53 
 
 
339 aa  150  2e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0103604  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18480  putative translation initiation factor, aIF-2BI family  38.46 
 
 
355 aa  150  3e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0224403  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2312  translation initiation factor, aIF-2BI family  35.81 
 
 
378 aa  149  6e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2064  aIF-2BI family translation initiation factor  33.44 
 
 
346 aa  149  6e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000777983  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0332  methylthioribose-1-phosphate isomerase  34.47 
 
 
348 aa  149  7e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0347  methylthioribose-1-phosphate isomerase  34.47 
 
 
347 aa  149  7e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0379  methylthioribose-1-phosphate isomerase  34.47 
 
 
348 aa  149  7e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1360  translation initiation factor, aIF-2BI family  37.5 
 
 
342 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0559648  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0319  methylthioribose-1-phosphate isomerase  34.13 
 
 
347 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0394  methylthioribose-1-phosphate isomerase  33.67 
 
 
348 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1694  aIF-2BI family translation initiation factor  35.53 
 
 
353 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0865  aIF-2BI family translation initiation factor  36.51 
 
 
321 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0114166 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1052  aIF-2BI family translation initiation factor  37.83 
 
 
321 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4924  methylthioribose-1-phosphate isomerase  35.67 
 
 
348 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.64519  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3544  methylthioribose-1-phosphate isomerase  35.37 
 
 
347 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0027  aIF-2BI family translation initiation factor  35.06 
 
 
337 aa  147  3e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1844  initiation factor 2B alpha/beta/delta  34.78 
 
 
335 aa  147  3e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0316  methylthioribose-1-phosphate isomerase  34.13 
 
 
348 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1186  translation initiation factor, aIF-2BI family  33.33 
 
 
345 aa  146  4.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000144196  normal  0.031954 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1773  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  34.06 
 
 
343 aa  146  4.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0639  aIF-2BI family translation initiation factor  35.18 
 
 
372 aa  146  5e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.249987  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2235  translation initiation factor, aIF-2BI family  36.36 
 
 
350 aa  145  7.0000000000000006e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1791  translation initiation factor 2B subunit I  37.42 
 
 
321 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3765  translation initiation factor, aIF-2BI family  37.54 
 
 
345 aa  145  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0692423  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0385  initiation factor 2B related  35.16 
 
 
319 aa  145  1e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.14036  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1881  aIF-2BI family translation initiation factor  36.07 
 
 
345 aa  144  2e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1099  methylthioribose-1-phosphate isomerase  34.33 
 
 
353 aa  143  5e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.767768 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3749  putative translation initiation factor, aIF-2BI/5-methylthioribose-1-phosphate isomerase  33.22 
 
 
354 aa  142  5e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0929  translation initiation factor, aIF-2BI family  33.9 
 
 
344 aa  142  6e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.119435  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2349  aIF-2BI family translation initiation factor  31.75 
 
 
358 aa  142  7e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.944221  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1992  translation initiation factor 2B subunit I  33.67 
 
 
348 aa  142  8e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.337411 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1175  translation initiation factor 2B subunit I  34 
 
 
354 aa  142  9.999999999999999e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3447  translation initiation factor, aIF-2BI family  32.9 
 
 
342 aa  142  9.999999999999999e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.653614  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4098  methylthioribose-1-phosphate isomerase  34.88 
 
 
351 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.463174  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3300  translation initiation factor, aIF-2BI family  33.55 
 
 
342 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2170  aIF-2BI family translation initiation factor  35.35 
 
 
344 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1971  methylthioribose-1-phosphate isomerase  35.74 
 
 
359 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4159  methylthioribose-1-phosphate isomerase  34.88 
 
 
351 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.109098  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2033  aIF-2BI family translation initiation factor  35.46 
 
 
354 aa  141  1.9999999999999998e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3789  methylthioribose-1-phosphate isomerase  34.88 
 
 
351 aa  140  3e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.700016  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0076  translation initiation factor 2B subunit I  36.1 
 
 
355 aa  139  6e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4053  methylthioribose-1-phosphate isomerase  34.88 
 
 
351 aa  139  7e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1534  translation initiation factor, aIF-2BI family  34.43 
 
 
348 aa  139  7e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1381  translation initiation factor, aIF-2BI family  35.06 
 
 
362 aa  139  7e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.705402  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3942  methylthioribose-1-phosphate isomerase  34.88 
 
 
351 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4251  methylthioribose-1-phosphate isomerase  34.88 
 
 
351 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1203  translation initiation factor, aIF-2BI family  33.33 
 
 
358 aa  139  7.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4139  methylthioribose-1-phosphate isomerase  33.44 
 
 
353 aa  138  1e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.196624  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3774  methylthioribose-1-phosphate isomerase  34.88 
 
 
351 aa  139  1e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0888  translation initiation factor, aIF-2BI family  32.1 
 
 
343 aa  139  1e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.332412  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3560  translation initiation factor, aIF-2BI family  31.68 
 
 
357 aa  137  2e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2118  translation initiation factor IF-2B subunit alpha  37.84 
 
 
339 aa  137  2e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0921  translation initiation factor, aIF-2BI family  32.04 
 
 
342 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>