14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET1290 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET1290  NUDIX domain-containing protein  100 
 
 		 138 aa  285  2e-76  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1073  NUDIX hydrolase domain protein  86.86 
 
 		 137 aa  248  2e-65  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.467829  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1101  NUDIX hydrolase  80.15 
 
 		 136 aa  234  4e-61  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1398  initiation factor 2B related  41.27 
 
 		 414 aa  95.5  2e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3564  initiation factor 2B related protein  39.53 
 
 		 505 aa  93.6  9e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1576  initiation factor 2B related protein  38.52 
 
 		 467 aa  92.8  1e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.649962  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0544  NUDIX hydrolase  34.53 
 
 		 134 aa  83.2  0.000000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.788518 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02410  translation initiation factor eIF-2B subunit family protein (AFU_orthologue; AFUA_2G14290)  33.94 
 
 		 548 aa  70.5  0.000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.347502 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1427  NUDIX hydrolase  31.82 
 
 		 151 aa  43.1  0.001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05360  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  30.33 
 
 		 345 aa  42.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.623868  normal  0.0249588 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5104  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  30.08 
 
 		 345 aa  42  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180722  normal  0.842074 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3543  NUDIX hydrolase  28.67 
 
 		 160 aa  41.2  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.291144  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4299  NUDIX hydrolase  29.58 
 
 		 165 aa  40  0.01  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.687324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2175  NUDIX hydrolase  27.68 
 
 		 133 aa  40  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.523963 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>