250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0331 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_0331  translation initiation factor, aIF-2BII family  100 
 
 		 309 aa  628  1e-179  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2432  translation initiation factor IF-2B subunit delta  53.59 
 
 		 320 aa  305  8.000000000000001e-82  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0793  translation initiation factor IF-2B subunit delta  52.01 
 
 		 307 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.618819 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2067  translation initiation factor IF-2B subunit delta  50.67 
 
 		 309 aa  293  3e-78  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0673  translation initiation factor IF-2B subunit delta  55.97 
 
 		 313 aa  288  8e-77  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1938  translation initiation factor IF-2B subunit delta  48.66 
 
 		 321 aa  287  2e-76  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0557  translation initiation factor IF-2B subunit delta  49.67 
 
 		 319 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0282254 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1262  translation initiation factor IF-2B subunit delta  51.69 
 
 		 302 aa  273  3e-72  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.156828  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0257  translation initiation factor IF-2B subunit delta  50.76 
 
 		 318 aa  268  5.9999999999999995e-71  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.374492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2314  translation initiation factor IF-2B subunit delta  50.67 
 
 		 318 aa  262  6.999999999999999e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0384  translation initiation factor IF-2B subunit delta  49.33 
 
 		 331 aa  239  5.999999999999999e-62  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.111584  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2762  translation initiation factor IF-2B subunit delta  42.3 
 
 		 331 aa  228  1e-58  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00225031  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2269  translation initiation factor IF-2B subunit delta  43.79 
 
 		 323 aa  228  1e-58  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0752053 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0571  translation initiation factor, aIF-2BII family  42.24 
 
 		 327 aa  221  9.999999999999999e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2966  translation initiation factor, aIF-2BII family  40.19 
 
 		 351 aa  213  1.9999999999999998e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00871533  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3379  aIF-2BI family translation initiation factor  40.79 
 
 		 346 aa  202  5e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0072  translation initiation factor 2B subunit I  41.69 
 
 		 346 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.25912 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4322  aIF-2BI family translation initiation factor  41.5 
 
 		 346 aa  196  6e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.394096  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3596  translation initiation factor, aIF-2BI family  40.13 
 
 		 346 aa  189  5e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.82629  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0510  aIF-2BI family translation initiation factor  40.2 
 
 		 346 aa  187  3e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0385  initiation factor 2B related  41.83 
 
 		 319 aa  182  6e-45  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.14036  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0621  translation initiation factor 2B subunit I  42.62 
 
 		 342 aa  180  2e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0997628  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0648  aIF-2BI family translation initiation factor  38.24 
 
 		 348 aa  180  2e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674044  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3544  methylthioribose-1-phosphate isomerase  37.58 
 
 		 347 aa  180  2.9999999999999997e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0254  aIF-2BI family translation initiation factor  40.72 
 
 		 346 aa  179  4e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4687  methylthioribose-1-phosphate isomerase  38.89 
 
 		 350 aa  176  6e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0623  putative translation initiation factor, aIF-2BI/5-methylthioribose-1-phosphate isomerase  39.3 
 
 		 354 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.242304  normal  0.23951 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0016  aIF-2BI family translation initiation factor  39.31 
 
 		 343 aa  171  1e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.339634  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0016  aIF-2BI family translation initiation factor  39.31 
 
 		 343 aa  171  1e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.570831  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1643  translation initiation factor  38.24 
 
 		 344 aa  169  4e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.226672  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18480  putative translation initiation factor, aIF-2BI family  39.87 
 
 		 355 aa  168  9e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0224403  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2064  aIF-2BI family translation initiation factor  35.69 
 
 		 346 aa  167  1e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000777983  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2349  aIF-2BI family translation initiation factor  33.02 
 
 		 358 aa  166  5e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.944221  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0810  aIF-2BI family translation initiation factor  37.26 
 
 		 349 aa  166  5.9999999999999996e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3560  translation initiation factor, aIF-2BI family  35.76 
 
 		 357 aa  165  9e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3753  translation initiation factor, aIF-2BI family  38.34 
 
 		 346 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2613  translation initiation factor, aIF-2BI family  37.46 
 
 		 349 aa  165  1.0000000000000001e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2124  methylthioribose-1-phosphate isomerase  35.57 
 
 		 354 aa  163  3e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.369854  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2043  methylthioribose-1-phosphate isomerase  35.91 
 
 		 354 aa  163  4.0000000000000004e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3646  translation initiation factor, aIF-2BI family  39.56 
 
 		 346 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00735  methylthioribose-1-phosphate isomerase  36.27 
 
 		 354 aa  162  7e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.214802  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3816  methylthioribose-1-phosphate isomerase  36.27 
 
 		 350 aa  162  8.000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.732544 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0008  translation initiation factor IF-2B subunit alpha  36.96 
 
 		 351 aa  161  1e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.679741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3765  translation initiation factor, aIF-2BI family  36.18 
 
 		 345 aa  160  2e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0692423  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6765  translation initiation factor, aIF-2BI family  36.2 
 
 		 369 aa  160  2e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0639  aIF-2BI family translation initiation factor  36.75 
 
 		 372 aa  160  2e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.249987  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2170  aIF-2BI family translation initiation factor  37.74 
 
 		 344 aa  160  4e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3749  putative translation initiation factor, aIF-2BI/5-methylthioribose-1-phosphate isomerase  33.99 
 
 		 354 aa  159  6e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0485  aIF-2BI family translation initiation factor  35.37 
 
 		 353 aa  159  7e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.646058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0663  translation initiation factor IF-2B subunit alpha  35.71 
 
 		 365 aa  159  8e-38  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.109881 
 
 
-
 
NC_002936  DET0518  aIF-2BI family translation initiation factor  37.33 
 
 		 334 aa  158  9e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.294825  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0394  methylthioribose-1-phosphate isomerase  33.76 
 
 		 348 aa  158  9e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1694  aIF-2BI family translation initiation factor  37.82 
 
 		 353 aa  157  1e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_459  methylthioribose-1-phosphate isomerase  37 
 
 		 332 aa  157  2e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.14852  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0327  methylthioribose-1-phosphate isomerase  34.71 
 
 		 348 aa  157  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0169  aIF-2BI family translation initiation factor  35.28 
 
 		 345 aa  157  3e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00178496 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2173  translation initiation factor IF-2B subunit alpha  35.91 
 
 		 366 aa  156  3e-37  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0379  methylthioribose-1-phosphate isomerase  34.52 
 
 		 348 aa  156  4e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0332  methylthioribose-1-phosphate isomerase  34.52 
 
 		 348 aa  156  4e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0347  methylthioribose-1-phosphate isomerase  34.52 
 
 		 347 aa  156  4e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1519  aIF-2BI family translation initiation factor  36.69 
 
 		 350 aa  156  4e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.889993  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0396  translation initiation factor IF-2B subunit alpha  34.42 
 
 		 370 aa  156  5.0000000000000005e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.359627  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0319  methylthioribose-1-phosphate isomerase  34.19 
 
 		 347 aa  155  7e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0316  methylthioribose-1-phosphate isomerase  34.52 
 
 		 348 aa  155  9e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0929  translation initiation factor, aIF-2BI family  37.46 
 
 		 344 aa  155  1e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.119435  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0494  translation initiation factor 2B subunit I  36.33 
 
 		 332 aa  154  1e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.93452  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1036  translation initiation factor, aIF-2BI family  40.23 
 
 		 347 aa  154  2e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.313313  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0441  methylthioribose-1-phosphate isomerase  33.23 
 
 		 348 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0005  translation initiation factor IF-2B subunit alpha  35.95 
 
 		 365 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4924  methylthioribose-1-phosphate isomerase  33.44 
 
 		 348 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.64519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1289  methylthioribose-1-phosphate isomerase  35.54 
 
 		 364 aa  153  4e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0889723  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0703  translation initiation factor 2B subunit I  37.13 
 
 		 351 aa  153  4e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000787843 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2717  methylthioribose-1-phosphate isomerase  38.24 
 
 		 349 aa  152  5e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.143544  normal  0.136837 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1175  translation initiation factor 2B subunit I  37.13 
 
 		 354 aa  152  5e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2078  methylthioribose-1-phosphate isomerase  36.36 
 
 		 353 aa  152  5e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.424406 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3396  methylthioribose-1-phosphate isomerase  38.24 
 
 		 349 aa  152  5e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0964  translation initiation factor, aIF-2BI family  39.55 
 
 		 351 aa  152  5e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.518904  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0770  translation initiation factor, aIF-2BI family  36.21 
 
 		 366 aa  151  1e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.301181  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1881  aIF-2BI family translation initiation factor  36.86 
 
 		 345 aa  151  1e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1186  translation initiation factor, aIF-2BI family  35.58 
 
 		 345 aa  151  2e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000144196  normal  0.031954 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2579  methylthioribose-1-phosphate isomerase  38.82 
 
 		 354 aa  150  2e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0503  translation initiation factor, aIF-2BI family  36.31 
 
 		 350 aa  150  3e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1840  aIF-2BI family translation initiation factor  37.2 
 
 		 348 aa  149  6e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.635739  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1381  translation initiation factor, aIF-2BI family  34.64 
 
 		 362 aa  148  9e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.705402  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2312  translation initiation factor, aIF-2BI family  33.99 
 
 		 378 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3648  methylthioribose-1-phosphate isomerase  35.78 
 
 		 365 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.295966  normal  0.479816 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2235  translation initiation factor, aIF-2BI family  35.11 
 
 		 350 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0191  translation initiation factor, aIF-2BI family  34.3 
 
 		 348 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0846  methylthioribose-1-phosphate isomerase  33.33 
 
 		 356 aa  146  5e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1744  initiation factor 2 subunit family  35.74 
 
 		 358 aa  146  5e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1543  translation initiation factor, aIF-2BI family  38.39 
 
 		 333 aa  145  7.0000000000000006e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0321135  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0156  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  33.98 
 
 		 354 aa  145  1e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4334  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  36.43 
 
 		 337 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0246  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized proteins  37.25 
 
 		 345 aa  144  3e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23250  methylthioribose-1-phosphate isomerase  36.04 
 
 		 358 aa  143  4e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0078361 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1491  translation initiation factor, aIF-2BI family  37.15 
 
 		 353 aa  143  5e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.626941  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1360  translation initiation factor, aIF-2BI family  36.83 
 
 		 342 aa  142  9e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0559648  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0419  translation initiation factor 2B subunit I family (IF-2BI)  35.48 
 
 		 347 aa  140  1.9999999999999998e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.04546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1015  translation initiation factor, aIF-2BI family  34.55 
 
 		 350 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.253315  unclonable  0.0000000000388932 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0893  translation initiation factor, putative, aIF-2BI family  34.55 
 
 		 350 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.592347  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>