243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2147 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_2147  initiation factor 2B related  100 
 
 
309 aa  627  1e-179  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000266151  hitchhiker  0.00589649 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3027  initiation factor 2B related  84.97 
 
 
320 aa  528  1e-149  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.390862  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2012  initiation factor 2B related  45.39 
 
 
310 aa  249  4e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0673  translation initiation factor IF-2B subunit delta  29.67 
 
 
313 aa  124  2e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0074  initiation factor 2B related  30.6 
 
 
292 aa  114  1.0000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1571  initiation factor 2B related protein  33.06 
 
 
283 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3347  initiation factor 2B related protein  30.45 
 
 
283 aa  108  1e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.151547  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2269  translation initiation factor IF-2B subunit delta  30 
 
 
323 aa  105  8e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0752053 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1262  translation initiation factor IF-2B subunit delta  32.81 
 
 
302 aa  103  4e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.156828  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2704  initiation factor 2B related  27.85 
 
 
312 aa  103  4e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0331  translation initiation factor, aIF-2BII family  31.3 
 
 
309 aa  98.2  1e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2279  initiation factor 2B related  31.03 
 
 
312 aa  97.1  3e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.14439  normal  0.124168 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2762  translation initiation factor IF-2B subunit delta  30.42 
 
 
331 aa  95.1  1e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00225031  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1938  translation initiation factor IF-2B subunit delta  31.07 
 
 
321 aa  94.7  1e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2067  translation initiation factor IF-2B subunit delta  29.64 
 
 
309 aa  94  3e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0385  initiation factor 2B related  32.06 
 
 
319 aa  92.8  7e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.14036  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0793  translation initiation factor IF-2B subunit delta  29.75 
 
 
307 aa  91.7  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.618819 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3765  translation initiation factor, aIF-2BI family  34.74 
 
 
345 aa  92  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0692423  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0557  translation initiation factor IF-2B subunit delta  29.75 
 
 
319 aa  92.4  1e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0282254 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2432  translation initiation factor IF-2B subunit delta  28.26 
 
 
320 aa  91.3  2e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1491  translation initiation factor, aIF-2BI family  33.17 
 
 
353 aa  90.9  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.626941  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0257  translation initiation factor IF-2B subunit delta  29.54 
 
 
318 aa  90.1  4e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.374492  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3385  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  34.01 
 
 
357 aa  89.4  7e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0978  translation initiation factor 2B subunit I  34.05 
 
 
338 aa  88.2  1e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0893546  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0571  translation initiation factor, aIF-2BII family  28.79 
 
 
327 aa  88.2  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0503  translation initiation factor, aIF-2BI family  37.43 
 
 
350 aa  87.4  3e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3749  putative translation initiation factor, aIF-2BI/5-methylthioribose-1-phosphate isomerase  28.71 
 
 
354 aa  87.4  3e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1041  translation initiation factor IF-2B subunit alpha  28.96 
 
 
362 aa  86.7  5e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0703  translation initiation factor 2B subunit I  31.88 
 
 
351 aa  86.3  6e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000787843 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2118  translation initiation factor IF-2B subunit alpha  29.88 
 
 
339 aa  86.3  6e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2170  aIF-2BI family translation initiation factor  35.29 
 
 
344 aa  85.9  7e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1015  translation initiation factor, aIF-2BI family  33.79 
 
 
350 aa  85.9  8e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.253315  unclonable  0.0000000000388932 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1992  translation initiation factor 2B subunit I  36.36 
 
 
348 aa  85.9  8e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.337411 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0893  translation initiation factor, putative, aIF-2BI family  33.79 
 
 
350 aa  85.9  8e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.592347  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6765  translation initiation factor, aIF-2BI family  34.17 
 
 
369 aa  85.5  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2276  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  30.07 
 
 
348 aa  84.7  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0510  aIF-2BI family translation initiation factor  29.55 
 
 
346 aa  84.3  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0623  putative translation initiation factor, aIF-2BI/5-methylthioribose-1-phosphate isomerase  28.86 
 
 
354 aa  83.6  0.000000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.242304  normal  0.23951 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0246  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized proteins  29.34 
 
 
345 aa  83.6  0.000000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2269  translation initiation factor 2B subunit I  28.45 
 
 
349 aa  83.6  0.000000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0770  translation initiation factor, aIF-2BI family  36.08 
 
 
366 aa  83.2  0.000000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.301181  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2966  translation initiation factor, aIF-2BII family  26.06 
 
 
351 aa  83.2  0.000000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00871533  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2314  translation initiation factor IF-2B subunit delta  29.15 
 
 
318 aa  83.2  0.000000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0984  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  32.99 
 
 
343 aa  82.8  0.000000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1519  aIF-2BI family translation initiation factor  30.42 
 
 
350 aa  82.8  0.000000000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.889993  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2312  translation initiation factor, aIF-2BI family  35.15 
 
 
378 aa  82.4  0.000000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2613  translation initiation factor, aIF-2BI family  28.12 
 
 
349 aa  82.4  0.000000000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0518  aIF-2BI family translation initiation factor  34.59 
 
 
334 aa  82  0.00000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.294825  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3596  translation initiation factor, aIF-2BI family  28.21 
 
 
346 aa  82  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.82629  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1175  translation initiation factor 2B subunit I  34.76 
 
 
354 aa  82  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0888  translation initiation factor, aIF-2BI family  31.18 
 
 
343 aa  81.6  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.332412  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_14255  predicted protein  29.31 
 
 
326 aa  81.3  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_459  methylthioribose-1-phosphate isomerase  33.14 
 
 
332 aa  81.3  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.14852  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10674  predicted protein  30.65 
 
 
290 aa  81.6  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.337525  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1360  translation initiation factor, aIF-2BI family  28.1 
 
 
342 aa  81.6  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0559648  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0621  translation initiation factor 2B subunit I  34.57 
 
 
342 aa  81.3  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0997628  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3564  initiation factor 2B related protein  31.07 
 
 
505 aa  81.3  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0076  translation initiation factor 2B subunit I  30.34 
 
 
355 aa  80.5  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0072  translation initiation factor 2B subunit I  29.22 
 
 
346 aa  80.5  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.25912 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2541  translation initiation factor, aIF-2BI family  34.34 
 
 
350 aa  79.7  0.00000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3379  aIF-2BI family translation initiation factor  29.3 
 
 
346 aa  79.3  0.00000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1186  translation initiation factor, aIF-2BI family  33.69 
 
 
345 aa  79  0.00000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000144196  normal  0.031954 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1667  methylthioribose-1-phosphate isomerase  26.6 
 
 
352 aa  78.6  0.0000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000944772  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2235  translation initiation factor, aIF-2BI family  31.91 
 
 
350 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01730  hypothetical protein  37.01 
 
 
386 aa  78.6  0.0000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.199105  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3544  methylthioribose-1-phosphate isomerase  29.41 
 
 
347 aa  78.6  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0016  aIF-2BI family translation initiation factor  27.38 
 
 
343 aa  77.8  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.570831  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0169  aIF-2BI family translation initiation factor  32.26 
 
 
345 aa  77.8  0.0000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00178496 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0810  aIF-2BI family translation initiation factor  27.59 
 
 
349 aa  77.8  0.0000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18480  putative translation initiation factor, aIF-2BI family  28.78 
 
 
355 aa  78.2  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0224403  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1140  translation initiation factor 2B subunit I  30.19 
 
 
342 aa  77.8  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4322  aIF-2BI family translation initiation factor  27.8 
 
 
346 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.394096  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0016  aIF-2BI family translation initiation factor  27.38 
 
 
343 aa  77.8  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.339634  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1840  aIF-2BI family translation initiation factor  32.31 
 
 
348 aa  77.4  0.0000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.635739  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3300  translation initiation factor, aIF-2BI family  32.24 
 
 
342 aa  77.4  0.0000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3948  methylthioribose-1-phosphate isomerase  36.73 
 
 
358 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0029579  normal  0.0349514 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1881  aIF-2BI family translation initiation factor  31.55 
 
 
345 aa  76.6  0.0000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2877  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized proteins  32.5 
 
 
350 aa  77  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0921  translation initiation factor, aIF-2BI family  34.83 
 
 
342 aa  76.6  0.0000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2078  methylthioribose-1-phosphate isomerase  27.34 
 
 
353 aa  76.6  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.424406 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0964  translation initiation factor, aIF-2BI family  34.1 
 
 
351 aa  76.3  0.0000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.518904  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0027  aIF-2BI family translation initiation factor  25.76 
 
 
337 aa  76.3  0.0000000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1694  aIF-2BI family translation initiation factor  33.51 
 
 
353 aa  76.3  0.0000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2064  aIF-2BI family translation initiation factor  31.38 
 
 
346 aa  75.9  0.0000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000777983  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0254  aIF-2BI family translation initiation factor  32.45 
 
 
346 aa  75.9  0.0000000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1357  methylthioribose-1-phosphate isomerase  36.73 
 
 
358 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.759333 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3942  methylthioribose-1-phosphate isomerase  27.51 
 
 
351 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1543  translation initiation factor, aIF-2BI family  30.33 
 
 
333 aa  75.5  0.000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0321135  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4687  methylthioribose-1-phosphate isomerase  26.99 
 
 
350 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4251  methylthioribose-1-phosphate isomerase  27.51 
 
 
351 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1647  translation initiation factor, aIF-2BI family  28.99 
 
 
329 aa  75.1  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2717  methylthioribose-1-phosphate isomerase  33.51 
 
 
349 aa  75.1  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.143544  normal  0.136837 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3396  methylthioribose-1-phosphate isomerase  33.51 
 
 
349 aa  75.1  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3753  translation initiation factor, aIF-2BI family  31.09 
 
 
346 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0494  translation initiation factor 2B subunit I  33.75 
 
 
332 aa  75.1  0.000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.93452  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4098  methylthioribose-1-phosphate isomerase  27.49 
 
 
351 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.463174  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0648  aIF-2BI family translation initiation factor  34.76 
 
 
348 aa  75.1  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674044  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0846  methylthioribose-1-phosphate isomerase  29.52 
 
 
356 aa  74.7  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0913  translation initiation factor 2B subunit I  32.47 
 
 
346 aa  74.7  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.659043  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1289  methylthioribose-1-phosphate isomerase  26.92 
 
 
364 aa  75.1  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0889723  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>