234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_61090 on replicon NC_009045
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009045  PICST_61090  translation initiation factor eIF-2B alpha subunit (GCN3)  100 
 
 
311 aa  639    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.571907 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00167  translation initiation factor eIF-2B alpha subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G11340)  44.57 
 
 
352 aa  265  8e-70  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10674  predicted protein  38.33 
 
 
290 aa  197  2.0000000000000003e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.337525  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01730  hypothetical protein  40.32 
 
 
386 aa  179  4e-44  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.199105  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1262  translation initiation factor IF-2B subunit delta  31.18 
 
 
302 aa  124  3e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.156828  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0673  translation initiation factor IF-2B subunit delta  31.45 
 
 
313 aa  110  3e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0793  translation initiation factor IF-2B subunit delta  30.24 
 
 
307 aa  109  6e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.618819 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0331  translation initiation factor, aIF-2BII family  31.52 
 
 
309 aa  107  2e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2314  translation initiation factor IF-2B subunit delta  29.51 
 
 
318 aa  98.6  1e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1938  translation initiation factor IF-2B subunit delta  27.71 
 
 
321 aa  95.1  1e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2613  translation initiation factor, aIF-2BI family  29.77 
 
 
349 aa  93.6  3e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1491  translation initiation factor, aIF-2BI family  27.43 
 
 
353 aa  93.2  5e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.626941  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0557  translation initiation factor IF-2B subunit delta  28.35 
 
 
319 aa  92.8  6e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0282254 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2067  translation initiation factor IF-2B subunit delta  28.02 
 
 
309 aa  92.4  9e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0571  translation initiation factor, aIF-2BII family  25.19 
 
 
327 aa  88.6  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0169  aIF-2BI family translation initiation factor  27.34 
 
 
345 aa  87.8  2e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00178496 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2269  translation initiation factor IF-2B subunit delta  25.7 
 
 
323 aa  87.4  3e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0752053 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1186  translation initiation factor, aIF-2BI family  27.7 
 
 
345 aa  86.7  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000144196  normal  0.031954 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1041  translation initiation factor IF-2B subunit alpha  28.31 
 
 
362 aa  86.3  5e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2432  translation initiation factor IF-2B subunit delta  25.9 
 
 
320 aa  86.3  6e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0246  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized proteins  28.19 
 
 
345 aa  86.3  6e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2762  translation initiation factor IF-2B subunit delta  24.91 
 
 
331 aa  85.5  9e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00225031  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2966  translation initiation factor, aIF-2BII family  27.32 
 
 
351 aa  84.3  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00871533  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0384  translation initiation factor IF-2B subunit delta  30.85 
 
 
331 aa  84.7  0.000000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.111584  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_14255  predicted protein  26.51 
 
 
326 aa  83.6  0.000000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0254  aIF-2BI family translation initiation factor  30.46 
 
 
346 aa  83.6  0.000000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0027  aIF-2BI family translation initiation factor  30.43 
 
 
337 aa  83.2  0.000000000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0257  translation initiation factor IF-2B subunit delta  24.63 
 
 
318 aa  82.4  0.000000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.374492  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0016  aIF-2BI family translation initiation factor  27.9 
 
 
343 aa  82.4  0.000000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.570831  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0016  aIF-2BI family translation initiation factor  27.9 
 
 
343 aa  82.4  0.000000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.339634  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2064  aIF-2BI family translation initiation factor  27.11 
 
 
346 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000777983  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2235  translation initiation factor, aIF-2BI family  26.62 
 
 
350 aa  80.1  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0929  translation initiation factor, aIF-2BI family  29.18 
 
 
344 aa  80.1  0.00000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.119435  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0385  initiation factor 2B related  29.33 
 
 
319 aa  79.3  0.00000000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.14036  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2033  aIF-2BI family translation initiation factor  33.33 
 
 
354 aa  79  0.00000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3027  initiation factor 2B related  29.77 
 
 
320 aa  79  0.00000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.390862  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2269  translation initiation factor 2B subunit I  31.5 
 
 
349 aa  78.2  0.0000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0076  translation initiation factor 2B subunit I  23.78 
 
 
355 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0319  methylthioribose-1-phosphate isomerase  27.01 
 
 
347 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0648  aIF-2BI family translation initiation factor  30.81 
 
 
348 aa  77  0.0000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674044  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1052  aIF-2BI family translation initiation factor  28.88 
 
 
321 aa  76.6  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0332  methylthioribose-1-phosphate isomerase  26.64 
 
 
348 aa  76.3  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0347  methylthioribose-1-phosphate isomerase  26.64 
 
 
347 aa  76.3  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0379  methylthioribose-1-phosphate isomerase  26.64 
 
 
348 aa  76.3  0.0000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0621  translation initiation factor 2B subunit I  28.3 
 
 
342 aa  76.3  0.0000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0997628  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2312  translation initiation factor, aIF-2BI family  30.46 
 
 
378 aa  75.5  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2877  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized proteins  29 
 
 
350 aa  75.1  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0865  aIF-2BI family translation initiation factor  29.2 
 
 
321 aa  74.7  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0114166 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0703  translation initiation factor 2B subunit I  26.79 
 
 
351 aa  74.7  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000787843 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2118  translation initiation factor IF-2B subunit alpha  25.9 
 
 
339 aa  75.1  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2147  initiation factor 2B related  29.95 
 
 
309 aa  74.3  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000266151  hitchhiker  0.00589649 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0316  methylthioribose-1-phosphate isomerase  26.28 
 
 
348 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0074  initiation factor 2B related  30 
 
 
292 aa  73.9  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0191  translation initiation factor, aIF-2BI family  28.57 
 
 
348 aa  73.9  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1791  translation initiation factor 2B subunit I  28.88 
 
 
321 aa  73.6  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0945  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  26.01 
 
 
342 aa  73.2  0.000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0441  methylthioribose-1-phosphate isomerase  26.49 
 
 
348 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3447  translation initiation factor, aIF-2BI family  24.63 
 
 
342 aa  72.8  0.000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.653614  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1519  aIF-2BI family translation initiation factor  24 
 
 
350 aa  72.4  0.000000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.889993  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1881  aIF-2BI family translation initiation factor  25.54 
 
 
345 aa  72  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3861  methylthioribose-1-phosphate isomerase  27.97 
 
 
349 aa  72  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.583783  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0927  aIF-2BI family translation initiation factor  27.1 
 
 
323 aa  72  0.00000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0394  methylthioribose-1-phosphate isomerase  26.45 
 
 
348 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3749  putative translation initiation factor, aIF-2BI/5-methylthioribose-1-phosphate isomerase  30.5 
 
 
354 aa  71.2  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0327  methylthioribose-1-phosphate isomerase  25.91 
 
 
348 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1099  methylthioribose-1-phosphate isomerase  27.59 
 
 
353 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.767768 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3300  translation initiation factor, aIF-2BI family  24.26 
 
 
342 aa  70.9  0.00000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1360  translation initiation factor, aIF-2BI family  27.91 
 
 
342 aa  70.9  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0559648  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2012  initiation factor 2B related  28.11 
 
 
310 aa  70.5  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0503  translation initiation factor, aIF-2BI family  30.77 
 
 
350 aa  70.5  0.00000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4322  aIF-2BI family translation initiation factor  30.73 
 
 
346 aa  70.1  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.394096  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0518  aIF-2BI family translation initiation factor  25.37 
 
 
334 aa  70.1  0.00000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.294825  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21290  predicted protein  27.69 
 
 
385 aa  70.1  0.00000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3765  translation initiation factor, aIF-2BI family  25.62 
 
 
345 aa  69.3  0.00000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0692423  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4139  methylthioribose-1-phosphate isomerase  27.2 
 
 
353 aa  69.3  0.00000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.196624  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_459  methylthioribose-1-phosphate isomerase  24.82 
 
 
332 aa  69.3  0.00000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.14852  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4924  methylthioribose-1-phosphate isomerase  25.55 
 
 
348 aa  69.3  0.00000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.64519  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3560  translation initiation factor, aIF-2BI family  29.23 
 
 
357 aa  69.3  0.00000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1543  translation initiation factor, aIF-2BI family  28.82 
 
 
333 aa  68.9  0.0000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0321135  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1332  initiation factor 2B related  30.19 
 
 
234 aa  68.2  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0126468  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1706  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized proteins  30.26 
 
 
349 aa  67.8  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.307709  normal  0.360385 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1140  translation initiation factor 2B subunit I  25.27 
 
 
342 aa  67.8  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3753  translation initiation factor, aIF-2BI family  26.12 
 
 
346 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2170  aIF-2BI family translation initiation factor  26.12 
 
 
344 aa  67.4  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2704  initiation factor 2B related  25.18 
 
 
312 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3347  initiation factor 2B related protein  25.54 
 
 
283 aa  67  0.0000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.151547  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1354  initiation factor 2B related  30.87 
 
 
234 aa  66.2  0.0000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000372175  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3942  methylthioribose-1-phosphate isomerase  26.05 
 
 
351 aa  65.9  0.0000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4251  methylthioribose-1-phosphate isomerase  26.05 
 
 
351 aa  65.9  0.0000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2731  methylthioribose-1-phosphate isomerase  25.81 
 
 
349 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0228866  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1773  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  22.36 
 
 
343 aa  65.5  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4159  methylthioribose-1-phosphate isomerase  26.82 
 
 
351 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.109098  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0810  aIF-2BI family translation initiation factor  27.59 
 
 
349 aa  65.1  0.000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3646  translation initiation factor, aIF-2BI family  27.03 
 
 
346 aa  65.1  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0595  translation initiation factor, aIF-2BI family  26.46 
 
 
328 aa  65.1  0.000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4098  methylthioribose-1-phosphate isomerase  26.44 
 
 
351 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.463174  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3774  methylthioribose-1-phosphate isomerase  25.67 
 
 
351 aa  65.1  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1643  translation initiation factor  24.92 
 
 
344 aa  64.7  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.226672  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3318  aIF-2BI family translation initiation factor  26.58 
 
 
346 aa  64.7  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1175  translation initiation factor 2B subunit I  32.08 
 
 
354 aa  64.7  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>