157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0106 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_0106  hypothetical protein  100 
 
 
299 aa  600  1.0000000000000001e-171  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0197  hypothetical protein  62.98 
 
 
245 aa  290  1e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1574  hypothetical protein  45.8 
 
 
262 aa  187  2e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.452675  decreased coverage  0.00256052 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0331  hypothetical protein  40.84 
 
 
269 aa  179  5.999999999999999e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1873  lipase/esterase  46.54 
 
 
264 aa  163  3e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1246  hypothetical protein  41.38 
 
 
221 aa  162  5.0000000000000005e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1203  dienelactone hydrolase  37.23 
 
 
261 aa  159  4e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.458983  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1768  esterase/lipase  36.7 
 
 
263 aa  158  9e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21310  hypothetical protein  35.83 
 
 
271 aa  157  2e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.421552 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4325  hypothetical protein  41.54 
 
 
279 aa  156  4e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.581342  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1424  hypothetical protein  37.98 
 
 
273 aa  152  8e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0470419  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4844  Dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase -like protein  34.87 
 
 
332 aa  136  5e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3374  esterase/lipase-like protein  35.74 
 
 
292 aa  132  5e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.751167  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3160  hypothetical protein  36.26 
 
 
261 aa  132  1.0000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0394877  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4527  hypothetical protein  34.72 
 
 
268 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1516  putative hydrolase  32.4 
 
 
270 aa  130  3e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.753217  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0112  hypothetical protein  36.84 
 
 
270 aa  129  4.0000000000000003e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.237819  normal  0.370243 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1669  esterase/lipase-like protein  35.71 
 
 
291 aa  129  8.000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1987  esterase/lipase-like protein  36.15 
 
 
355 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3437  Dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase -like protein  33.58 
 
 
331 aa  128  1.0000000000000001e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0679  putative lipase/esterase  36.4 
 
 
249 aa  127  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.318798  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6578  esterase/lipase-like protein  36.5 
 
 
322 aa  125  6e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5037  hypothetical protein  37.93 
 
 
268 aa  125  9e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0490595 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3362  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  37.12 
 
 
243 aa  124  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6946  hypothetical protein  37.36 
 
 
262 aa  122  8e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2006  esterase/lipase-like protein  34.57 
 
 
309 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1863  putative esterase  38.78 
 
 
380 aa  115  6.9999999999999995e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0663647  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2569  hypothetical protein  32.98 
 
 
344 aa  115  1.0000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.538673  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0661  hypothetical protein  35.19 
 
 
321 aa  103  3e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.458296  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2763  hypothetical protein  31.4 
 
 
238 aa  102  8e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.15873  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2922  putative lipase/esterase  30.74 
 
 
307 aa  102  8e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1585  dienelactone hydrolase  30.95 
 
 
323 aa  75.5  0.0000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.144212  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2966  esterase/lipase  27.94 
 
 
326 aa  68.2  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02409  putative lipase/esterase  26.42 
 
 
379 aa  68.9  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2025  Alpha/beta hydrolase  28.5 
 
 
301 aa  67.4  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2759  Alpha/beta hydrolase fold-3  29.96 
 
 
336 aa  65.1  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2611  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  28.19 
 
 
308 aa  64.3  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.985192 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0640  Alpha/beta hydrolase  28.51 
 
 
303 aa  60.5  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.225482 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4875  putative lipase/esterase  29.77 
 
 
269 aa  60.1  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1051  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  27.72 
 
 
349 aa  59.7  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.696352  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1645  Esterase/lipase-like protein  28.27 
 
 
333 aa  58.5  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2030  Esterase/lipase-like protein  27.99 
 
 
593 aa  57.4  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0135331  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1429  cellulose-binding family II  25 
 
 
471 aa  56.6  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0718119  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3795  esterase/lipase  28.23 
 
 
300 aa  56.6  0.0000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.662401  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0202  Alpha/beta hydrolase fold-3  25.78 
 
 
407 aa  56.2  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0211  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  25.78 
 
 
407 aa  56.2  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00810  prolyl oligopeptidase family protein  29.37 
 
 
345 aa  55.1  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0191  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  25.78 
 
 
407 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.624051 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0221  lipase/esterase  28.87 
 
 
340 aa  55.1  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2004  putative esterase/lipase  26.86 
 
 
291 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3894  esterase/lipase-like protein  26.98 
 
 
301 aa  54.7  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1132  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  27.73 
 
 
376 aa  54.3  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.328692 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10222  esterase lipC  25.3 
 
 
403 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.480215  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2181  putative lipase/esterase  32.43 
 
 
258 aa  55.1  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000144182 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0227  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  24.78 
 
 
407 aa  53.1  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.139422 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0449  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  29.92 
 
 
321 aa  53.1  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0978  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  25.86 
 
 
312 aa  53.1  0.000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.689687  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1454  esterase/lipase/thioesterase  24.24 
 
 
411 aa  52.8  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0950589  hitchhiker  0.0024577 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0440  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  24.89 
 
 
409 aa  52.8  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.116329  normal  0.623779 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00830  esterase/lipase  28.23 
 
 
454 aa  52.4  0.000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0837  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like  24.68 
 
 
307 aa  52  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0927814  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3552  hypothetical protein  29.39 
 
 
328 aa  52  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0400  hypothetical protein  30.49 
 
 
274 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.680283  normal  0.731684 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4283  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  26.81 
 
 
1094 aa  51.6  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6817  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  26.27 
 
 
272 aa  52  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2850  putative lipase/esterase  25.51 
 
 
308 aa  50.8  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5100  esterase/lipase-like protein  28.97 
 
 
272 aa  50.8  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3521  esterase/lipase-like protein  28.44 
 
 
333 aa  50.4  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1589  esterase/lipase-like protein  27.59 
 
 
306 aa  50.8  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4020  hypothetical protein  24.11 
 
 
325 aa  50.4  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00949224 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1655  esterase/lipase-like protein  27.59 
 
 
306 aa  50.8  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3159  hypothetical protein  28.57 
 
 
342 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.526515  normal  0.865494 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02110  NUDIX family protein  27.09 
 
 
399 aa  50.1  0.00004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0231  esterase/lipase/thioesterase  27.78 
 
 
314 aa  49.7  0.00006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.272912  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1922  Dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase-like protein  24.43 
 
 
347 aa  49.3  0.00008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000977803  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2156  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  25 
 
 
311 aa  48.9  0.00009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2589  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  27.52 
 
 
300 aa  48.9  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.719605  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1647  esterase  27.43 
 
 
300 aa  48.5  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1417  esterase/lipase  25.78 
 
 
310 aa  48.5  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.131998  normal  0.895698 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8360  Esterase/lipase-like protein  28.82 
 
 
362 aa  48.9  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.643295  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4855  esterase/lipase-like protein  29.06 
 
 
304 aa  47.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0316835 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2682  esterase/lipase/thioesterase  25.2 
 
 
324 aa  47.8  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0956  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  24.73 
 
 
672 aa  48.1  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2933  hypothetical protein  28.15 
 
 
342 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.131666 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2271  alpha/beta hydrolase  26.92 
 
 
325 aa  48.1  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.368725 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2427  endo-1,4-beta-xylanase B  30.37 
 
 
270 aa  47.4  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.740371  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2366  putative esterase  26.51 
 
 
287 aa  47.4  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0965  hypothetical protein  28.16 
 
 
337 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3997  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  26.89 
 
 
343 aa  47  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0350577  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0436  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  26.43 
 
 
422 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.310038 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4253  esterase/lipase-like protein  28.87 
 
 
318 aa  46.6  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.172615  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4391  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  27.24 
 
 
294 aa  46.6  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.175517  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1801  hypothetical protein  24.15 
 
 
334 aa  46.6  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1910  hypothetical protein  24.06 
 
 
334 aa  46.6  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.810251  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1963  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.85 
 
 
669 aa  46.2  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.159211  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0225  pectin acetylesterase  24.55 
 
 
324 aa  46.2  0.0006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0473386  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2205  hypothetical protein  24.15 
 
 
322 aa  46.2  0.0006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.900633 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0283  esterase/lipase  25.46 
 
 
303 aa  46.6  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.375027 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5201  lipase/esterase  34.71 
 
 
310 aa  46.2  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000263109  normal  0.0797568 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3115  hypothetical protein  28.57 
 
 
342 aa  46.2  0.0007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>