231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3894 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_3894  esterase/lipase-like protein  100 
 
 
301 aa  627  1e-179  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3550  alpha/beta hydrolase  48.68 
 
 
306 aa  298  8e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0287748  normal  0.0185565 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4266  esterase/lipase-like protein  48.2 
 
 
309 aa  280  2e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.401395  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0283  esterase/lipase  50 
 
 
303 aa  279  5e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.375027 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1417  esterase/lipase  49.29 
 
 
310 aa  278  8e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.131998  normal  0.895698 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4918  putative esterase/lipase precursor  47.44 
 
 
299 aa  253  3e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.220535  normal  0.753644 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3062  esterase/lipase-like protein  44.12 
 
 
333 aa  251  8.000000000000001e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.851787  normal  0.36043 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1805  Esterase/lipase  48.96 
 
 
281 aa  246  2e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.90276  hitchhiker  0.0000000160109 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3975  hypothetical protein  44.33 
 
 
289 aa  245  6e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1345  alpha/beta hydrolase  38.49 
 
 
305 aa  208  9e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1902  pectin acetylesterase  41.79 
 
 
320 aa  206  3e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.501568  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1964  pectin acetylesterase  40.52 
 
 
308 aa  205  7e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.235642  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3552  hypothetical protein  40.37 
 
 
328 aa  205  8e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2039  pectin acetylesterase  38.19 
 
 
314 aa  204  1e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.773427  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2195  pectin acetylesterase  39.43 
 
 
318 aa  204  1e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2905  xylanase  41.15 
 
 
333 aa  192  5e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.641285  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1954  pectin acetylesterase  37.4 
 
 
308 aa  182  6e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0225  pectin acetylesterase  37.16 
 
 
324 aa  180  2e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0473386  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2213  esterase/lipase-like protein  41.42 
 
 
267 aa  177  1e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000722209  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1924  pectin acetylesterase  40.48 
 
 
319 aa  176  5e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000155025  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3038  hypothetical protein  35.82 
 
 
323 aa  171  1e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.463751  normal  0.555394 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0188  Esterase/lipase-like protein  40.43 
 
 
346 aa  169  4e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.871358 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5554  xylanase  37.14 
 
 
286 aa  168  8e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0342677 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2001  xylanase  35.37 
 
 
301 aa  167  1e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.554874 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000919  endo-1,4-beta-xylanase  37.26 
 
 
303 aa  166  2.9999999999999998e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3521  esterase/lipase-like protein  37.97 
 
 
333 aa  165  8e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4537  xylanase  36.07 
 
 
301 aa  165  1.0000000000000001e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0664665  normal  0.680457 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0965  hypothetical protein  35.34 
 
 
337 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1292  hypothetical protein  35.34 
 
 
353 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.10535  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1635  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  35.09 
 
 
326 aa  160  2e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.984034  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2025  Alpha/beta hydrolase  39.29 
 
 
301 aa  159  4e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2181  putative lipase/esterase  39.48 
 
 
258 aa  159  4e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000144182 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2906  xylanase  32.83 
 
 
319 aa  158  1e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2933  hypothetical protein  35 
 
 
342 aa  157  2e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.131666 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1129  putative acetylesterase  35.02 
 
 
328 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2427  endo-1,4-beta-xylanase B  38.72 
 
 
270 aa  157  3e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.740371  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3159  hypothetical protein  35 
 
 
342 aa  156  3e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.526515  normal  0.865494 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0612  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  34.04 
 
 
326 aa  155  6e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.936989  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2345  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  34.04 
 
 
417 aa  154  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0855  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  34.04 
 
 
404 aa  154  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1044  putative acetylesterase  33.68 
 
 
326 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.475385  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0088  hypothetical protein  34.19 
 
 
337 aa  152  8e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3115  hypothetical protein  35 
 
 
342 aa  150  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1921  hypothetical protein  35.53 
 
 
327 aa  148  1.0000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3014  acetyl esterase  37.5 
 
 
277 aa  144  2e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0258039  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1536  hypothetical protein  35.44 
 
 
314 aa  138  8.999999999999999e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0743655 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0181  hypothetical protein  31.6 
 
 
329 aa  137  2e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.799105  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1651  hypothetical protein  32.59 
 
 
339 aa  137  2e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.744803  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3031  hypothetical protein  32.75 
 
 
293 aa  137  3.0000000000000003e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2431  endo-1,4-beta-xylanase  32.28 
 
 
291 aa  135  8e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0212534  normal  0.300404 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1475  esterase/lipase  35.89 
 
 
277 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01948  xylanase  35.29 
 
 
249 aa  133  3e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01320  conserved hypothetical protein  37.61 
 
 
255 aa  129  4.0000000000000003e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000546639  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3784  hypothetical protein  32.52 
 
 
303 aa  130  4.0000000000000003e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000474919 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1260  lipase/esterase family protein  34.82 
 
 
280 aa  124  2e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00119975 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3216  hypothetical protein  31.27 
 
 
317 aa  120  3e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.476052  normal  0.948257 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2402  hypothetical protein  30.06 
 
 
319 aa  117  3e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.344472  normal  0.50924 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1712  esterase/lipase-like protein  29.88 
 
 
334 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2345  hypothetical protein  29.89 
 
 
274 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1216  putative esterase  29.04 
 
 
287 aa  112  9e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.274462  normal  0.128321 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2271  alpha/beta hydrolase  30.18 
 
 
325 aa  110  3e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.368725 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0788  esterase/lipase-like  29.45 
 
 
305 aa  110  3e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.155303  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22340  esterase/lipase  34.31 
 
 
261 aa  110  3e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.308782  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0485  esterase/lipase  29.25 
 
 
255 aa  110  4.0000000000000004e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1725  hypothetical protein  29.61 
 
 
308 aa  109  7.000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0661  esterase/lipase-like protein  29.81 
 
 
371 aa  84.3  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0519166  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0112  esterase/lipase  28.86 
 
 
272 aa  84.3  0.000000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  7.81923e-16 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0810  hypothetical protein  27.7 
 
 
275 aa  84  0.000000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0809  xylanase  29.2 
 
 
262 aa  80.5  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2589  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  30.81 
 
 
300 aa  77.4  0.0000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.719605  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2516  Esterase/lipase-like protein  29.1 
 
 
329 aa  74.3  0.000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.228669  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1549  esterase/lipase-like protein  23.4 
 
 
238 aa  70.5  0.00000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1051  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  28.63 
 
 
349 aa  69.7  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.696352  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3795  esterase/lipase  27.4 
 
 
300 aa  69.7  0.00000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.662401  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1585  dienelactone hydrolase  27.07 
 
 
323 aa  69.7  0.00000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.144212  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4730  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  28.97 
 
 
288 aa  68.6  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.788247  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0221  lipase/esterase  27.16 
 
 
340 aa  68.6  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4253  esterase/lipase-like protein  24.39 
 
 
318 aa  67.8  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.172615  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2611  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  25.62 
 
 
308 aa  65.9  0.0000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.985192 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0640  Alpha/beta hydrolase  25 
 
 
303 aa  65.1  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.225482 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0436  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  24.69 
 
 
422 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.310038 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1433  exported protein precursor  24.19 
 
 
326 aa  65.1  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2030  Esterase/lipase-like protein  35.04 
 
 
593 aa  64.7  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0135331  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1910  hypothetical protein  25.68 
 
 
334 aa  64.3  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.810251  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1801  hypothetical protein  25.68 
 
 
334 aa  63.9  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4020  hypothetical protein  26.75 
 
 
325 aa  63.5  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00949224 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2205  hypothetical protein  26.52 
 
 
322 aa  63.2  0.000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.900633 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4875  putative lipase/esterase  30.59 
 
 
269 aa  62.4  0.000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00397  carboxylesterase  25.91 
 
 
309 aa  61.6  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3176  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  26.83 
 
 
323 aa  61.6  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.477344  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3898  hypothetical protein  24.76 
 
 
358 aa  62.4  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2156  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  27.23 
 
 
311 aa  62  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0486  Pectinesterase  27.24 
 
 
644 aa  61.6  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.536234  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0231  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  23.73 
 
 
412 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.104607 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0015  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  24.91 
 
 
344 aa  61.2  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2672  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  25.75 
 
 
309 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.795558  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2759  Alpha/beta hydrolase fold-3  27.2 
 
 
336 aa  60.5  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0204  LipO  26.13 
 
 
414 aa  60.5  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0213  LipO  26.13 
 
 
414 aa  60.5  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.715409 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0193  LipO  25.79 
 
 
414 aa  60.5  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.630614 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>