189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3550 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3550  alpha/beta hydrolase  100 
 
 		 306 aa  639    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0287748  normal  0.0185565 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1417  esterase/lipase  50.88 
 
 		 310 aa  296  2e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.131998  normal  0.895698 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3894  esterase/lipase-like protein  50.18 
 
 		 301 aa  294  1e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0283  esterase/lipase  47.83 
 
 		 303 aa  278  6e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.375027 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3062  esterase/lipase-like protein  44.23 
 
 		 333 aa  278  1e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.851787  normal  0.36043 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4266  esterase/lipase-like protein  44.48 
 
 		 309 aa  276  3e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.401395  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4918  putative esterase/lipase precursor  46.8 
 
 		 299 aa  271  9e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.220535  normal  0.753644 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1805  Esterase/lipase  47.74 
 
 		 281 aa  241  9e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.90276  hitchhiker  0.0000000160109 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3975  hypothetical protein  42 
 
 		 289 aa  241  1e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1345  alpha/beta hydrolase  43.33 
 
 		 305 aa  233  4.0000000000000004e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1902  pectin acetylesterase  37.79 
 
 		 320 aa  219  6e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.501568  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2195  pectin acetylesterase  37.13 
 
 		 318 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1964  pectin acetylesterase  36.82 
 
 		 308 aa  208  8e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.235642  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2039  pectin acetylesterase  36.39 
 
 		 314 aa  206  5e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.773427  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2905  xylanase  38.28 
 
 		 333 aa  199  3.9999999999999996e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.641285  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1954  pectin acetylesterase  38.49 
 
 		 308 aa  198  9e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1924  pectin acetylesterase  36.93 
 
 		 319 aa  198  1.0000000000000001e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000155025  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3552  hypothetical protein  38.7 
 
 		 328 aa  192  5e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0225  pectin acetylesterase  41.73 
 
 		 324 aa  189  7e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0473386  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2213  esterase/lipase-like protein  43.48 
 
 		 267 aa  182  5.0000000000000004e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000722209  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0188  Esterase/lipase-like protein  36.5 
 
 		 346 aa  182  5.0000000000000004e-45  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.871358 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0088  hypothetical protein  40 
 
 		 337 aa  181  1e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2001  xylanase  36.88 
 
 		 301 aa  179  7e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.554874 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3038  hypothetical protein  38.33 
 
 		 323 aa  178  8e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.463751  normal  0.555394 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000919  endo-1,4-beta-xylanase  36.71 
 
 		 303 aa  178  1e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2933  hypothetical protein  34.72 
 
 		 342 aa  176  5e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.131666 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3159  hypothetical protein  34.72 
 
 		 342 aa  176  6e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.526515  normal  0.865494 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3115  hypothetical protein  35.76 
 
 		 342 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4537  xylanase  36.36 
 
 		 301 aa  173  2.9999999999999996e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0664665  normal  0.680457 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3521  esterase/lipase-like protein  38.49 
 
 		 333 aa  171  1e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5554  xylanase  35.76 
 
 		 286 aa  167  2e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0342677 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2906  xylanase  34.88 
 
 		 319 aa  163  3e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1921  hypothetical protein  35.94 
 
 		 327 aa  162  5.0000000000000005e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1292  hypothetical protein  36.19 
 
 		 353 aa  159  4e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.10535  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0965  hypothetical protein  34.85 
 
 		 337 aa  159  5e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1129  putative acetylesterase  33.33 
 
 		 328 aa  159  7e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2181  putative lipase/esterase  40 
 
 		 258 aa  157  2e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000144182 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0612  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  33.68 
 
 		 326 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.936989  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2345  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  33.68 
 
 		 417 aa  155  7e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0855  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  33.68 
 
 		 404 aa  155  7e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2025  Alpha/beta hydrolase  38.55 
 
 		 301 aa  155  9e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1635  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  33.45 
 
 		 326 aa  154  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.984034  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1044  putative acetylesterase  33.33 
 
 		 326 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.475385  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2427  endo-1,4-beta-xylanase B  38.79 
 
 		 270 aa  145  6e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.740371  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01320  conserved hypothetical protein  35.78 
 
 		 255 aa  142  7e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000546639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1536  hypothetical protein  33.45 
 
 		 314 aa  139  6e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0743655 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2431  endo-1,4-beta-xylanase  32.8 
 
 		 291 aa  137  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0212534  normal  0.300404 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1712  esterase/lipase-like protein  33.33 
 
 		 334 aa  135  6.0000000000000005e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3031  hypothetical protein  34.01 
 
 		 293 aa  134  9.999999999999999e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0181  hypothetical protein  32.94 
 
 		 329 aa  133  3e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.799105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1651  hypothetical protein  30.77 
 
 		 339 aa  132  9e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.744803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3784  hypothetical protein  33.46 
 
 		 303 aa  122  7e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000474919 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01948  xylanase  34.55 
 
 		 249 aa  122  8e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0485  esterase/lipase  31.43 
 
 		 255 aa  120  3e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3014  acetyl esterase  32.1 
 
 		 277 aa  113  4.0000000000000004e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0258039  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2402  hypothetical protein  31.1 
 
 		 319 aa  113  4.0000000000000004e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.344472  normal  0.50924 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2345  hypothetical protein  29.67 
 
 		 274 aa  108  9.000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1475  esterase/lipase  31.95 
 
 		 277 aa  108  1e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3216  hypothetical protein  27.69 
 
 		 317 aa  107  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.476052  normal  0.948257 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1260  lipase/esterase family protein  32.61 
 
 		 280 aa  107  3e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00119975 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22340  esterase/lipase  35.74 
 
 		 261 aa  97.4  3e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.308782  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2271  alpha/beta hydrolase  29.5 
 
 		 325 aa  96.7  4e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.368725 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1725  hypothetical protein  28.8 
 
 		 308 aa  94.7  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2589  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  26.71 
 
 		 300 aa  92  1e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.719605  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0809  xylanase  31.56 
 
 		 262 aa  90.5  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1216  putative esterase  27.45 
 
 		 287 aa  90.5  3e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.274462  normal  0.128321 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0788  esterase/lipase-like  26.96 
 
 		 305 aa  89.4  7e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.155303  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0661  esterase/lipase-like protein  29.61 
 
 		 371 aa  85.9  8e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0519166  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0112  esterase/lipase  27.69 
 
 		 272 aa  83.6  0.000000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  7.81923e-16 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3240  hypothetical protein  24.89 
 
 		 333 aa  79.3  0.00000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1433  exported protein precursor  25.54 
 
 		 326 aa  71.6  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3220  hypothetical protein  27.04 
 
 		 336 aa  70.5  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.46717  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3898  hypothetical protein  24.03 
 
 		 358 aa  70.5  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1562  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.92 
 
 		 293 aa  69.7  0.00000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0978  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  29.74 
 
 		 312 aa  69.3  0.00000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.689687  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0221  lipase/esterase  27.41 
 
 		 340 aa  68.6  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0640  Alpha/beta hydrolase  27.13 
 
 		 303 aa  66.6  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.225482 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0015  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  26.15 
 
 		 344 aa  66.2  0.0000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4378  Esterase/lipase-like protein  26 
 
 		 317 aa  65.5  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.222485 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1585  dienelactone hydrolase  32.66 
 
 		 323 aa  63.2  0.000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.144212  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3247  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  25.91 
 
 		 324 aa  62.8  0.000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1034  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  25.65 
 
 		 321 aa  62.4  0.000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4020  hypothetical protein  25.44 
 
 		 325 aa  62  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00949224 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0800  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  25.86 
 
 		 321 aa  62  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1549  esterase/lipase-like protein  24.37 
 
 		 238 aa  60.8  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0436  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  22.03 
 
 		 422 aa  60.1  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.310038 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3176  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  24.69 
 
 		 323 aa  60.5  0.00000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.477344  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1645  Esterase/lipase-like protein  27.02 
 
 		 333 aa  59.7  0.00000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2793  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  24.05 
 
 		 420 aa  58.9  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4875  putative lipase/esterase  28.49 
 
 		 269 aa  58.2  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2030  Esterase/lipase-like protein  35 
 
 		 593 aa  58.2  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0135331  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0440  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  25 
 
 		 409 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.116329  normal  0.623779 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2516  Esterase/lipase-like protein  30.37 
 
 		 329 aa  56.6  0.0000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.228669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0191  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  24.1 
 
 		 407 aa  55.8  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.624051 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0202  Alpha/beta hydrolase fold-3  24.66 
 
 		 407 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0211  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  24.66 
 
 		 407 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1051  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  27.08 
 
 		 349 aa  54.7  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.696352  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1741  esterase/lipase-like protein  22.31 
 
 		 631 aa  54.3  0.000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0611967  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0665  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  23.81 
 
 		 324 aa  53.9  0.000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0810  hypothetical protein  40.74 
 
 		 275 aa  53.5  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>