278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_1260 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_1260  lipase/esterase family protein  100 
 
 
280 aa  581  1.0000000000000001e-165  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00119975 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1475  esterase/lipase  56.79 
 
 
277 aa  318  7e-86  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3014  acetyl esterase  42.09 
 
 
277 aa  241  1e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0258039  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1216  putative esterase  39.46 
 
 
287 aa  188  1e-46  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.274462  normal  0.128321 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2181  putative lipase/esterase  39.84 
 
 
258 aa  177  2e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000144182 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2427  endo-1,4-beta-xylanase B  38.78 
 
 
270 aa  164  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.740371  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2213  esterase/lipase-like protein  38.33 
 
 
267 aa  162  8.000000000000001e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000722209  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4918  putative esterase/lipase precursor  38.86 
 
 
299 aa  146  3e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.220535  normal  0.753644 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2516  Esterase/lipase-like protein  37.5 
 
 
329 aa  145  7.0000000000000006e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.228669  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0112  esterase/lipase  33.21 
 
 
272 aa  145  7.0000000000000006e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  7.81923e-16 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4266  esterase/lipase-like protein  36.89 
 
 
309 aa  142  6e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.401395  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0485  esterase/lipase  31.17 
 
 
255 aa  142  8e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2195  pectin acetylesterase  38.43 
 
 
318 aa  132  5e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0283  esterase/lipase  36.49 
 
 
303 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.375027 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1805  Esterase/lipase  33.61 
 
 
281 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.90276  hitchhiker  0.0000000160109 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3062  esterase/lipase-like protein  36.79 
 
 
333 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.851787  normal  0.36043 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1902  pectin acetylesterase  37.56 
 
 
320 aa  129  8.000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.501568  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1345  alpha/beta hydrolase  36.79 
 
 
305 aa  125  8.000000000000001e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2025  Alpha/beta hydrolase  33.64 
 
 
301 aa  125  8.000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3894  esterase/lipase-like protein  34.82 
 
 
301 aa  124  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1964  pectin acetylesterase  35 
 
 
308 aa  124  2e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.235642  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1954  pectin acetylesterase  33.33 
 
 
308 aa  124  2e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2271  alpha/beta hydrolase  37.98 
 
 
325 aa  122  9e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.368725 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2039  pectin acetylesterase  34.56 
 
 
314 aa  118  9.999999999999999e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.773427  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3552  hypothetical protein  36.11 
 
 
328 aa  114  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1712  esterase/lipase-like protein  33.65 
 
 
334 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01320  conserved hypothetical protein  35.35 
 
 
255 aa  113  3e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000546639  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3521  esterase/lipase-like protein  36.11 
 
 
333 aa  112  9e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000919  endo-1,4-beta-xylanase  34.13 
 
 
303 aa  110  3e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1292  hypothetical protein  35.09 
 
 
353 aa  110  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.10535  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22340  esterase/lipase  33.94 
 
 
261 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.308782  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1417  esterase/lipase  35.07 
 
 
310 aa  109  5e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.131998  normal  0.895698 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0225  pectin acetylesterase  33.33 
 
 
324 aa  108  7.000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0473386  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0965  hypothetical protein  33.92 
 
 
337 aa  107  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1549  esterase/lipase-like protein  32.23 
 
 
238 aa  108  1e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3550  alpha/beta hydrolase  32.61 
 
 
306 aa  107  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0287748  normal  0.0185565 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2933  hypothetical protein  32.44 
 
 
342 aa  106  5e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.131666 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3159  hypothetical protein  32.44 
 
 
342 aa  105  6e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.526515  normal  0.865494 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0809  xylanase  34.25 
 
 
262 aa  105  7e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1921  hypothetical protein  32.93 
 
 
327 aa  105  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1651  hypothetical protein  29.37 
 
 
339 aa  104  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.744803  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1924  pectin acetylesterase  30.59 
 
 
319 aa  102  6e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000155025  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2906  xylanase  28.68 
 
 
319 aa  102  8e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1635  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  31.78 
 
 
326 aa  97.4  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.984034  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3115  hypothetical protein  31.08 
 
 
342 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0188  Esterase/lipase-like protein  30.14 
 
 
346 aa  97.1  3e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.871358 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3975  hypothetical protein  29.86 
 
 
289 aa  96.7  4e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0088  hypothetical protein  30.18 
 
 
337 aa  93.6  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3038  hypothetical protein  31.6 
 
 
323 aa  93.6  3e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.463751  normal  0.555394 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1129  putative acetylesterase  32.05 
 
 
328 aa  92.8  5e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1044  putative acetylesterase  32.31 
 
 
326 aa  92.4  8e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.475385  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1536  hypothetical protein  33.64 
 
 
314 aa  92  9e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0743655 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5554  xylanase  28.79 
 
 
286 aa  92  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0342677 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0612  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  31.88 
 
 
326 aa  91.3  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.936989  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2345  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  31.86 
 
 
417 aa  90.5  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0855  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  31.86 
 
 
404 aa  90.1  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2001  xylanase  30.66 
 
 
301 aa  85.5  8e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.554874 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2905  xylanase  28.44 
 
 
333 aa  82.4  0.000000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.641285  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4537  xylanase  28.4 
 
 
301 aa  82  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0664665  normal  0.680457 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2589  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  30.33 
 
 
300 aa  77  0.0000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.719605  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0181  hypothetical protein  29 
 
 
329 aa  77  0.0000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.799105  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0486  Pectinesterase  27.93 
 
 
644 aa  74.3  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.536234  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0015  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  23.89 
 
 
344 aa  72.8  0.000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4253  esterase/lipase-like protein  23.6 
 
 
318 aa  70.9  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.172615  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3157  esterase/lipase-like  26.36 
 
 
344 aa  70.1  0.00000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1585  dienelactone hydrolase  27.66 
 
 
323 aa  69.3  0.00000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.144212  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3031  hypothetical protein  26.09 
 
 
293 aa  68.9  0.00000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1051  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  26.07 
 
 
349 aa  67.8  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.696352  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0661  esterase/lipase-like protein  25.58 
 
 
371 aa  67.4  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0519166  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1433  exported protein precursor  23.89 
 
 
326 aa  66.6  0.0000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0172  putative esterase  26.78 
 
 
324 aa  67  0.0000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.32739  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2431  endo-1,4-beta-xylanase  23.92 
 
 
291 aa  66.2  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0212534  normal  0.300404 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2850  putative lipase/esterase  25.11 
 
 
308 aa  65.5  0.0000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2156  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  24.64 
 
 
311 aa  64.7  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4875  putative lipase/esterase  27.88 
 
 
269 aa  64.7  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1114  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  33.33 
 
 
380 aa  63.5  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000135139 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0221  lipase/esterase  26.69 
 
 
340 aa  62.8  0.000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0169  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  25.57 
 
 
324 aa  62.8  0.000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0665  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  30.7 
 
 
324 aa  62.4  0.000000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00397  carboxylesterase  25.51 
 
 
309 aa  62.4  0.000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3784  hypothetical protein  26.67 
 
 
303 aa  62.4  0.000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000474919 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1241  putative lipoprotein  31.9 
 
 
328 aa  60.8  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0734572  normal  0.045623 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2402  hypothetical protein  25.62 
 
 
319 aa  60.5  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.344472  normal  0.50924 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12306  esterase lipM  24.38 
 
 
431 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2004  putative esterase/lipase  25.64 
 
 
291 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10222  esterase lipC  24.09 
 
 
403 aa  60.1  0.00000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.480215  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0693  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  26.27 
 
 
347 aa  59.7  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0470894  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0678  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  26.27 
 
 
347 aa  59.7  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.261183  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0978  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  23.81 
 
 
312 aa  59.7  0.00000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.689687  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2793  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  25.97 
 
 
420 aa  59.7  0.00000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01948  xylanase  26.24 
 
 
249 aa  59.3  0.00000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0837  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like  24.11 
 
 
307 aa  58.9  0.00000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0927814  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2611  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  28.72 
 
 
308 aa  58.2  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.985192 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1454  esterase/lipase/thioesterase  26.49 
 
 
411 aa  58.5  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0950589  hitchhiker  0.0024577 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1865  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  25.93 
 
 
338 aa  58.9  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4201  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  26.33 
 
 
645 aa  58.5  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.538787  normal  0.933486 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1647  esterase  34.09 
 
 
300 aa  57.8  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1943  esterase/lipase  28.36 
 
 
306 aa  58.2  0.0000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3795  esterase/lipase  26.42 
 
 
300 aa  57.8  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.662401  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1645  Esterase/lipase-like protein  26.09 
 
 
333 aa  57.8  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>