More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0172 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_0172  putative esterase  100 
 
 
324 aa  662    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.32739  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0169  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  94.75 
 
 
324 aa  635    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3921  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  43.2 
 
 
351 aa  254  1.0000000000000001e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0309  lipase/esterase, putative  36 
 
 
349 aa  214  9.999999999999999e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0678  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.91 
 
 
347 aa  214  9.999999999999999e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.261183  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0693  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.91 
 
 
347 aa  214  9.999999999999999e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0470894  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3173  acetyl esterase, putative  33.84 
 
 
341 aa  210  2e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3188  acetyl esterase, putative  33.53 
 
 
341 aa  206  5e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.210653  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1114  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.36 
 
 
380 aa  195  7e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000135139 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1865  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.87 
 
 
338 aa  189  4e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3093  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  30.17 
 
 
326 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3439  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  30.03 
 
 
326 aa  170  3e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0114  lipase/esterase, putative  28.99 
 
 
339 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0114  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  28.99 
 
 
339 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0733  esterase/lipase  33.94 
 
 
321 aa  121  9.999999999999999e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000565641  normal  0.048904 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1573  esterase/lipase  28.69 
 
 
303 aa  108  1e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1444  Alpha/beta hydrolase fold-3  22.09 
 
 
325 aa  99.8  5e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.290312  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2058  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  27.6 
 
 
369 aa  94.7  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.217976  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3664  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  28.73 
 
 
313 aa  94.7  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0758  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  25.29 
 
 
376 aa  94  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0959861 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1839  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  28.75 
 
 
311 aa  93.6  4e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.166294  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3254  lipase  28.36 
 
 
316 aa  92.8  7e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0525665  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10222  esterase lipC  25.58 
 
 
403 aa  92.8  8e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.480215  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2556  carboxylesterase  30 
 
 
318 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000242453 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0735  esterase  27.99 
 
 
313 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1005  lipase  27.99 
 
 
313 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.50865  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2875  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  29.89 
 
 
310 aa  90.1  4e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.406722  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2793  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.8 
 
 
420 aa  89.4  8e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2733  carboxylesterase  29.58 
 
 
318 aa  89  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.0800200000000004e-18 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3028  esterase/lipase/thioesterase  26.89 
 
 
314 aa  87.8  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0380453  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0640  Alpha/beta hydrolase  25.93 
 
 
303 aa  86.7  5e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.225482 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3507  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  26.1 
 
 
315 aa  85.5  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0144052 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3222  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  26.07 
 
 
316 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.29245  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1086  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  29.92 
 
 
305 aa  84.7  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0217904  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4031  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  25.7 
 
 
312 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.834602  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0226  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  26.61 
 
 
350 aa  85.1  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1511  esterase/lipase-like  24 
 
 
391 aa  84  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000319912  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3667  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  27.72 
 
 
313 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2156  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  28.51 
 
 
311 aa  84  0.000000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1786  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  27.63 
 
 
317 aa  83.2  0.000000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.193562  hitchhiker  0.00646519 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5035  putative esterase/lipase  35.59 
 
 
315 aa  83.6  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.465698  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3182  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  26.07 
 
 
315 aa  83.6  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0324  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  27.83 
 
 
308 aa  83.2  0.000000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1827  lipolytic protein  28.74 
 
 
323 aa  82.8  0.000000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0202  Alpha/beta hydrolase fold-3  23.13 
 
 
407 aa  82.4  0.000000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0211  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  23.13 
 
 
407 aa  82.4  0.000000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3157  esterase/lipase-like  35.59 
 
 
344 aa  82  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2420  Alpha/beta hydrolase fold-3  24.91 
 
 
314 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.40186  normal  0.0240914 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0191  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  23.13 
 
 
407 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.624051 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1624  esterase/lipase  35.77 
 
 
262 aa  82  0.00000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000487066  hitchhiker  0.00875756 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0227  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  24.5 
 
 
407 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.139422 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1999  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  26.37 
 
 
352 aa  81.3  0.00000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.027865 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2828  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  24.75 
 
 
306 aa  81.3  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0689271 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0204  LipO  24.03 
 
 
414 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0193  LipO  24.03 
 
 
414 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.630614 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0213  LipO  24.03 
 
 
414 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.715409 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1772  esterase/lipase protein  26.97 
 
 
344 aa  80.9  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0249  peptidase S15  31.82 
 
 
339 aa  80.9  0.00000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0965302  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1307  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  25.78 
 
 
313 aa  80.5  0.00000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0504826 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1940  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35.17 
 
 
406 aa  80.1  0.00000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0231  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  23.45 
 
 
412 aa  80.1  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.104607 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2672  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  24.31 
 
 
309 aa  80.5  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.795558  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4383  esterase/lipase/thioesterase family protein  29.15 
 
 
300 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1266  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  25.96 
 
 
628 aa  79.7  0.00000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.19561  hitchhiker  0.00155525 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0328  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  25.56 
 
 
311 aa  79.3  0.00000000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.195989  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3312  putative lipase protein  24.53 
 
 
322 aa  79  0.00000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0232342  normal  0.357874 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4747  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  22.92 
 
 
321 aa  79  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.340698 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3383  esterase  24.07 
 
 
319 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.418724  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1430  esterase  24.07 
 
 
319 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.482815  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1906  hypothetical protein  30.85 
 
 
316 aa  79  0.0000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000217511  normal  0.0142831 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2448  esterase  24.07 
 
 
352 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.376855  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1194  carboxylesterase Est2  24.07 
 
 
321 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.5931  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2325  carboxylesterase Est2  24.07 
 
 
321 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.152899  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3795  esterase/lipase  24.9 
 
 
300 aa  79  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.662401  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1921  carboxylesterase Est2  24.07 
 
 
321 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4843  esterase/lipase/thioesterase family protein  27.35 
 
 
302 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4321  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  27.16 
 
 
325 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.164009 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1454  esterase/lipase/thioesterase  27 
 
 
411 aa  77.8  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0950589  hitchhiker  0.0024577 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1004  heroin esterase  28.99 
 
 
317 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.100661  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2159  hypothetical protein  25 
 
 
444 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3167  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  26.25 
 
 
310 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4431  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  27.16 
 
 
325 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.31619  normal  0.530483 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2010  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  26.42 
 
 
335 aa  78.2  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3787  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  27.13 
 
 
322 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1944  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  25.54 
 
 
321 aa  78.2  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3384  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  25.67 
 
 
334 aa  77.4  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10878  normal  0.17727 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0870  putative esterase protein  22.32 
 
 
304 aa  77.4  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.173636  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0436  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  22.95 
 
 
422 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.310038 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3782  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  26.86 
 
 
311 aa  77.4  0.0000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2267  putative esterase/lipase  25.93 
 
 
321 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.170928 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5478  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36.84 
 
 
317 aa  77.8  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.157645 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3735  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  24.4 
 
 
310 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0759445 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2782  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  24.42 
 
 
320 aa  77.4  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2443  putative lipase  28.18 
 
 
292 aa  77  0.0000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0552  acetyl esterase  27.98 
 
 
323 aa  77  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1213  lipolytic protein  23.64 
 
 
309 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.583626  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12306  esterase lipM  23.78 
 
 
431 aa  77  0.0000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1186  Alpha/beta hydrolase fold-3  24.7 
 
 
311 aa  77  0.0000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.102278  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1713  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  26.33 
 
 
329 aa  77  0.0000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.386293  normal  0.298888 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2703  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  24.72 
 
 
316 aa  76.6  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00278676  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>