More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc3312 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc3312  putative lipase protein  100 
 
 		 322 aa  636    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0232342  normal  0.357874 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3507  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  77.74 
 
 		 315 aa  501  1e-141  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0144052 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3182  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  76.9 
 
 		 315 aa  490  1e-137  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3343  lipolytic protein  62.66 
 
 		 318 aa  360  2e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.326128  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3492  Alpha/beta hydrolase fold-3  58.23 
 
 		 318 aa  346  4e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000681544  normal  0.557466 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1213  lipolytic protein  39.68 
 
 		 309 aa  154  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.583626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3653  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.98 
 
 		 308 aa  153  2.9999999999999998e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1307  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.47 
 
 		 313 aa  151  2e-35  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0504826 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0952  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  41.63 
 
 		 318 aa  146  6e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2875  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36.77 
 
 		 310 aa  145  1e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.406722  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3606  putative esterase/lipase  40.25 
 
 		 317 aa  142  5e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0140226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3757  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35.22 
 
 		 311 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.315687 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5462  esterase/lipase/thioesterase  37.4 
 
 		 311 aa  140  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.536989  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1839  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.79 
 
 		 311 aa  139  7e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.166294  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0305  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.2 
 
 		 310 aa  138  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0445  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.52 
 
 		 351 aa  137  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.215683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3028  esterase/lipase/thioesterase  34.11 
 
 		 314 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0380453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1072  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.94 
 
 		 301 aa  137  3.0000000000000003e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1665  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.67 
 
 		 313 aa  136  5e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414824 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1713  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.81 
 
 		 329 aa  135  8e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.386293  normal  0.298888 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0328  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  27.67 
 
 		 311 aa  135  9e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.195989  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1991  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  38.43 
 
 		 320 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2860  carboxylesterase Est2  36.17 
 
 		 321 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.79214  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0314  Alpha/beta hydrolase fold-3  35.28 
 
 		 310 aa  133  3e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0217857  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0324  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.28 
 
 		 310 aa  133  3e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381561  normal  0.441011 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0758  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  34.44 
 
 		 376 aa  133  5e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0959861 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0942  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.71 
 
 		 312 aa  133  5e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.911706  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4942  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  39.36 
 
 		 314 aa  132  6e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0746  Alpha/beta hydrolase fold-3  30.62 
 
 		 331 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.192331 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1430  esterase  38.12 
 
 		 319 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.482815  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2325  carboxylesterase Est2  38.12 
 
 		 321 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.152899  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3383  esterase  38.12 
 
 		 319 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.418724  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1194  carboxylesterase Est2  38.12 
 
 		 321 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.5931  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0983  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  31.33 
 
 		 309 aa  132  1.0000000000000001e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.875721 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1921  carboxylesterase Est2  38.12 
 
 		 321 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2448  esterase  38.12 
 
 		 352 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.376855  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1441  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  34.46 
 
 		 317 aa  130  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2863  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36.99 
 
 		 325 aa  130  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1447  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.88 
 
 		 308 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.47859 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5942  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.86 
 
 		 321 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.268588  normal  0.0941301 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2671  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.25 
 
 		 320 aa  130  3e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.199092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0890  putative lipase  34.69 
 
 		 310 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.120136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1999  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.33 
 
 		 352 aa  130  4.0000000000000003e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.027865 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0880  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35.46 
 
 		 324 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.691733  hitchhiker  0.0000246401 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1670  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.64 
 
 		 309 aa  129  5.0000000000000004e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1856  hypothetical protein  30.43 
 
 		 321 aa  129  5.0000000000000004e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2844  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  33.33 
 
 		 337 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.446939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1023  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  39.75 
 
 		 313 aa  129  7.000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.205112 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12985  lipase/esterase lipN  34.67 
 
 		 376 aa  129  7.000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2672  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.28 
 
 		 309 aa  129  7.000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.795558  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1851  hypothetical protein  30.34 
 
 		 321 aa  129  8.000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2832  esterase/lipase/thioesterase  30.27 
 
 		 334 aa  129  8.000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.378186 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0443  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35.89 
 
 		 371 aa  129  8.000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4552  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.47 
 
 		 307 aa  129  8.000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0574937 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2286  carboxylesterase Est2  37.22 
 
 		 319 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.124272  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1487  putative lipase/esterase  37.59 
 
 		 305 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0809512  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1969  esterase/lipase/thioesterase  32.69 
 
 		 338 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.574416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2525  Alpha/beta hydrolase fold-3  37.69 
 
 		 320 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.253728  hitchhiker  0.0086518 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3113  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36.44 
 
 		 337 aa  127  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.723098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2080  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.46 
 
 		 339 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6777  lipolytic protein  34.66 
 
 		 316 aa  125  7e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3222  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  31.8 
 
 		 316 aa  125  7e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.29245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6181  Alpha/beta hydrolase fold-3  38.21 
 
 		 338 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1898  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.21 
 
 		 338 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2149  esterase  38.01 
 
 		 327 aa  125  9e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.571697  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1872  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.79 
 
 		 321 aa  125  1e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.208365 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3924  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.37 
 
 		 326 aa  125  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.163224  normal  0.0505631 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1654  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.79 
 
 		 356 aa  125  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0299965  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5478  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  38.68 
 
 		 317 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.157645 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1958  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.52 
 
 		 339 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0704762  normal  0.359976 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2782  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  40.56 
 
 		 320 aa  124  2e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1921  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.55 
 
 		 319 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.458098 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3812  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  32.17 
 
 		 339 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.422077  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2623  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35.86 
 
 		 325 aa  124  3e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.04826  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3830  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  32.64 
 
 		 311 aa  123  4e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1376  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.46 
 
 		 319 aa  123  4e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1039  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.11 
 
 		 319 aa  123  4e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.240306  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1766  lipase  31.58 
 
 		 339 aa  123  5e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2703  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.02 
 
 		 316 aa  123  5e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00278676  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2420  Alpha/beta hydrolase fold-3  33.94 
 
 		 314 aa  122  6e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.40186  normal  0.0240914 
 
 
-
 
NC_003296  RS02616  lipase signal peptide protein  33.73 
 
 		 339 aa  122  7e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.83944 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0587  lipase  31.85 
 
 		 337 aa  122  8e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3384  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.37 
 
 		 334 aa  122  9e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10878  normal  0.17727 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4223  putative lipase/esterase  36.54 
 
 		 320 aa  122  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5198  esterase/lipase/thioesterase  36.73 
 
 		 319 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.379534 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1217  esterase/lipase/thioesterase  39.33 
 
 		 312 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.265662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0542  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  31.85 
 
 		 337 aa  122  9.999999999999999e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6313  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  33.72 
 
 		 311 aa  121  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.179325  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1475  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  34.15 
 
 		 326 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.617097  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1772  esterase/lipase protein  38.28 
 
 		 344 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1419  lipolytic protein  37.22 
 
 		 383 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.252701  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1756  lipolytic enzyme  31.91 
 
 		 318 aa  121  1.9999999999999998e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.211028  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1807  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.92 
 
 		 319 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.086728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2094  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  31.82 
 
 		 339 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.317288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3998  esterase/lipase/thioesterase  32.14 
 
 		 337 aa  120  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000526107  normal  0.48129 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2010  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.41 
 
 		 335 aa  120  3e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3121  esterase/lipase/thioesterase  38.22 
 
 		 321 aa  120  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0387  Alpha/beta hydrolase fold-3  33.83 
 
 		 306 aa  120  3e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1944  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.45 
 
 		 321 aa  120  3e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5215  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  38.86 
 
 		 311 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.85138  normal  0.647883 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>