More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2863 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2863  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  100 
 
 		 325 aa  650    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1944  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  68.83 
 
 		 321 aa  413  1e-114  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1713  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  67.42 
 
 		 329 aa  402  1e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.386293  normal  0.298888 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2383  Alpha/beta hydrolase fold-3  64.94 
 
 		 327 aa  402  1e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.150129  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3416  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  69.52 
 
 		 359 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.733003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2525  Alpha/beta hydrolase fold-3  65.26 
 
 		 320 aa  398  9.999999999999999e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.253728  hitchhiker  0.0086518 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1991  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  67.1 
 
 		 320 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3384  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  65.71 
 
 		 334 aa  395  1e-109  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10878  normal  0.17727 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2828  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  67.24 
 
 		 306 aa  381  1e-105  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0689271 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1799  putative esterase/lipase  63.88 
 
 		 320 aa  360  2e-98  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1872  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  59.87 
 
 		 321 aa  358  6e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.208365 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6181  Alpha/beta hydrolase fold-3  59.2 
 
 		 338 aa  334  1e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1898  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  59.2 
 
 		 338 aa  334  1e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1376  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  59.87 
 
 		 319 aa  333  2e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1921  carboxylesterase Est2  55.7 
 
 		 321 aa  333  3e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1194  carboxylesterase Est2  55.7 
 
 		 321 aa  333  3e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.5931  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2325  carboxylesterase Est2  55.7 
 
 		 321 aa  333  3e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.152899  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3383  esterase  55.7 
 
 		 319 aa  332  4e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.418724  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1430  esterase  55.7 
 
 		 319 aa  332  4e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.482815  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2448  esterase  55.7 
 
 		 352 aa  332  4e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.376855  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2286  carboxylesterase Est2  55.06 
 
 		 319 aa  329  3e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.124272  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1772  esterase/lipase protein  52.58 
 
 		 344 aa  326  3e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1475  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  53.94 
 
 		 326 aa  326  4.0000000000000003e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.617097  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2149  esterase  56.19 
 
 		 327 aa  323  3e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.571697  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1434  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  53.31 
 
 		 326 aa  322  5e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0842646 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1039  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  55.56 
 
 		 319 aa  322  7e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.240306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1935  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  56.86 
 
 		 319 aa  315  8e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0879113  normal  0.508771 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1921  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  59.87 
 
 		 319 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.458098 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5198  esterase/lipase/thioesterase  58.86 
 
 		 319 aa  311  9e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.379534 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1835  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  58.86 
 
 		 319 aa  311  1e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1807  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  58.53 
 
 		 319 aa  310  2e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.086728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1419  lipolytic protein  53.02 
 
 		 383 aa  308  8e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.252701  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1843  Alpha/beta hydrolase fold-3  52.53 
 
 		 344 aa  306  3e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0838402  normal  0.122403 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2267  putative esterase/lipase  54.18 
 
 		 321 aa  296  3e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.170928 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1090  putative lipase/esterase  54.29 
 
 		 328 aa  259  3e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.644515 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1827  lipolytic protein  44.94 
 
 		 323 aa  257  2e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2860  carboxylesterase Est2  47.49 
 
 		 321 aa  256  3e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.79214  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5942  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  46.33 
 
 		 321 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.268588  normal  0.0941301 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4747  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  49.64 
 
 		 321 aa  252  8.000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.340698 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0942  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  48 
 
 		 312 aa  248  7e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.911706  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4942  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  44.97 
 
 		 314 aa  223  4e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4218  lipase/esterase family protein  44.14 
 
 		 318 aa  217  2e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4223  putative lipase/esterase  43.63 
 
 		 320 aa  215  8e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2512  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.94 
 
 		 317 aa  208  1e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.119667  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1023  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  49.79 
 
 		 313 aa  208  1e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.205112 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2420  Alpha/beta hydrolase fold-3  43.15 
 
 		 314 aa  206  4e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.40186  normal  0.0240914 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5462  esterase/lipase/thioesterase  43.4 
 
 		 311 aa  204  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.536989  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3028  esterase/lipase/thioesterase  41.33 
 
 		 314 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0380453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1072  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  41.95 
 
 		 301 aa  204  2e-51  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2464  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  43.65 
 
 		 317 aa  199  5e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000166142  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3121  esterase/lipase/thioesterase  41.33 
 
 		 321 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2875  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  39.81 
 
 		 310 aa  196  4.0000000000000005e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.406722  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1307  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.74 
 
 		 313 aa  196  6e-49  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0504826 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0613  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.68 
 
 		 312 aa  195  8.000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0328  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  38.81 
 
 		 311 aa  194  1e-48  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.195989  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3090  esterase/lipase/thioesterase  42.01 
 
 		 312 aa  195  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.110672 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2703  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  43.15 
 
 		 316 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00278676  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4256  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  42.38 
 
 		 347 aa  191  1e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0760103  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3787  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.75 
 
 		 322 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2632  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.42 
 
 		 338 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.275441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3543  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.93 
 
 		 315 aa  189  4e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.560296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0983  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.97 
 
 		 309 aa  186  5e-46  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.875721 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3653  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  45.52 
 
 		 308 aa  185  8e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0890  putative lipase  38.96 
 
 		 310 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.120136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3098  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.36 
 
 		 338 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.387961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2661  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.74 
 
 		 325 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3269  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  42.07 
 
 		 328 aa  184  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1654  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  42.25 
 
 		 356 aa  183  3e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0299965  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2010  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.17 
 
 		 335 aa  183  4.0000000000000006e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2671  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.6 
 
 		 320 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.199092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1665  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  42.18 
 
 		 313 aa  182  6e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414824 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5215  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  40.98 
 
 		 311 aa  182  9.000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.85138  normal  0.647883 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12985  lipase/esterase lipN  45.9 
 
 		 376 aa  181  1e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7998  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.5 
 
 		 316 aa  181  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4552  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.85 
 
 		 307 aa  181  1e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0574937 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4884  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  41.1 
 
 		 289 aa  180  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3757  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35.14 
 
 		 311 aa  180  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.315687 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5478  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  41.64 
 
 		 317 aa  181  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.157645 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2306  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.36 
 
 		 307 aa  180  2.9999999999999997e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1920  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  49.37 
 
 		 340 aa  179  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.884364 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1999  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40 
 
 		 352 aa  179  5.999999999999999e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.027865 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2662  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  44.09 
 
 		 313 aa  179  5.999999999999999e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000201414 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0305  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.34 
 
 		 310 aa  178  1e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1249  esterase/lipase  33.96 
 
 		 365 aa  176  4e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0945507  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1856  hypothetical protein  34.78 
 
 		 321 aa  175  9e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1969  esterase/lipase/thioesterase  36.93 
 
 		 338 aa  175  9e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.574416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1620  lipolytic protein  44.02 
 
 		 312 aa  175  9e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0105415  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2844  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  38.61 
 
 		 337 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.446939  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1851  hypothetical protein  34.45 
 
 		 321 aa  174  9.999999999999999e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3222  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.01 
 
 		 316 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.29245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1839  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  40.61 
 
 		 311 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.166294  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2443  putative lipase  36.88 
 
 		 292 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7511  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.34 
 
 		 315 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1940  Alpha/beta hydrolase fold-3  48.94 
 
 		 375 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.50518  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1986  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  48.94 
 
 		 375 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3812  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.41 
 
 		 339 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.422077  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36320  esterase/lipase  43.08 
 
 		 353 aa  172  5e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2517  Alpha/beta hydrolase fold-3  39.49 
 
 		 323 aa  172  5e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3428  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  40.91 
 
 		 322 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2080  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.56 
 
 		 339 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>