More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_3543 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_3543  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  100 
 
 
315 aa  639    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.560296  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3787  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  57.99 
 
 
322 aa  346  4e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2860  carboxylesterase Est2  46.43 
 
 
321 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.79214  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1827  lipolytic protein  42.99 
 
 
323 aa  242  5e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4218  lipase/esterase family protein  44.03 
 
 
318 aa  229  3e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1713  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  45.76 
 
 
329 aa  224  1e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.386293  normal  0.298888 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1991  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  45.76 
 
 
320 aa  224  1e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1090  putative lipase/esterase  43.57 
 
 
328 aa  221  8e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.644515 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2149  esterase  42.11 
 
 
327 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.571697  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1194  carboxylesterase Est2  42.72 
 
 
321 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.5931  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2325  carboxylesterase Est2  42.72 
 
 
321 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.152899  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1921  carboxylesterase Est2  42.72 
 
 
321 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1430  esterase  42.72 
 
 
319 aa  215  8e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.482815  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3383  esterase  42.72 
 
 
319 aa  215  8e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.418724  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2448  esterase  42.72 
 
 
352 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.376855  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2286  carboxylesterase Est2  42.05 
 
 
319 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.124272  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4747  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  45.7 
 
 
321 aa  212  4.9999999999999996e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.340698 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1872  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  42.2 
 
 
321 aa  208  9e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.208365 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2828  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  43.97 
 
 
306 aa  208  9e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0689271 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3384  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  44.53 
 
 
334 aa  207  2e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10878  normal  0.17727 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1944  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  42.49 
 
 
321 aa  206  5e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1376  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  42.05 
 
 
319 aa  206  5e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3416  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  42.55 
 
 
359 aa  202  4e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.733003  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2267  putative esterase/lipase  40.13 
 
 
321 aa  202  8e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.170928 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1935  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  40.07 
 
 
319 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0879113  normal  0.508771 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1799  putative esterase/lipase  43.54 
 
 
320 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0942  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  41.38 
 
 
312 aa  193  3e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.911706  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2383  Alpha/beta hydrolase fold-3  39.43 
 
 
327 aa  193  3e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.150129  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6181  Alpha/beta hydrolase fold-3  39.74 
 
 
338 aa  192  5e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1898  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.74 
 
 
338 aa  192  5e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1419  lipolytic protein  39 
 
 
383 aa  192  9e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.252701  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2863  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  39.93 
 
 
325 aa  189  4e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1772  esterase/lipase protein  36.79 
 
 
344 aa  189  5e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1039  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.95 
 
 
319 aa  187  3e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.240306  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2525  Alpha/beta hydrolase fold-3  37.72 
 
 
320 aa  187  3e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.253728  hitchhiker  0.0086518 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1835  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.07 
 
 
319 aa  187  3e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3028  esterase/lipase/thioesterase  37.37 
 
 
314 aa  186  4e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0380453  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1807  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.74 
 
 
319 aa  186  4e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.086728  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1434  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35.81 
 
 
326 aa  186  5e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0842646 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4223  putative lipase/esterase  38.39 
 
 
320 aa  185  8e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4942  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  41.73 
 
 
314 aa  184  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1921  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.74 
 
 
319 aa  183  3e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.458098 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5198  esterase/lipase/thioesterase  39.4 
 
 
319 aa  181  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.379534 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2703  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  38.62 
 
 
316 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00278676  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2420  Alpha/beta hydrolase fold-3  37.72 
 
 
314 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.40186  normal  0.0240914 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1475  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  34.89 
 
 
326 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.617097  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1843  Alpha/beta hydrolase fold-3  36.36 
 
 
344 aa  178  9e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0838402  normal  0.122403 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3064  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  40.19 
 
 
355 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000554719  hitchhiker  0.000820909 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5478  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  43.42 
 
 
317 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.157645 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5215  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  43.42 
 
 
311 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.85138  normal  0.647883 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1654  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.21 
 
 
356 aa  169  8e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0299965  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2782  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.78 
 
 
320 aa  168  1e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2010  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.94 
 
 
335 aa  165  6.9999999999999995e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5942  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.57 
 
 
321 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.268588  normal  0.0941301 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3653  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  43.37 
 
 
308 aa  164  3e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0604  esterase/lipase-like protein  37.5 
 
 
346 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000548029 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2306  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.72 
 
 
307 aa  162  5.0000000000000005e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2512  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36.15 
 
 
317 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.119667  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6777  lipolytic protein  36.25 
 
 
316 aa  161  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2875  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  41.04 
 
 
310 aa  160  3e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.406722  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1999  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.56 
 
 
352 aa  159  6e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.027865 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0890  putative lipase  34.29 
 
 
310 aa  159  8e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.120136  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1487  putative lipase/esterase  38.58 
 
 
305 aa  158  1e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0809512  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5462  esterase/lipase/thioesterase  36.79 
 
 
311 aa  158  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.536989  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1839  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  40.09 
 
 
311 aa  157  2e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.166294  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1213  lipolytic protein  38.19 
 
 
309 aa  157  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.583626  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3606  putative esterase/lipase  36.05 
 
 
317 aa  157  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0140226  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0952  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  38.46 
 
 
318 aa  156  3e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3121  esterase/lipase/thioesterase  35.29 
 
 
321 aa  156  4e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12985  lipase/esterase lipN  37.18 
 
 
376 aa  156  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2006  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36.84 
 
 
352 aa  155  7e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.368207  normal  0.502337 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7998  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  38.78 
 
 
316 aa  155  8e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0443  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  41.71 
 
 
371 aa  155  1e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0613  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.33 
 
 
312 aa  155  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2443  putative lipase  39.85 
 
 
292 aa  154  2e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36320  esterase/lipase  36.7 
 
 
353 aa  153  2.9999999999999998e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1023  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  38.06 
 
 
313 aa  154  2.9999999999999998e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.205112 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3428  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  38.57 
 
 
322 aa  153  4e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1665  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.34 
 
 
313 aa  153  4e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.414824 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4256  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  43.1 
 
 
347 aa  152  5.9999999999999996e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0760103  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0305  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.84 
 
 
310 aa  152  7e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1549  Alpha/beta hydrolase fold-3  37.35 
 
 
315 aa  151  1e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.149777  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2162  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  41.23 
 
 
371 aa  151  1e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1620  lipolytic protein  40.42 
 
 
312 aa  150  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0105415  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0314  Alpha/beta hydrolase fold-3  36.03 
 
 
310 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0217857  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0324  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.03 
 
 
310 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381561  normal  0.441011 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4203  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.29 
 
 
375 aa  149  5e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.307246  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3757  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  34.04 
 
 
311 aa  149  6e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.315687 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0328  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  32.53 
 
 
311 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.195989  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2632  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.73 
 
 
338 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.275441  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3269  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  35.33 
 
 
328 aa  147  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0983  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.4 
 
 
309 aa  146  4.0000000000000006e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.875721 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1217  esterase/lipase/thioesterase  36.03 
 
 
312 aa  146  5e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.265662  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0445  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.41 
 
 
351 aa  146  5e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.215683  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4884  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.79 
 
 
289 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3867  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.85 
 
 
310 aa  145  7.0000000000000006e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.695714  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2080  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.71 
 
 
339 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2888  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.67 
 
 
315 aa  145  1e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.564555  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0542  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.1 
 
 
337 aa  144  2e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0587  lipase  33.1 
 
 
337 aa  144  2e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>