More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2420 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_2420  Alpha/beta hydrolase fold-3  100 
 
 		 314 aa  637    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.40186  normal  0.0240914 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3028  esterase/lipase/thioesterase  90.76 
 
 		 314 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0380453  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2703  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  85.13 
 
 		 316 aa  535  1e-151  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00278676  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4223  putative lipase/esterase  77.07 
 
 		 320 aa  486  1e-136  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0942  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  54.1 
 
 		 312 aa  316  3e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.911706  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2010  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  50.16 
 
 		 335 aa  281  9e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4942  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  48.87 
 
 		 314 aa  280  3e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3121  esterase/lipase/thioesterase  47.73 
 
 		 321 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5462  esterase/lipase/thioesterase  49.15 
 
 		 311 aa  267  1e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.536989  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3222  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.1 
 
 		 316 aa  247  1e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.29245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3428  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  44.19 
 
 		 322 aa  241  7.999999999999999e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1441  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  43.23 
 
 		 317 aa  239  4e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1213  lipolytic protein  44.79 
 
 		 309 aa  239  4e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.583626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0758  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  42.72 
 
 		 376 aa  239  5e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0959861 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0890  putative lipase  44.52 
 
 		 310 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.120136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2671  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.46 
 
 		 320 aa  235  7e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.199092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0952  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  43.69 
 
 		 318 aa  232  6e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1839  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  48.92 
 
 		 311 aa  230  3e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.166294  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7998  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  42.96 
 
 		 316 aa  229  6e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0604  esterase/lipase-like protein  41.58 
 
 		 346 aa  228  1e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000548029 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4031  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.03 
 
 		 312 aa  225  6e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.834602  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2875  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  42.44 
 
 		 310 aa  224  1e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.406722  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4203  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  46.79 
 
 		 375 aa  222  7e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.307246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1307  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  46.62 
 
 		 313 aa  221  9e-57  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0504826 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1827  lipolytic protein  40.26 
 
 		 323 aa  220  1.9999999999999999e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2006  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  48.91 
 
 		 352 aa  220  3e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.368207  normal  0.502337 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3830  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  47.58 
 
 		 311 aa  219  3e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1713  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  44.48 
 
 		 329 aa  219  5e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.386293  normal  0.298888 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0328  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  41.7 
 
 		 311 aa  218  1e-55  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.195989  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1039  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  42.03 
 
 		 319 aa  218  1e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.240306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1665  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  44.26 
 
 		 313 aa  218  1e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414824 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6181  Alpha/beta hydrolase fold-3  42.81 
 
 		 338 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1898  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  42.81 
 
 		 338 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1991  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  44.15 
 
 		 320 aa  218  1e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3269  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  45.67 
 
 		 328 aa  217  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4552  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  43.29 
 
 		 307 aa  217  2e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0574937 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2517  Alpha/beta hydrolase fold-3  42.77 
 
 		 323 aa  217  2e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2443  putative lipase  42.16 
 
 		 292 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0305  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  41.69 
 
 		 310 aa  216  4e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2782  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  42.36 
 
 		 320 aa  216  5e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2662  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  49.59 
 
 		 313 aa  215  7e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000201414 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2599  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  45.07 
 
 		 370 aa  214  9.999999999999999e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0983  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  41.42 
 
 		 309 aa  213  1.9999999999999998e-54  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.875721 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5478  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  48.5 
 
 		 317 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.157645 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0314  Alpha/beta hydrolase fold-3  41.37 
 
 		 310 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0217857  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0324  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  41.37 
 
 		 310 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381561  normal  0.441011 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4884  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  42.32 
 
 		 289 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3416  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  43.62 
 
 		 359 aa  212  4.9999999999999996e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.733003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0301  Alpha/beta hydrolase fold-3  43.23 
 
 		 316 aa  212  7e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.234929  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0311  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  43.23 
 
 		 316 aa  212  7e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.207526 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3757  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  41.32 
 
 		 311 aa  211  9e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.315687 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1654  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  41.94 
 
 		 356 aa  211  1e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0299965  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1920  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  50.2 
 
 		 340 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.884364 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4562  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  41.99 
 
 		 314 aa  210  3e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0210924  normal  0.223571 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1921  carboxylesterase Est2  40.31 
 
 		 321 aa  209  4e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2325  carboxylesterase Est2  40.31 
 
 		 321 aa  209  4e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.152899  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5215  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  47.21 
 
 		 311 aa  209  4e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.85138  normal  0.647883 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2888  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.26 
 
 		 315 aa  209  4e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.564555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1194  carboxylesterase Est2  40.31 
 
 		 321 aa  209  4e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.5931  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1072  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  43.02 
 
 		 301 aa  209  5e-53  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2448  esterase  40.51 
 
 		 352 aa  209  5e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.376855  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1430  esterase  40.51 
 
 		 319 aa  209  6e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.482815  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3383  esterase  40.51 
 
 		 319 aa  209  6e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.418724  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0292  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  42.58 
 
 		 316 aa  208  1e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2149  esterase  40.52 
 
 		 327 aa  207  1e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.571697  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36320  esterase/lipase  42.8 
 
 		 353 aa  208  1e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1772  esterase/lipase protein  39.93 
 
 		 344 aa  207  2e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1376  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  42.03 
 
 		 319 aa  207  2e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1487  putative lipase/esterase  45.83 
 
 		 305 aa  206  4e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0809512  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2863  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  43.15 
 
 		 325 aa  206  4e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1023  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  48.77 
 
 		 313 aa  206  4e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.205112 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2828  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  43.15 
 
 		 306 aa  206  4e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0689271 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1940  Alpha/beta hydrolase fold-3  49.4 
 
 		 375 aa  206  4e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.50518  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1986  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  49.4 
 
 		 375 aa  206  4e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1944  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  43.1 
 
 		 321 aa  206  4e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1333  putative lipase  41.77 
 
 		 328 aa  206  5e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0109525 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2286  carboxylesterase Est2  39.56 
 
 		 319 aa  206  5e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.124272  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2525  Alpha/beta hydrolase fold-3  43.75 
 
 		 320 aa  206  6e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.253728  hitchhiker  0.0086518 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1935  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  41.02 
 
 		 319 aa  205  6e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0879113  normal  0.508771 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2512  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  40.34 
 
 		 317 aa  205  7e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.119667  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0645  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  41.02 
 
 		 349 aa  205  8e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.575771 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2479  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  47.56 
 
 		 313 aa  205  8e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.26249  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1475  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  39.67 
 
 		 326 aa  204  1e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.617097  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1555  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  43.15 
 
 		 316 aa  204  1e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12985  lipase/esterase lipN  43.39 
 
 		 376 aa  204  2e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2162  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  48.35 
 
 		 371 aa  204  2e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5942  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.73 
 
 		 321 aa  203  3e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.268588  normal  0.0941301 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2072  putative fusion protein  40.2 
 
 		 884 aa  203  3e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.987766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3653  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  46.64 
 
 		 308 aa  203  4e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1872  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  43.61 
 
 		 321 aa  203  4e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.208365 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5283  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  41.21 
 
 		 340 aa  202  4e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.966169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2267  putative esterase/lipase  39.23 
 
 		 321 aa  202  6e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.170928 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0445  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  43 
 
 		 351 aa  201  9.999999999999999e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.215683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1921  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  43.05 
 
 		 319 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.458098 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3113  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  39.93 
 
 		 337 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.723098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4256  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  46.4 
 
 		 347 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0760103  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1843  Alpha/beta hydrolase fold-3  38.16 
 
 		 344 aa  200  3e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0838402  normal  0.122403 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1835  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  42.37 
 
 		 319 aa  200  3e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0880  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  40.14 
 
 		 324 aa  199  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.691733  hitchhiker  0.0000246401 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1419  lipolytic protein  38.82 
 
 		 383 aa  199  5e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.252701  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>