More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3428 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_3428  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  100 
 
 
322 aa  625  1e-178  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7998  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  67.73 
 
 
316 aa  425  1e-118  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3121  esterase/lipase/thioesterase  48.73 
 
 
321 aa  279  4e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0942  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  48.87 
 
 
312 aa  276  3e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.911706  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4942  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  47.9 
 
 
314 aa  260  2e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3028  esterase/lipase/thioesterase  45.48 
 
 
314 aa  259  6e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0380453  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2420  Alpha/beta hydrolase fold-3  44.19 
 
 
314 aa  258  8e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.40186  normal  0.0240914 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4223  putative lipase/esterase  47.39 
 
 
320 aa  258  1e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2703  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  47.39 
 
 
316 aa  248  1e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00278676  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5478  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  47.54 
 
 
317 aa  242  5e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.157645 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5215  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  44.92 
 
 
311 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.85138  normal  0.647883 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5462  esterase/lipase/thioesterase  45.91 
 
 
311 aa  227  3e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.536989  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1713  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  42.86 
 
 
329 aa  216  5e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.386293  normal  0.298888 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1991  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  42.54 
 
 
320 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2010  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  43.14 
 
 
335 aa  213  2.9999999999999995e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2888  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  41.31 
 
 
315 aa  208  8e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.564555  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3830  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  41.92 
 
 
311 aa  208  1e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6181  Alpha/beta hydrolase fold-3  40.14 
 
 
338 aa  208  1e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1898  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.14 
 
 
338 aa  208  1e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1039  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.73 
 
 
319 aa  207  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.240306  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4552  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  43.4 
 
 
307 aa  204  2e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0574937 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1194  carboxylesterase Est2  40.14 
 
 
321 aa  204  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.5931  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1430  esterase  40.14 
 
 
319 aa  204  2e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.482815  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1921  carboxylesterase Est2  40.14 
 
 
321 aa  204  2e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2325  carboxylesterase Est2  40.14 
 
 
321 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.152899  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2448  esterase  40.14 
 
 
352 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.376855  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3383  esterase  40.14 
 
 
319 aa  204  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.418724  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2286  carboxylesterase Est2  40.14 
 
 
319 aa  203  4e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.124272  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1376  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.8 
 
 
319 aa  202  4e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0890  putative lipase  39.81 
 
 
310 aa  202  6e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.120136  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2828  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  43.55 
 
 
306 aa  201  9.999999999999999e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0689271 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2149  esterase  39.46 
 
 
327 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.571697  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1654  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  44.25 
 
 
356 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0299965  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3757  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  39.26 
 
 
311 aa  200  3e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.315687 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1023  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  50 
 
 
313 aa  199  3.9999999999999996e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.205112 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2662  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  48.79 
 
 
313 aa  199  3.9999999999999996e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000201414 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1872  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  42.21 
 
 
321 aa  199  6e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.208365 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2479  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  44.71 
 
 
313 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.26249  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1827  lipolytic protein  38.05 
 
 
323 aa  197  3e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0305  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  41.18 
 
 
310 aa  197  3e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1766  lipase  37.2 
 
 
339 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0314  Alpha/beta hydrolase fold-3  40.83 
 
 
310 aa  196  5.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0217857  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0324  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.83 
 
 
310 aa  196  5.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381561  normal  0.441011 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36320  esterase/lipase  44.4 
 
 
353 aa  195  1e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0952  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  40.51 
 
 
318 aa  195  1e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1487  putative lipase/esterase  44.25 
 
 
305 aa  194  2e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0809512  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1213  lipolytic protein  41.21 
 
 
309 aa  193  3e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.583626  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2080  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.79 
 
 
339 aa  193  4e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3416  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  42.37 
 
 
359 aa  192  5e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.733003  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3098  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.27 
 
 
338 aa  192  6e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.387961  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1944  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  42.29 
 
 
321 aa  192  7e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0880  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  38.24 
 
 
324 aa  192  9e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.691733  hitchhiker  0.0000246401 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3998  esterase/lipase/thioesterase  39.05 
 
 
337 aa  191  1e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000526107  normal  0.48129 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3113  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  38.25 
 
 
337 aa  191  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.723098  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1090  putative lipase/esterase  40.74 
 
 
328 aa  190  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.644515 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2875  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  39.18 
 
 
310 aa  189  5.999999999999999e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.406722  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3090  esterase/lipase/thioesterase  40.7 
 
 
312 aa  188  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.110672 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1839  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  41.42 
 
 
311 aa  188  1e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.166294  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2863  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  40.91 
 
 
325 aa  187  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4321  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.15 
 
 
325 aa  187  2e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.164009 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1555  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  41.36 
 
 
316 aa  187  2e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1921  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.14 
 
 
319 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.458098 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3384  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  42.71 
 
 
334 aa  187  2e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10878  normal  0.17727 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4431  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.15 
 
 
325 aa  187  2e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.31619  normal  0.530483 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2844  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  38.95 
 
 
337 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.446939  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3812  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36.92 
 
 
339 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.422077  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5198  esterase/lipase/thioesterase  40.14 
 
 
319 aa  186  3e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.379534 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4203  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  43.54 
 
 
375 aa  187  3e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.307246  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2094  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.5 
 
 
339 aa  187  3e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.317288  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2671  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.97 
 
 
320 aa  186  3e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.199092  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1958  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.2 
 
 
339 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0704762  normal  0.359976 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2383  Alpha/beta hydrolase fold-3  39.86 
 
 
327 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.150129  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2661  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.89 
 
 
325 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2512  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  39.57 
 
 
317 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.119667  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2782  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  38.19 
 
 
320 aa  184  2.0000000000000003e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1441  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  41.26 
 
 
317 aa  183  3e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1935  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36.73 
 
 
319 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0879113  normal  0.508771 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2632  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.28 
 
 
338 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.275441  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1799  putative esterase/lipase  42.18 
 
 
320 aa  182  6e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3222  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.66 
 
 
316 aa  182  6e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.29245  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0604  esterase/lipase-like protein  39.66 
 
 
346 aa  182  7e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000548029 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2525  Alpha/beta hydrolase fold-3  40.91 
 
 
320 aa  182  9.000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.253728  hitchhiker  0.0086518 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2443  putative lipase  41.58 
 
 
292 aa  181  1e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1969  esterase/lipase/thioesterase  36.17 
 
 
338 aa  181  1e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.574416  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1307  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  42.17 
 
 
313 aa  182  1e-44  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0504826 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6313  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  38.69 
 
 
311 aa  180  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.179325  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1807  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.78 
 
 
319 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.086728  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1835  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.78 
 
 
319 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1856  hypothetical protein  34.93 
 
 
321 aa  180  2.9999999999999997e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1851  hypothetical protein  34.93 
 
 
321 aa  179  4e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0645  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.5 
 
 
349 aa  179  4e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.575771 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2464  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  42.77 
 
 
317 aa  179  5.999999999999999e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000166142  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2860  carboxylesterase Est2  39.43 
 
 
321 aa  179  7e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.79214  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0443  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  44.03 
 
 
371 aa  178  8e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3269  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  41.78 
 
 
328 aa  178  9e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3924  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.46 
 
 
326 aa  177  1e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.163224  normal  0.0505631 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1772  esterase/lipase protein  35.29 
 
 
344 aa  178  1e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6777  lipolytic protein  41.3 
 
 
316 aa  178  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1665  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  42.07 
 
 
313 aa  178  1e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.414824 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1620  lipolytic protein  44.24 
 
 
312 aa  177  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0105415  normal  0.354799 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>