More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2010 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_2010  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  100 
 
 
335 aa  678    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3028  esterase/lipase/thioesterase  50.8 
 
 
314 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0380453  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2420  Alpha/beta hydrolase fold-3  50.16 
 
 
314 aa  281  1e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.40186  normal  0.0240914 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2703  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  52.58 
 
 
316 aa  278  1e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00278676  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4223  putative lipase/esterase  49.35 
 
 
320 aa  261  2e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5462  esterase/lipase/thioesterase  48.97 
 
 
311 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.536989  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4942  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  48.67 
 
 
314 aa  243  3e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0942  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  47 
 
 
312 aa  240  2e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.911706  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0758  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  40.89 
 
 
376 aa  219  3.9999999999999997e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0959861 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0983  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  41.18 
 
 
309 aa  214  1.9999999999999998e-54  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.875721 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1665  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  44.56 
 
 
313 aa  209  4e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.414824 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4552  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  44.44 
 
 
307 aa  209  4e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0574937 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2875  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  42.02 
 
 
310 aa  207  2e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.406722  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1654  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  43.26 
 
 
356 aa  207  2e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0299965  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1713  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  43.3 
 
 
329 aa  206  3e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.386293  normal  0.298888 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1213  lipolytic protein  42.16 
 
 
309 aa  207  3e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.583626  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1827  lipolytic protein  40.44 
 
 
323 aa  205  7e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1920  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  52.24 
 
 
340 aa  205  8e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.884364 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1839  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  44.7 
 
 
311 aa  205  1e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.166294  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1991  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  42.96 
 
 
320 aa  205  1e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1039  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  41.64 
 
 
319 aa  204  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.240306  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1620  lipolytic protein  46.03 
 
 
312 aa  203  3e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0105415  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1772  esterase/lipase protein  41.08 
 
 
344 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1537  lipolytic protein  45.73 
 
 
318 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000528451  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2006  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  46.03 
 
 
352 aa  200  3e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.368207  normal  0.502337 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4203  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  46.25 
 
 
375 aa  199  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.307246  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1940  Alpha/beta hydrolase fold-3  51.43 
 
 
375 aa  199  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.50518  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1986  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  51.43 
 
 
375 aa  199  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0952  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  40.19 
 
 
318 aa  199  5e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3121  esterase/lipase/thioesterase  40.19 
 
 
321 aa  199  5e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1419  lipolytic protein  41.14 
 
 
383 aa  199  6e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.252701  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3428  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  43.14 
 
 
322 aa  199  6e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1376  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  42.18 
 
 
319 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36320  esterase/lipase  47.44 
 
 
353 aa  198  1.0000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1441  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  41.37 
 
 
317 aa  198  1.0000000000000001e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3416  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  42.41 
 
 
359 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.733003  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6777  lipolytic protein  42.52 
 
 
316 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0604  esterase/lipase-like protein  43.51 
 
 
346 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000548029 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1921  carboxylesterase Est2  41.84 
 
 
321 aa  196  7e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2325  carboxylesterase Est2  41.84 
 
 
321 aa  196  7e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.152899  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2162  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  44.14 
 
 
371 aa  195  7e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1194  carboxylesterase Est2  41.84 
 
 
321 aa  196  7e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.5931  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1430  esterase  41.84 
 
 
319 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.482815  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3383  esterase  41.84 
 
 
319 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.418724  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4256  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  45.14 
 
 
347 aa  195  8.000000000000001e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0760103  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2448  esterase  41.84 
 
 
352 aa  195  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.376855  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1475  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  39.56 
 
 
326 aa  195  1e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.617097  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0880  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.07 
 
 
324 aa  194  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.691733  hitchhiker  0.0000246401 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2517  Alpha/beta hydrolase fold-3  43 
 
 
323 aa  194  2e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1872  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  41.69 
 
 
321 aa  193  4e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.208365 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0890  putative lipase  40.98 
 
 
310 aa  193  4e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.120136  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2525  Alpha/beta hydrolase fold-3  41.98 
 
 
320 aa  192  6e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.253728  hitchhiker  0.0086518 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2286  carboxylesterase Est2  41.16 
 
 
319 aa  192  7e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.124272  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0305  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.06 
 
 
310 aa  191  1e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0226  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  51.26 
 
 
350 aa  191  1e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2149  esterase  40.82 
 
 
327 aa  191  1e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.571697  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3757  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  41.18 
 
 
311 aa  192  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.315687 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6181  Alpha/beta hydrolase fold-3  41.3 
 
 
338 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0314  Alpha/beta hydrolase fold-3  39.74 
 
 
310 aa  190  2e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0217857  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1898  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  41.3 
 
 
338 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2479  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  43.99 
 
 
313 aa  190  2e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.26249  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0324  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.74 
 
 
310 aa  190  2e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381561  normal  0.441011 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1999  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.48 
 
 
352 aa  190  2.9999999999999997e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.027865 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1434  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  39.56 
 
 
326 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0842646 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3998  esterase/lipase/thioesterase  37.54 
 
 
337 aa  189  5e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000526107  normal  0.48129 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1935  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  41.16 
 
 
319 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0879113  normal  0.508771 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2828  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  42.36 
 
 
306 aa  189  8e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0689271 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1799  putative esterase/lipase  42.02 
 
 
320 aa  188  9e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1944  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  41.03 
 
 
321 aa  187  2e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0443  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  43.07 
 
 
371 aa  187  2e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2267  putative esterase/lipase  40.88 
 
 
321 aa  187  3e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.170928 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12985  lipase/esterase lipN  42.16 
 
 
376 aa  187  3e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3830  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  40.71 
 
 
311 aa  186  3e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0328  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35.61 
 
 
311 aa  186  4e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.195989  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6313  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  36.6 
 
 
311 aa  186  4e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.179325  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7998  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  41.89 
 
 
316 aa  186  5e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0645  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  41.48 
 
 
349 aa  185  1.0000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.575771 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1843  Alpha/beta hydrolase fold-3  38.87 
 
 
344 aa  183  3e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0838402  normal  0.122403 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2844  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.84 
 
 
337 aa  184  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.446939  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2671  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.01 
 
 
320 aa  184  3e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.199092  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2306  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.07 
 
 
307 aa  183  3e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2863  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  39.17 
 
 
325 aa  183  4.0000000000000006e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1023  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  40 
 
 
313 aa  182  7e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.205112 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1766  lipase  36.82 
 
 
339 aa  182  7e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2782  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  40.97 
 
 
320 aa  182  7e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2860  carboxylesterase Est2  39.43 
 
 
321 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.79214  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5215  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  42.03 
 
 
311 aa  182  9.000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.85138  normal  0.647883 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3098  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.66 
 
 
338 aa  182  9.000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.387961  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2888  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.24 
 
 
315 aa  181  1e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.564555  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2383  Alpha/beta hydrolase fold-3  38.18 
 
 
327 aa  182  1e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.150129  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5478  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  39.93 
 
 
317 aa  181  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.157645 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2443  putative lipase  39.58 
 
 
292 aa  181  2e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5198  esterase/lipase/thioesterase  40.82 
 
 
319 aa  180  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.379534 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1835  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  41.5 
 
 
319 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3113  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36.21 
 
 
337 aa  181  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.723098  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1921  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  41.16 
 
 
319 aa  180  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.458098 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2861  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.85 
 
 
301 aa  181  2e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1807  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  41.16 
 
 
319 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.086728  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2662  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  44.96 
 
 
313 aa  180  2.9999999999999997e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000201414 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3222  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.71 
 
 
316 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.29245  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>