More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2703 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_2703  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  100 
 
 
316 aa  632  1e-180  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00278676  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3028  esterase/lipase/thioesterase  87.03 
 
 
314 aa  558  1e-158  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0380453  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2420  Alpha/beta hydrolase fold-3  85.13 
 
 
314 aa  550  1e-155  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.40186  normal  0.0240914 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4223  putative lipase/esterase  77.22 
 
 
320 aa  483  1e-135  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0942  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  54.97 
 
 
312 aa  313  1.9999999999999998e-84  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.911706  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2010  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  52.58 
 
 
335 aa  293  4e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4942  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  51.17 
 
 
314 aa  281  1e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5462  esterase/lipase/thioesterase  50 
 
 
311 aa  264  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.536989  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3121  esterase/lipase/thioesterase  46.73 
 
 
321 aa  258  7e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3428  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  47.39 
 
 
322 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3222  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.23 
 
 
316 aa  239  4e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.29245  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2671  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.19 
 
 
320 aa  236  4e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.199092  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1213  lipolytic protein  45.4 
 
 
309 aa  235  6e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.583626  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0952  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  44.71 
 
 
318 aa  233  3e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0604  esterase/lipase-like protein  42.96 
 
 
346 aa  232  6e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000548029 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1839  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  50.54 
 
 
311 aa  231  9e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.166294  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1441  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  43.32 
 
 
317 aa  231  2e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2517  Alpha/beta hydrolase fold-3  48.87 
 
 
323 aa  229  3e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2875  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  43.04 
 
 
310 aa  229  4e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.406722  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4203  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  52.48 
 
 
375 aa  229  5e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.307246  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0890  putative lipase  43.83 
 
 
310 aa  229  5e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.120136  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2149  esterase  42.9 
 
 
327 aa  229  7e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.571697  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1039  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  43.62 
 
 
319 aa  226  3e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.240306  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1713  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  45.58 
 
 
329 aa  226  5.0000000000000005e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.386293  normal  0.298888 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7998  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  43.45 
 
 
316 aa  225  8e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4552  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  44.79 
 
 
307 aa  224  1e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0574937 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0758  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  40.45 
 
 
376 aa  224  1e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0959861 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1991  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  45.24 
 
 
320 aa  224  1e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3383  esterase  43.56 
 
 
319 aa  223  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.418724  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1430  esterase  43.56 
 
 
319 aa  223  2e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.482815  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2325  carboxylesterase Est2  43.56 
 
 
321 aa  223  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.152899  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1307  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  48.5 
 
 
313 aa  224  2e-57  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0504826 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6181  Alpha/beta hydrolase fold-3  44.15 
 
 
338 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1194  carboxylesterase Est2  43.56 
 
 
321 aa  223  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.5931  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1921  carboxylesterase Est2  43.56 
 
 
321 aa  223  2e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1898  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  44.15 
 
 
338 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2448  esterase  43.56 
 
 
352 aa  223  4e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.376855  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2662  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  51.24 
 
 
313 aa  222  8e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000201414 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2286  carboxylesterase Est2  42.9 
 
 
319 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.124272  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0328  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  41.33 
 
 
311 aa  221  9.999999999999999e-57  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.195989  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5478  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  50.64 
 
 
317 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.157645 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0305  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  45.52 
 
 
310 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1654  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  45.8 
 
 
356 aa  220  3e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0299965  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1376  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  43.85 
 
 
319 aa  220  3e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1920  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  52.69 
 
 
340 aa  219  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.884364 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3757  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  42.27 
 
 
311 aa  219  5e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.315687 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1665  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  46.21 
 
 
313 aa  219  5e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.414824 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0314  Alpha/beta hydrolase fold-3  44.33 
 
 
310 aa  218  7.999999999999999e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0217857  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0324  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  44.33 
 
 
310 aa  218  7.999999999999999e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381561  normal  0.441011 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3830  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  43.99 
 
 
311 aa  218  8.999999999999998e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0445  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  45 
 
 
351 aa  218  1e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.215683  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1935  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  43.48 
 
 
319 aa  218  1e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0879113  normal  0.508771 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2006  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  49.59 
 
 
352 aa  217  2e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.368207  normal  0.502337 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1827  lipolytic protein  40.38 
 
 
323 aa  217  2e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36320  esterase/lipase  45.39 
 
 
353 aa  217  2e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3416  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  44.41 
 
 
359 aa  216  2.9999999999999998e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.733003  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4884  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  43.4 
 
 
289 aa  216  4e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0645  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  43.39 
 
 
349 aa  215  7e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.575771 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2162  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  46.62 
 
 
371 aa  215  7e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1872  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  44.74 
 
 
321 aa  215  8e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.208365 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4031  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.83 
 
 
312 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.834602  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5215  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  49.36 
 
 
311 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.85138  normal  0.647883 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1940  Alpha/beta hydrolase fold-3  51.92 
 
 
375 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.50518  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1986  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  51.92 
 
 
375 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3269  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  45.49 
 
 
328 aa  213  2.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2828  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  44.18 
 
 
306 aa  212  4.9999999999999996e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0689271 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1944  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  45.94 
 
 
321 aa  212  7e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2512  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  43.21 
 
 
317 aa  211  9e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.119667  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0983  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  41.56 
 
 
309 aa  211  1e-53  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.875721 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2443  putative lipase  42.31 
 
 
292 aa  210  2e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12985  lipase/esterase lipN  46.18 
 
 
376 aa  210  2e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1475  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  39.3 
 
 
326 aa  210  2e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.617097  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2479  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  49.17 
 
 
313 aa  210  3e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.26249  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1835  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  44.15 
 
 
319 aa  210  3e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1807  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  43.81 
 
 
319 aa  209  4e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.086728  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2599  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  46.59 
 
 
370 aa  209  4e-53  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2267  putative esterase/lipase  42.67 
 
 
321 aa  209  4e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.170928 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2782  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  41.58 
 
 
320 aa  209  5e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1487  putative lipase/esterase  45.67 
 
 
305 aa  209  5e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0809512  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1921  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  44.15 
 
 
319 aa  209  5e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.458098 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3653  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  44.01 
 
 
308 aa  208  8e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1772  esterase/lipase protein  38.98 
 
 
344 aa  207  2e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1072  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  44.15 
 
 
301 aa  207  2e-52  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1419  lipolytic protein  39.46 
 
 
383 aa  206  3e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.252701  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5198  esterase/lipase/thioesterase  43.48 
 
 
319 aa  206  6e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.379534 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2888  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  42.21 
 
 
315 aa  206  6e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.564555  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5942  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  41.39 
 
 
321 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.268588  normal  0.0941301 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1333  putative lipase  40.85 
 
 
328 aa  204  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0109525 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4562  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  43.94 
 
 
314 aa  204  2e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0210924  normal  0.223571 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2525  Alpha/beta hydrolase fold-3  44.03 
 
 
320 aa  203  3e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.253728  hitchhiker  0.0086518 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2863  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  43.15 
 
 
325 aa  203  3e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1434  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  39.33 
 
 
326 aa  203  4e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0842646 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2072  putative fusion protein  42.71 
 
 
884 aa  203  4e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.987766  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7511  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  46.99 
 
 
315 aa  202  5e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5283  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  40.2 
 
 
340 aa  202  7e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.966169  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1843  Alpha/beta hydrolase fold-3  39.02 
 
 
344 aa  201  9.999999999999999e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0838402  normal  0.122403 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1555  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  43.45 
 
 
316 aa  200  1.9999999999999998e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1023  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  49.59 
 
 
313 aa  201  1.9999999999999998e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.205112 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3867  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  44.87 
 
 
310 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.695714  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4256  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  46.21 
 
 
347 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0760103  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>