More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1843 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1843  Alpha/beta hydrolase fold-3  100 
 
 		 344 aa  700    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0838402  normal  0.122403 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1419  lipolytic protein  82.72 
 
 		 383 aa  520  1e-146  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.252701  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1772  esterase/lipase protein  68.98 
 
 		 344 aa  463  1e-129  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1475  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  71.11 
 
 		 326 aa  463  1e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.617097  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1434  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  70.79 
 
 		 326 aa  459  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0842646 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1921  carboxylesterase Est2  60 
 
 		 321 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2286  carboxylesterase Est2  60 
 
 		 319 aa  376  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.124272  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1430  esterase  60 
 
 		 319 aa  376  1e-103  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.482815  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2448  esterase  60 
 
 		 352 aa  376  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.376855  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2325  carboxylesterase Est2  60 
 
 		 321 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.152899  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1194  carboxylesterase Est2  60 
 
 		 321 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.5931  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3383  esterase  60 
 
 		 319 aa  376  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.418724  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6181  Alpha/beta hydrolase fold-3  60 
 
 		 338 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1898  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  60 
 
 		 338 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1039  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  58.99 
 
 		 319 aa  361  9e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.240306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1376  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  59.33 
 
 		 319 aa  361  1e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1807  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  61.33 
 
 		 319 aa  359  4e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.086728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1935  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  59.31 
 
 		 319 aa  358  7e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0879113  normal  0.508771 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2267  putative esterase/lipase  59.31 
 
 		 321 aa  358  8e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.170928 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1835  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  61.67 
 
 		 319 aa  358  9e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2149  esterase  58.55 
 
 		 327 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.571697  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5198  esterase/lipase/thioesterase  61 
 
 		 319 aa  353  2e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.379534 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1921  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  60 
 
 		 319 aa  349  3e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.458098 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2383  Alpha/beta hydrolase fold-3  50.62 
 
 		 327 aa  311  6.999999999999999e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.150129  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2863  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  51.27 
 
 		 325 aa  311  1e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1713  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  53.16 
 
 		 329 aa  308  5.9999999999999995e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.386293  normal  0.298888 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1991  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  52.85 
 
 		 320 aa  307  2.0000000000000002e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2525  Alpha/beta hydrolase fold-3  51.38 
 
 		 320 aa  305  8.000000000000001e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.253728  hitchhiker  0.0086518 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1944  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  48.77 
 
 		 321 aa  288  9e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3416  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  50.17 
 
 		 359 aa  286  4e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.733003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2828  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  51.56 
 
 		 306 aa  286  5e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0689271 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3384  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  50.16 
 
 		 334 aa  281  1e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10878  normal  0.17727 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1799  putative esterase/lipase  51.16 
 
 		 320 aa  270  2e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1872  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  48.86 
 
 		 321 aa  270  2.9999999999999997e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.208365 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1827  lipolytic protein  43.44 
 
 		 323 aa  245  6.999999999999999e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4942  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  44.3 
 
 		 314 aa  240  2e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5942  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  42.14 
 
 		 321 aa  238  2e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.268588  normal  0.0941301 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0942  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  42.27 
 
 		 312 aa  231  1e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.911706  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4747  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  46.79 
 
 		 321 aa  230  3e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.340698 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1090  putative lipase/esterase  43.12 
 
 		 328 aa  228  9e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.644515 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2860  carboxylesterase Est2  41.18 
 
 		 321 aa  216  4e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.79214  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3787  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.86 
 
 		 322 aa  215  7e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4218  lipase/esterase family protein  41.94 
 
 		 318 aa  210  2e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4223  putative lipase/esterase  40 
 
 		 320 aa  209  8e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3028  esterase/lipase/thioesterase  38.16 
 
 		 314 aa  202  5e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0380453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1999  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.39 
 
 		 352 aa  201  9.999999999999999e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.027865 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5462  esterase/lipase/thioesterase  42.76 
 
 		 311 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.536989  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2420  Alpha/beta hydrolase fold-3  38.16 
 
 		 314 aa  200  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.40186  normal  0.0240914 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0305  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  41.64 
 
 		 310 aa  194  1e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2703  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  39.02 
 
 		 316 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00278676  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0890  putative lipase  39.31 
 
 		 310 aa  193  4e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.120136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0314  Alpha/beta hydrolase fold-3  41.3 
 
 		 310 aa  192  6e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0217857  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0324  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  41.3 
 
 		 310 aa  192  6e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381561  normal  0.441011 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0328  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  33.33 
 
 		 311 aa  190  2.9999999999999997e-47  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.195989  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1620  lipolytic protein  43.66 
 
 		 312 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0105415  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4552  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.48 
 
 		 307 aa  189  8e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0574937 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0952  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.06 
 
 		 318 aa  188  1e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2875  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  39.59 
 
 		 310 aa  187  2e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.406722  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4203  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  41.91 
 
 		 375 aa  185  9e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.307246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2512  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36.1 
 
 		 317 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.119667  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1072  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.24 
 
 		 301 aa  185  1.0000000000000001e-45  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3090  esterase/lipase/thioesterase  42.44 
 
 		 312 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.110672 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1665  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  41.16 
 
 		 313 aa  184  1.0000000000000001e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414824 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2162  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  42.28 
 
 		 371 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1307  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.27 
 
 		 313 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0504826 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2010  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.87 
 
 		 335 aa  183  3e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0613  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.3 
 
 		 312 aa  183  3e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12985  lipase/esterase lipN  42.59 
 
 		 376 aa  181  1e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1023  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  43.8 
 
 		 313 aa  180  2.9999999999999997e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.205112 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2888  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.39 
 
 		 315 aa  179  4e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.564555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3653  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  41.84 
 
 		 308 aa  180  4e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3543  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.18 
 
 		 315 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.560296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2768  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.03 
 
 		 308 aa  179  7e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.718585 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3121  esterase/lipase/thioesterase  36.96 
 
 		 321 aa  179  8e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4256  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.29 
 
 		 347 aa  178  9e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0760103  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1654  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.46 
 
 		 356 aa  178  1e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0299965  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3269  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  38.91 
 
 		 328 aa  177  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0983  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.61 
 
 		 309 aa  177  2e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.875721 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1920  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  46.3 
 
 		 340 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.884364 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11428  lipase lipH  41.18 
 
 		 319 aa  177  2e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.13371e-22  normal  0.199346 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2782  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36.73 
 
 		 320 aa  177  3e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36320  esterase/lipase  41.06 
 
 		 353 aa  177  3e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7998  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.42 
 
 		 316 aa  175  9e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1940  Alpha/beta hydrolase fold-3  45.91 
 
 		 375 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.50518  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0758  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35.4 
 
 		 376 aa  174  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0959861 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1986  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  45.91 
 
 		 375 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2517  Alpha/beta hydrolase fold-3  39.26 
 
 		 323 aa  173  5e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0880  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  34.28 
 
 		 324 aa  172  5.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.691733  hitchhiker  0.0000246401 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3830  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.93 
 
 		 311 aa  172  1e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3735  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.58 
 
 		 310 aa  172  1e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0759445 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2159  hypothetical protein  41.81 
 
 		 444 aa  171  2e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6777  lipolytic protein  39.11 
 
 		 316 aa  169  6e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1537  lipolytic protein  39.06 
 
 		 318 aa  169  7e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000528451  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1441  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36.73 
 
 		 317 aa  169  8e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2662  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  43.15 
 
 		 313 aa  168  1e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000201414 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0443  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  42.92 
 
 		 371 aa  168  1e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3098  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35 
 
 		 338 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.387961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2844  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36.88 
 
 		 337 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.446939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11429  lipase lipH  39.13 
 
 		 320 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.4414e-17  normal  0.258557 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1487  putative lipase/esterase  41.2 
 
 		 305 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0809512  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>