More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3384 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_3384  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  100 
 
 
334 aa  667    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10878  normal  0.17727 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1713  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  73.46 
 
 
329 aa  444  1.0000000000000001e-124  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.386293  normal  0.298888 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1991  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  73.58 
 
 
320 aa  441  9.999999999999999e-123  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3416  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  67.83 
 
 
359 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.733003  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2383  Alpha/beta hydrolase fold-3  67.95 
 
 
327 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.150129  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2525  Alpha/beta hydrolase fold-3  67.52 
 
 
320 aa  411  1e-114  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.253728  hitchhiker  0.0086518 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1944  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  70.19 
 
 
321 aa  410  1e-113  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2863  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  65.71 
 
 
325 aa  405  1.0000000000000001e-112  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2828  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  70.51 
 
 
306 aa  399  9.999999999999999e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0689271 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1799  putative esterase/lipase  65.77 
 
 
320 aa  365  1e-100  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1872  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  62.34 
 
 
321 aa  362  4e-99  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.208365 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1772  esterase/lipase protein  53.94 
 
 
344 aa  328  9e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1475  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  54.57 
 
 
326 aa  322  4e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.617097  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1430  esterase  55.38 
 
 
319 aa  318  6e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.482815  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2448  esterase  55.38 
 
 
352 aa  318  6e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.376855  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2325  carboxylesterase Est2  55.38 
 
 
321 aa  318  6e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.152899  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3383  esterase  55.38 
 
 
319 aa  318  6e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.418724  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1194  carboxylesterase Est2  55.38 
 
 
321 aa  318  6e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.5931  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1921  carboxylesterase Est2  55.38 
 
 
321 aa  318  6e-86  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1434  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  53.94 
 
 
326 aa  318  1e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0842646 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2286  carboxylesterase Est2  54.75 
 
 
319 aa  315  6e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.124272  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6181  Alpha/beta hydrolase fold-3  53.12 
 
 
338 aa  315  6e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1898  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  53.12 
 
 
338 aa  315  6e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1376  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  55.63 
 
 
319 aa  312  5.999999999999999e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1935  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  56.81 
 
 
319 aa  311  6.999999999999999e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0879113  normal  0.508771 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2149  esterase  54.19 
 
 
327 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.571697  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1419  lipolytic protein  54.36 
 
 
383 aa  305  7e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.252701  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1039  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  53.48 
 
 
319 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.240306  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2267  putative esterase/lipase  55.48 
 
 
321 aa  296  4e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.170928 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1921  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  55.3 
 
 
319 aa  293  2e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.458098 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5198  esterase/lipase/thioesterase  54.64 
 
 
319 aa  292  7e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.379534 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1835  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  53.97 
 
 
319 aa  285  5e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1807  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  53.64 
 
 
319 aa  285  8e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.086728  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1843  Alpha/beta hydrolase fold-3  50.16 
 
 
344 aa  284  1.0000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0838402  normal  0.122403 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1827  lipolytic protein  47.64 
 
 
323 aa  274  2.0000000000000002e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1090  putative lipase/esterase  50.17 
 
 
328 aa  259  4e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.644515 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4747  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  46.91 
 
 
321 aa  257  2e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.340698 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2860  carboxylesterase Est2  47.02 
 
 
321 aa  249  4e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.79214  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5942  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  45 
 
 
321 aa  227  3e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.268588  normal  0.0941301 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0942  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  44.55 
 
 
312 aa  221  9e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.911706  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3543  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  44.89 
 
 
315 aa  217  2e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.560296  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4223  putative lipase/esterase  44.52 
 
 
320 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4218  lipase/esterase family protein  43.84 
 
 
318 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3787  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.68 
 
 
322 aa  209  4e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2512  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  38.98 
 
 
317 aa  209  7e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.119667  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3028  esterase/lipase/thioesterase  42.35 
 
 
314 aa  208  1e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0380453  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2420  Alpha/beta hydrolase fold-3  41.94 
 
 
314 aa  207  3e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.40186  normal  0.0240914 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1023  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  47.54 
 
 
313 aa  206  4e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.205112 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0613  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  41.1 
 
 
312 aa  206  4e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2464  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  47.23 
 
 
317 aa  205  1e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000166142  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4942  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  40.58 
 
 
314 aa  202  5e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7998  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  41.42 
 
 
316 aa  202  7e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2703  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  43.05 
 
 
316 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00278676  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1249  esterase/lipase  35.2 
 
 
365 aa  194  2e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0945507  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2671  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.92 
 
 
320 aa  194  2e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.199092  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2875  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  40.38 
 
 
310 aa  193  3e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.406722  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5478  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  48.72 
 
 
317 aa  191  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.157645 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1307  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  42.86 
 
 
313 aa  191  1e-47  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0504826 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5462  esterase/lipase/thioesterase  39.6 
 
 
311 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.536989  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0983  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.71 
 
 
309 aa  189  5e-47  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.875721 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5215  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  46.15 
 
 
311 aa  189  7e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.85138  normal  0.647883 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4552  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  42.28 
 
 
307 aa  188  9e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0574937 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0305  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.32 
 
 
310 aa  187  3e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2010  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  41.49 
 
 
335 aa  185  8e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0328  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36.94 
 
 
311 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.195989  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4256  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  41.61 
 
 
347 aa  185  1.0000000000000001e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0760103  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2662  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  45.74 
 
 
313 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000201414 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0952  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  41.76 
 
 
318 aa  184  2.0000000000000003e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1072  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.53 
 
 
301 aa  184  2.0000000000000003e-45  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2162  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  44.67 
 
 
371 aa  183  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3428  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  42.71 
 
 
322 aa  182  7e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3090  esterase/lipase/thioesterase  40.44 
 
 
312 aa  182  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.110672 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6777  lipolytic protein  39.22 
 
 
316 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1620  lipolytic protein  43.77 
 
 
312 aa  179  4e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0105415  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0314  Alpha/beta hydrolase fold-3  38.64 
 
 
310 aa  179  4e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0217857  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0324  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.64 
 
 
310 aa  179  4e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381561  normal  0.441011 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3653  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  43.84 
 
 
308 aa  179  5.999999999999999e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3992  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  46.61 
 
 
304 aa  177  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.292538  normal  0.502023 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1665  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.07 
 
 
313 aa  177  2e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.414824 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0890  putative lipase  37.9 
 
 
310 aa  177  3e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.120136  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1333  putative lipase  38.72 
 
 
328 aa  177  3e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0109525 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1920  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  44.44 
 
 
340 aa  176  5e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.884364 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3222  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40 
 
 
316 aa  176  5e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.29245  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0758  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36.14 
 
 
376 aa  176  5e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0959861 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1940  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  39.21 
 
 
325 aa  175  9.999999999999999e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.270718  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36320  esterase/lipase  42.13 
 
 
353 aa  174  1.9999999999999998e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1940  Alpha/beta hydrolase fold-3  43.7 
 
 
375 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.50518  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1986  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  43.7 
 
 
375 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2782  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.42 
 
 
320 aa  174  2.9999999999999996e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3269  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  43.68 
 
 
328 aa  172  5e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2443  putative lipase  38.95 
 
 
292 aa  172  9e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0604  esterase/lipase-like protein  34.54 
 
 
346 aa  171  1e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000548029 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2888  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.1 
 
 
315 aa  171  1e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.564555  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4203  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.85 
 
 
375 aa  171  1e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.307246  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1537  lipolytic protein  45.26 
 
 
318 aa  170  4e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000528451  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6313  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  40.83 
 
 
311 aa  170  4e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.179325  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5283  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.92 
 
 
340 aa  169  5e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.966169  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5286  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.27 
 
 
362 aa  169  5e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.365819  normal  0.925115 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2479  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  43.19 
 
 
313 aa  169  6e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.26249  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12985  lipase/esterase lipN  44.18 
 
 
376 aa  169  6e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>