More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1872 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1872  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  100 
 
 		 321 aa  628  1e-179  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.208365 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1713  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  68.05 
 
 		 329 aa  391  1e-108  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.386293  normal  0.298888 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1991  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  67.73 
 
 		 320 aa  389  1e-107  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3416  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  65.29 
 
 		 359 aa  372  1e-102  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.733003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1799  putative esterase/lipase  69.76 
 
 		 320 aa  368  1e-101  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2828  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  67.59 
 
 		 306 aa  370  1e-101  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0689271 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2863  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  59.87 
 
 		 325 aa  363  1e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1944  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  62.1 
 
 		 321 aa  358  9e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2383  Alpha/beta hydrolase fold-3  60.26 
 
 		 327 aa  354  8.999999999999999e-97  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.150129  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3384  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  62.22 
 
 		 334 aa  352  4e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10878  normal  0.17727 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2525  Alpha/beta hydrolase fold-3  59.28 
 
 		 320 aa  346  3e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.253728  hitchhiker  0.0086518 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1772  esterase/lipase protein  50 
 
 		 344 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2448  esterase  52.53 
 
 		 352 aa  301  7.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.376855  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2325  carboxylesterase Est2  52.53 
 
 		 321 aa  301  7.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.152899  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1194  carboxylesterase Est2  52.53 
 
 		 321 aa  301  7.000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.5931  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1921  carboxylesterase Est2  52.53 
 
 		 321 aa  301  7.000000000000001e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3383  esterase  52.53 
 
 		 319 aa  301  9e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.418724  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1430  esterase  52.53 
 
 		 319 aa  301  9e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.482815  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2286  carboxylesterase Est2  51.9 
 
 		 319 aa  298  9e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.124272  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2149  esterase  52.84 
 
 		 327 aa  294  1e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.571697  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1039  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  50.79 
 
 		 319 aa  293  2e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.240306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6181  Alpha/beta hydrolase fold-3  51.97 
 
 		 338 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1898  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  51.97 
 
 		 338 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1475  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  48.59 
 
 		 326 aa  290  3e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.617097  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1376  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  52.84 
 
 		 319 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1434  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  48.4 
 
 		 326 aa  286  5e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0842646 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1935  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  50.5 
 
 		 319 aa  276  3e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0879113  normal  0.508771 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1419  lipolytic protein  48.68 
 
 		 383 aa  273  3e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.252701  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2267  putative esterase/lipase  50.5 
 
 		 321 aa  273  3e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.170928 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1843  Alpha/beta hydrolase fold-3  47.96 
 
 		 344 aa  272  5.000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0838402  normal  0.122403 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1835  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  52.17 
 
 		 319 aa  272  6e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1807  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  51.84 
 
 		 319 aa  271  9e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.086728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1921  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  52.84 
 
 		 319 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.458098 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5198  esterase/lipase/thioesterase  51.84 
 
 		 319 aa  268  7e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.379534 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1827  lipolytic protein  46.15 
 
 		 323 aa  250  2e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1090  putative lipase/esterase  47.78 
 
 		 328 aa  245  6.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.644515 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4747  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  45.86 
 
 		 321 aa  233  5e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.340698 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2860  carboxylesterase Est2  46.6 
 
 		 321 aa  231  1e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.79214  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0942  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  43.89 
 
 		 312 aa  224  1e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.911706  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4942  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  45.34 
 
 		 314 aa  221  1.9999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3028  esterase/lipase/thioesterase  43.45 
 
 		 314 aa  217  2e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0380453  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1023  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  43.27 
 
 		 313 aa  212  7e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.205112 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2875  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  41.4 
 
 		 310 aa  211  9e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.406722  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5942  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.67 
 
 		 321 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.268588  normal  0.0941301 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2420  Alpha/beta hydrolase fold-3  43.63 
 
 		 314 aa  207  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.40186  normal  0.0240914 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3543  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  42.2 
 
 		 315 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.560296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5462  esterase/lipase/thioesterase  41.72 
 
 		 311 aa  205  7e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.536989  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3787  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  43.38 
 
 		 322 aa  205  8e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2703  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  44.48 
 
 		 316 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00278676  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2512  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  40.26 
 
 		 317 aa  204  2e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.119667  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2671  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.05 
 
 		 320 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.199092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0983  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.18 
 
 		 309 aa  201  9.999999999999999e-51  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.875721 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4223  putative lipase/esterase  44.73 
 
 		 320 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5478  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  44.29 
 
 		 317 aa  199  5e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.157645 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4884  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  42.65 
 
 		 289 aa  199  6e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4256  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  48.37 
 
 		 347 aa  198  7.999999999999999e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0760103  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5215  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  48.93 
 
 		 311 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.85138  normal  0.647883 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1072  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.2 
 
 		 301 aa  197  2.0000000000000003e-49  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2162  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  43.54 
 
 		 371 aa  196  3e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2010  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.71 
 
 		 335 aa  196  5.000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3222  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.42 
 
 		 316 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.29245  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4218  lipase/esterase family protein  42.04 
 
 		 318 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3269  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  43.55 
 
 		 328 aa  192  8e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4031  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.5 
 
 		 312 aa  189  5e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.834602  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1665  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  41.98 
 
 		 313 aa  189  5.999999999999999e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414824 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3121  esterase/lipase/thioesterase  40.88 
 
 		 321 aa  189  8e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3113  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  40.34 
 
 		 337 aa  189  8e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.723098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4203  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  41.64 
 
 		 375 aa  186  3e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.307246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2464  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  46.21 
 
 		 317 aa  186  5e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000166142  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0328  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  34.89 
 
 		 311 aa  185  7e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.195989  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3653  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  44.44 
 
 		 308 aa  185  8e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3428  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  41.77 
 
 		 322 aa  185  8e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2844  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  39.32 
 
 		 337 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.446939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1620  lipolytic protein  45.56 
 
 		 312 aa  182  6e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0105415  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6313  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  43.8 
 
 		 311 aa  182  6e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.179325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0613  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.83 
 
 		 312 aa  181  1e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1213  lipolytic protein  41.67 
 
 		 309 aa  181  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.583626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3757  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36.39 
 
 		 311 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.315687 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1920  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  45.15 
 
 		 340 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.884364 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2006  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  41.45 
 
 		 352 aa  178  1e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.368207  normal  0.502337 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1839  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  43.02 
 
 		 311 aa  178  1e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.166294  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1766  lipase  36.25 
 
 		 339 aa  177  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3998  esterase/lipase/thioesterase  37.1 
 
 		 337 aa  177  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000526107  normal  0.48129 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12985  lipase/esterase lipN  43.18 
 
 		 376 aa  177  2e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0880  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  38.8 
 
 		 324 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.691733  hitchhiker  0.0000246401 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1537  lipolytic protein  44 
 
 		 318 aa  177  3e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000528451  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1307  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.1 
 
 		 313 aa  175  7e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0504826 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1940  Alpha/beta hydrolase fold-3  45.82 
 
 		 375 aa  176  7e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.50518  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1986  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  45.82 
 
 		 375 aa  176  7e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2782  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36.51 
 
 		 320 aa  174  9.999999999999999e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0952  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.83 
 
 		 318 aa  174  9.999999999999999e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1447  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.98 
 
 		 308 aa  174  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.47859 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0645  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.18 
 
 		 349 aa  174  1.9999999999999998e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.575771 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0305  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.49 
 
 		 310 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3830  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  39.51 
 
 		 311 aa  174  1.9999999999999998e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2787  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  35.21 
 
 		 328 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.528915  normal  0.113664 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2316  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35.49 
 
 		 321 aa  173  2.9999999999999996e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5770  Alpha/beta hydrolase fold-3  37.37 
 
 		 344 aa  172  5e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.950469  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6135  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.37 
 
 		 344 aa  172  5e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.970207  normal  0.96238 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7998  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  38.49 
 
 		 316 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>