More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0443 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_0443  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  100 
 
 
371 aa  736    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36320  esterase/lipase  49.26 
 
 
353 aa  239  5e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1654  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  43.86 
 
 
356 aa  235  9e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0299965  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4203  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  41.52 
 
 
375 aa  228  2e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.307246  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2162  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  43.9 
 
 
371 aa  218  1e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1920  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  46.49 
 
 
340 aa  217  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.884364 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1940  Alpha/beta hydrolase fold-3  46.15 
 
 
375 aa  213  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.50518  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1986  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  46.15 
 
 
375 aa  213  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4942  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  46.59 
 
 
314 aa  208  9e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0226  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  52.14 
 
 
350 aa  209  9e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1213  lipolytic protein  48.3 
 
 
309 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.583626  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2006  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  47.62 
 
 
352 aa  198  2.0000000000000003e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.368207  normal  0.502337 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2517  Alpha/beta hydrolase fold-3  50.21 
 
 
323 aa  196  4.0000000000000005e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12985  lipase/esterase lipN  38.76 
 
 
376 aa  195  1e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3064  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  42.63 
 
 
355 aa  191  2e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000554719  hitchhiker  0.000820909 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1999  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  46.61 
 
 
352 aa  191  2e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.027865 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0890  putative lipase  46.31 
 
 
310 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.120136  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1537  lipolytic protein  48.13 
 
 
318 aa  189  5e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000528451  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6777  lipolytic protein  44.83 
 
 
316 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0952  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  44.98 
 
 
318 aa  189  7e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0082  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  44.18 
 
 
360 aa  188  1e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0942  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  41.98 
 
 
312 aa  187  2e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.911706  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2010  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  43.07 
 
 
335 aa  187  3e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4256  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  46.81 
 
 
347 aa  186  4e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0760103  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1620  lipolytic protein  46.25 
 
 
312 aa  186  6e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0105415  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3028  esterase/lipase/thioesterase  45 
 
 
314 aa  186  8e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0380453  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5462  esterase/lipase/thioesterase  46.47 
 
 
311 aa  182  9.000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.536989  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2875  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  42.59 
 
 
310 aa  180  4e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.406722  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2306  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.36 
 
 
307 aa  179  9e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2672  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  42.4 
 
 
309 aa  178  1e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.795558  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2782  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  45.57 
 
 
320 aa  178  1e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2420  Alpha/beta hydrolase fold-3  41.31 
 
 
314 aa  178  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.40186  normal  0.0240914 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3121  esterase/lipase/thioesterase  41.35 
 
 
321 aa  178  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1713  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  45.41 
 
 
329 aa  178  2e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.386293  normal  0.298888 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1434  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  41.41 
 
 
326 aa  177  3e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0842646 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0445  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  42.59 
 
 
351 aa  177  3e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.215683  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1991  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  44.98 
 
 
320 aa  176  5e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1475  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  42.25 
 
 
326 aa  176  6e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.617097  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4223  putative lipase/esterase  44.74 
 
 
320 aa  175  9.999999999999999e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3113  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  42.02 
 
 
337 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.723098  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3653  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  42.86 
 
 
308 aa  174  1.9999999999999998e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2512  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  41.88 
 
 
317 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.119667  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2464  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  43.48 
 
 
317 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000166142  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0880  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  40.67 
 
 
324 aa  173  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.691733  hitchhiker  0.0000246401 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2703  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  44.76 
 
 
316 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00278676  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1307  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.42 
 
 
313 aa  173  5e-42  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0504826 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1827  lipolytic protein  43.64 
 
 
323 aa  173  5e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0758  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  44.87 
 
 
376 aa  173  5e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0959861 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4218  lipase/esterase family protein  42.98 
 
 
318 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0983  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  42.99 
 
 
309 aa  172  1e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.875721 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3154  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  43.36 
 
 
292 aa  172  1e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4595  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  41.55 
 
 
305 aa  171  1e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.259573 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4265  acetyl esterase  38.83 
 
 
309 aa  172  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1670  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  41.8 
 
 
309 aa  171  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1772  esterase/lipase protein  42.79 
 
 
344 aa  171  2e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5215  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  43.86 
 
 
311 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.85138  normal  0.647883 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11429  lipase lipH  40.31 
 
 
320 aa  171  2e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.4414e-17  normal  0.258557 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2844  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  39.47 
 
 
337 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.446939  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2623  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  44.2 
 
 
325 aa  170  3e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.04826  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3735  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  41.6 
 
 
310 aa  170  3e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0759445 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4243  acetyl esterase  38.69 
 
 
309 aa  171  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1419  lipolytic protein  42.29 
 
 
383 aa  170  4e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.252701  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3787  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  43.59 
 
 
322 aa  169  6e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05191  esterase/lipase protein  45.79 
 
 
310 aa  169  6e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00691331  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2632  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.75 
 
 
338 aa  169  6e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.275441  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1023  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  43.24 
 
 
313 aa  169  6e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.205112 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2860  carboxylesterase Est2  37.42 
 
 
321 aa  169  7e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.79214  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2828  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  43.22 
 
 
306 aa  168  1e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0689271 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3651  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.77 
 
 
373 aa  168  1e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3867  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  46.36 
 
 
310 aa  169  1e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.695714  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5056  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  40.99 
 
 
305 aa  168  2e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.23715  normal  0.694103 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3098  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.25 
 
 
338 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.387961  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5478  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  44.3 
 
 
317 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.157645 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0328  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36.24 
 
 
311 aa  166  5e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.195989  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3428  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  44.03 
 
 
322 aa  166  5e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0645  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  41.13 
 
 
349 aa  166  5.9999999999999996e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.575771 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3757  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  42.72 
 
 
311 aa  166  8e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.315687 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0314  Alpha/beta hydrolase fold-3  43.64 
 
 
310 aa  166  8e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0217857  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0324  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  43.64 
 
 
310 aa  166  8e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381561  normal  0.441011 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0305  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  43.64 
 
 
310 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2080  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.89 
 
 
339 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2661  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.25 
 
 
325 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1872  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  43.15 
 
 
321 aa  165  1.0000000000000001e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.208365 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1843  Alpha/beta hydrolase fold-3  43.06 
 
 
344 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0838402  normal  0.122403 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1665  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  44.03 
 
 
313 aa  165  1.0000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.414824 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1807  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  44.31 
 
 
306 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0604  esterase/lipase-like protein  42.23 
 
 
346 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000548029 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3606  putative esterase/lipase  41.63 
 
 
317 aa  164  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0140226  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2888  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.43 
 
 
315 aa  164  3e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.564555  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1072  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.06 
 
 
301 aa  164  3e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1766  lipase  38.02 
 
 
339 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1839  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  40.62 
 
 
311 aa  162  6e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.166294  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4350  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  44.71 
 
 
333 aa  162  6e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00963148  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5487  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  43.71 
 
 
313 aa  162  7e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0712183 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1555  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  41.67 
 
 
316 aa  162  8.000000000000001e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3998  esterase/lipase/thioesterase  38.02 
 
 
337 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000526107  normal  0.48129 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4562  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.63 
 
 
314 aa  162  8.000000000000001e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0210924  normal  0.223571 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11428  lipase lipH  42.55 
 
 
319 aa  162  9e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.13371e-22  normal  0.199346 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3812  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  42.58 
 
 
339 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.422077  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2094  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  43.06 
 
 
339 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.317288  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>