More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1090 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_1090  putative lipase/esterase  100 
 
 
328 aa  647    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.644515 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1376  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  55.02 
 
 
319 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6181  Alpha/beta hydrolase fold-3  53.27 
 
 
338 aa  306  3e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1898  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  53.27 
 
 
338 aa  306  3e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1921  carboxylesterase Est2  50.93 
 
 
321 aa  300  2e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1194  carboxylesterase Est2  50.93 
 
 
321 aa  300  2e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.5931  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2325  carboxylesterase Est2  50.93 
 
 
321 aa  300  2e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.152899  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1430  esterase  50.93 
 
 
319 aa  298  1e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.482815  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1827  lipolytic protein  49.54 
 
 
323 aa  298  1e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3383  esterase  50.93 
 
 
319 aa  298  1e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.418724  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2448  esterase  50.77 
 
 
352 aa  297  2e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.376855  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2286  carboxylesterase Est2  50.62 
 
 
319 aa  296  5e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.124272  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2149  esterase  51.3 
 
 
327 aa  295  1e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.571697  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1772  esterase/lipase protein  48.16 
 
 
344 aa  287  1e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4747  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  51.89 
 
 
321 aa  287  1e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.340698 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1921  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  53.59 
 
 
319 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.458098 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1835  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  52.75 
 
 
319 aa  285  7e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5198  esterase/lipase/thioesterase  52.94 
 
 
319 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.379534 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1807  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  52.75 
 
 
319 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.086728  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1475  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  47.38 
 
 
326 aa  280  2e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.617097  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1944  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  52.38 
 
 
321 aa  280  3e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2860  carboxylesterase Est2  48.77 
 
 
321 aa  279  4e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.79214  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2863  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  54.29 
 
 
325 aa  278  8e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2525  Alpha/beta hydrolase fold-3  49.68 
 
 
320 aa  278  1e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.253728  hitchhiker  0.0086518 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2267  putative esterase/lipase  50 
 
 
321 aa  278  1e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.170928 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3416  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  52.33 
 
 
359 aa  277  2e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.733003  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1713  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  50.67 
 
 
329 aa  276  3e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.386293  normal  0.298888 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1434  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  46.77 
 
 
326 aa  276  4e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0842646 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1991  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  50.33 
 
 
320 aa  275  9e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1935  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  49.35 
 
 
319 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0879113  normal  0.508771 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1039  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  46.89 
 
 
319 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.240306  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2383  Alpha/beta hydrolase fold-3  46.42 
 
 
327 aa  270  2e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.150129  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3384  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  50.17 
 
 
334 aa  267  1e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10878  normal  0.17727 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2828  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  53.07 
 
 
306 aa  264  1e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0689271 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1419  lipolytic protein  47.19 
 
 
383 aa  263  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.252701  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1872  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  49.48 
 
 
321 aa  263  3e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.208365 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1799  putative esterase/lipase  49.17 
 
 
320 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1843  Alpha/beta hydrolase fold-3  44.04 
 
 
344 aa  246  4e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0838402  normal  0.122403 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3787  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  43.75 
 
 
322 aa  240  2e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4218  lipase/esterase family protein  44.92 
 
 
318 aa  239  4e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3543  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  43.57 
 
 
315 aa  239  4e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.560296  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0942  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  43.35 
 
 
312 aa  236  3e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.911706  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5942  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  45.26 
 
 
321 aa  228  2e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.268588  normal  0.0941301 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4942  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  43.08 
 
 
314 aa  216  5e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4223  putative lipase/esterase  42.81 
 
 
320 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5462  esterase/lipase/thioesterase  45.25 
 
 
311 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.536989  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3028  esterase/lipase/thioesterase  39.43 
 
 
314 aa  206  4e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0380453  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3121  esterase/lipase/thioesterase  40.19 
 
 
321 aa  203  3e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2420  Alpha/beta hydrolase fold-3  38.49 
 
 
314 aa  198  7.999999999999999e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.40186  normal  0.0240914 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3090  esterase/lipase/thioesterase  45.04 
 
 
312 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.110672 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2703  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  40.58 
 
 
316 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00278676  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5478  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  41.81 
 
 
317 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.157645 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3653  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.68 
 
 
308 aa  194  1e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5215  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  39.79 
 
 
311 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.85138  normal  0.647883 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2875  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  38.77 
 
 
310 aa  192  6e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.406722  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3428  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  40.74 
 
 
322 aa  192  6e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0328  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35.56 
 
 
311 aa  187  2e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.195989  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7998  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  40.2 
 
 
316 aa  187  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2782  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  40.8 
 
 
320 aa  186  5e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0305  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.67 
 
 
310 aa  186  5e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1072  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  43.15 
 
 
301 aa  184  2.0000000000000003e-45  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2512  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36.51 
 
 
317 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.119667  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0983  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.32 
 
 
309 aa  184  2.0000000000000003e-45  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.875721 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1665  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.27 
 
 
313 aa  183  4.0000000000000006e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.414824 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0758  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  39.24 
 
 
376 aa  183  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0959861 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2162  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  45.37 
 
 
371 aa  182  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0952  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.84 
 
 
318 aa  182  5.0000000000000004e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0314  Alpha/beta hydrolase fold-3  40.33 
 
 
310 aa  182  7e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0217857  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0324  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.33 
 
 
310 aa  182  7e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381561  normal  0.441011 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2006  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  43.36 
 
 
352 aa  182  8.000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.368207  normal  0.502337 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0604  esterase/lipase-like protein  40.65 
 
 
346 aa  181  1e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000548029 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2768  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  41.03 
 
 
308 aa  181  1e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.718585 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2010  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.53 
 
 
335 aa  180  2.9999999999999997e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1213  lipolytic protein  41.47 
 
 
309 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.583626  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1999  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.62 
 
 
352 aa  179  4.999999999999999e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.027865 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4203  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  41 
 
 
375 aa  178  9e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.307246  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1023  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  45.73 
 
 
313 aa  177  2e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.205112 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12985  lipase/esterase lipN  43.53 
 
 
376 aa  177  2e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4552  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.33 
 
 
307 aa  177  3e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0574937 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1654  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.25 
 
 
356 aa  176  4e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0299965  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2671  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.62 
 
 
320 aa  176  5e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.199092  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3924  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.2 
 
 
326 aa  176  7e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.163224  normal  0.0505631 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7511  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40 
 
 
315 aa  175  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0890  putative lipase  38.24 
 
 
310 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.120136  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0445  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.26 
 
 
351 aa  172  5.999999999999999e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.215683  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6777  lipolytic protein  40.44 
 
 
316 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3222  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.82 
 
 
316 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.29245  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2012  putative acetyl hydrolace  40.5 
 
 
325 aa  172  6.999999999999999e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.23753  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2306  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.93 
 
 
307 aa  172  9e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36320  esterase/lipase  41.67 
 
 
353 aa  171  2e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4031  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  31.78 
 
 
312 aa  171  2e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.834602  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0613  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  41.91 
 
 
312 aa  171  2e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1307  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.54 
 
 
313 aa  170  3e-41  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0504826 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2662  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  45.71 
 
 
313 aa  170  4e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000201414 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5286  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.61 
 
 
362 aa  169  5e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.365819  normal  0.925115 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1940  Alpha/beta hydrolase fold-3  45.38 
 
 
375 aa  169  5e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.50518  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1249  esterase/lipase  32.32 
 
 
365 aa  169  5e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0945507  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1986  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  45.38 
 
 
375 aa  169  5e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3830  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  38.23 
 
 
311 aa  169  6e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1670  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  41.18 
 
 
309 aa  169  6e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>