More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1670 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_1670  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  100 
 
 
309 aa  606  9.999999999999999e-173  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1213  lipolytic protein  39.94 
 
 
309 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.583626  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36320  esterase/lipase  45.89 
 
 
353 aa  182  6e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1620  lipolytic protein  44.19 
 
 
312 aa  177  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0105415  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3121  esterase/lipase/thioesterase  38.41 
 
 
321 aa  177  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0942  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.57 
 
 
312 aa  176  5e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.911706  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1665  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  41.02 
 
 
313 aa  175  8e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.414824 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0328  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  31.25 
 
 
311 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.195989  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4942  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36.89 
 
 
314 aa  173  2.9999999999999996e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0952  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  41.24 
 
 
318 aa  173  3.9999999999999995e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2006  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  39.05 
 
 
352 aa  172  5e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.368207  normal  0.502337 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3090  esterase/lipase/thioesterase  37.67 
 
 
312 aa  170  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.110672 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1072  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.58 
 
 
301 aa  171  2e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0443  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  41.8 
 
 
371 aa  171  2e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2875  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35.71 
 
 
310 aa  170  3e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.406722  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2768  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  39.52 
 
 
308 aa  170  3e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.718585 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0445  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.29 
 
 
351 aa  169  4e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.215683  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2782  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  42.46 
 
 
320 aa  169  5e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3787  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.38 
 
 
322 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1827  lipolytic protein  36.36 
 
 
323 aa  167  2e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1307  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.86 
 
 
313 aa  166  4e-40  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0504826 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1654  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.82 
 
 
356 aa  165  8e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0299965  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2010  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.84 
 
 
335 aa  165  9e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1920  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  44.44 
 
 
340 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.884364 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1940  Alpha/beta hydrolase fold-3  44.44 
 
 
375 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.50518  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3064  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  40.52 
 
 
355 aa  160  3e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000554719  hitchhiker  0.000820909 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1986  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  44.44 
 
 
375 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3028  esterase/lipase/thioesterase  35.97 
 
 
314 aa  159  5e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0380453  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5478  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  40.08 
 
 
317 aa  159  6e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.157645 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1186  Alpha/beta hydrolase fold-3  39.66 
 
 
311 aa  159  7e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.102278  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2162  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  42.74 
 
 
371 aa  158  8e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5215  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35.86 
 
 
311 aa  158  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.85138  normal  0.647883 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4747  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.07 
 
 
321 aa  158  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.340698 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0226  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  39.6 
 
 
350 aa  157  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1487  putative lipase/esterase  40.71 
 
 
305 aa  157  2e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0809512  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0645  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.84 
 
 
349 aa  157  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.575771 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2599  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  42.63 
 
 
370 aa  157  2e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1376  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.3 
 
 
319 aa  156  4e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1039  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.2 
 
 
319 aa  156  4e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.240306  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2420  Alpha/beta hydrolase fold-3  36.59 
 
 
314 aa  156  4e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.40186  normal  0.0240914 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2325  carboxylesterase Est2  36.67 
 
 
321 aa  155  6e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.152899  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1194  carboxylesterase Est2  36.67 
 
 
321 aa  155  6e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.5931  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1835  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.55 
 
 
319 aa  155  6e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1921  carboxylesterase Est2  36.67 
 
 
321 aa  155  6e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1430  esterase  36.67 
 
 
319 aa  155  7e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.482815  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3383  esterase  36.67 
 
 
319 aa  155  7e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.418724  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1807  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.55 
 
 
319 aa  155  7e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.086728  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4256  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  42.62 
 
 
347 aa  155  8e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0760103  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2448  esterase  36.67 
 
 
352 aa  155  9e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.376855  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6777  lipolytic protein  39.6 
 
 
316 aa  155  9e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2267  putative esterase/lipase  40.51 
 
 
321 aa  155  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.170928 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0305  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.68 
 
 
310 aa  154  1e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4552  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.28 
 
 
307 aa  155  1e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0574937 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0324  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35.17 
 
 
308 aa  154  2e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2286  carboxylesterase Est2  36.67 
 
 
319 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.124272  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1713  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.52 
 
 
329 aa  154  2e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.386293  normal  0.298888 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6181  Alpha/beta hydrolase fold-3  35.33 
 
 
338 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1898  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.33 
 
 
338 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3653  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.28 
 
 
308 aa  153  2.9999999999999998e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0314  Alpha/beta hydrolase fold-3  38.33 
 
 
310 aa  152  5e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0217857  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0324  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.33 
 
 
310 aa  152  5e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381561  normal  0.441011 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2525  Alpha/beta hydrolase fold-3  37.41 
 
 
320 aa  152  5.9999999999999996e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.253728  hitchhiker  0.0086518 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2517  Alpha/beta hydrolase fold-3  41.18 
 
 
323 aa  152  5.9999999999999996e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1991  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36.18 
 
 
320 aa  152  7e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1839  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  42.21 
 
 
311 aa  152  8e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.166294  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1921  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36 
 
 
319 aa  152  8e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.458098 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2863  esterase/lipase/thioesterase  37.26 
 
 
284 aa  151  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.797997  normal  0.352624 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2149  esterase  36 
 
 
327 aa  151  1e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.571697  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1944  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.41 
 
 
321 aa  151  1e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4223  putative lipase/esterase  39.43 
 
 
320 aa  150  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3416  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40 
 
 
359 aa  151  2e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.733003  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1537  lipolytic protein  39.19 
 
 
318 aa  151  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000528451  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2383  Alpha/beta hydrolase fold-3  41.33 
 
 
327 aa  151  2e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.150129  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1090  putative lipase/esterase  39.93 
 
 
328 aa  150  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.644515 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5462  esterase/lipase/thioesterase  40.08 
 
 
311 aa  150  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.536989  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2703  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.26 
 
 
316 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00278676  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3757  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36.65 
 
 
311 aa  149  4e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.315687 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0890  putative lipase  35.56 
 
 
310 aa  150  4e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.120136  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02616  lipase signal peptide protein  37.55 
 
 
339 aa  149  5e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.83944 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1419  lipolytic protein  36.33 
 
 
383 aa  149  7e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.252701  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4031  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.33 
 
 
312 aa  149  7e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.834602  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0758  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  39.08 
 
 
376 aa  149  8e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0959861 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1441  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.28 
 
 
317 aa  148  9e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12985  lipase/esterase lipN  41.13 
 
 
376 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3428  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36.64 
 
 
322 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4203  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.86 
 
 
375 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.307246  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7998  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35.86 
 
 
316 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3998  esterase/lipase/thioesterase  34.73 
 
 
337 aa  147  3e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000526107  normal  0.48129 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2306  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.87 
 
 
307 aa  147  3e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2512  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  39.09 
 
 
317 aa  147  3e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.119667  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0880  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.89 
 
 
324 aa  146  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.691733  hitchhiker  0.0000246401 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1766  lipase  33.97 
 
 
339 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5198  esterase/lipase/thioesterase  34.67 
 
 
319 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.379534 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3269  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  37.5 
 
 
328 aa  146  4.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4884  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.84 
 
 
289 aa  145  6e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3924  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.64 
 
 
326 aa  145  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.163224  normal  0.0505631 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2623  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.59 
 
 
325 aa  145  1e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.04826  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2661  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.9 
 
 
325 aa  145  1e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1772  esterase/lipase protein  35.71 
 
 
344 aa  144  2e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3651  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.32 
 
 
373 aa  144  2e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>