More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3651 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008345  Sfri_3651  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  100 
 
 
373 aa  773    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2875  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  41.67 
 
 
310 aa  189  5e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.406722  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0942  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.78 
 
 
312 aa  189  5.999999999999999e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.911706  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0758  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  38.52 
 
 
376 aa  179  5.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0959861 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3028  esterase/lipase/thioesterase  37.21 
 
 
314 aa  179  9e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0380453  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5462  esterase/lipase/thioesterase  39.26 
 
 
311 aa  177  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.536989  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1654  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.49 
 
 
356 aa  178  2e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0299965  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4256  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.11 
 
 
347 aa  177  4e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0760103  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1023  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36.73 
 
 
313 aa  176  5e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.205112 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0445  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.14 
 
 
351 aa  175  9.999999999999999e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.215683  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2420  Alpha/beta hydrolase fold-3  36.43 
 
 
314 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.40186  normal  0.0240914 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3830  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35.97 
 
 
311 aa  175  9.999999999999999e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2703  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  38.37 
 
 
316 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00278676  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0952  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  38.4 
 
 
318 aa  172  7.999999999999999e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1072  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.45 
 
 
301 aa  171  1e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1307  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.61 
 
 
313 aa  172  1e-41  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0504826 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1827  lipolytic protein  37.11 
 
 
323 aa  171  2e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2782  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36.08 
 
 
320 aa  171  2e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2162  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.43 
 
 
371 aa  171  2e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4203  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.09 
 
 
375 aa  170  5e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.307246  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36320  esterase/lipase  40.45 
 
 
353 aa  169  1e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0443  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.77 
 
 
371 aa  168  1e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1665  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.9 
 
 
313 aa  168  1e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.414824 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1999  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.5 
 
 
352 aa  168  1e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.027865 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0314  Alpha/beta hydrolase fold-3  36.9 
 
 
310 aa  168  1e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0217857  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4942  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  38.71 
 
 
314 aa  168  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0324  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.9 
 
 
310 aa  168  1e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381561  normal  0.441011 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2010  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.43 
 
 
335 aa  168  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2863  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36.95 
 
 
325 aa  167  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3121  esterase/lipase/thioesterase  37.01 
 
 
321 aa  167  4e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1920  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.67 
 
 
340 aa  166  5e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.884364 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1213  lipolytic protein  37.6 
 
 
309 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.583626  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0983  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.28 
 
 
309 aa  165  1.0000000000000001e-39  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.875721 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0305  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.51 
 
 
310 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2517  Alpha/beta hydrolase fold-3  39.75 
 
 
323 aa  164  2.0000000000000002e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4223  putative lipase/esterase  36.19 
 
 
320 aa  164  3e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1713  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.11 
 
 
329 aa  164  3e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.386293  normal  0.298888 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0328  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35.51 
 
 
311 aa  163  4.0000000000000004e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.195989  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2006  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36.61 
 
 
352 aa  163  4.0000000000000004e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.368207  normal  0.502337 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3757  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36.69 
 
 
311 aa  163  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.315687 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1555  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.24 
 
 
316 aa  163  5.0000000000000005e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1991  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  34.11 
 
 
320 aa  163  5.0000000000000005e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0645  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.59 
 
 
349 aa  162  6e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.575771 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3269  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  35.84 
 
 
328 aa  162  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1940  Alpha/beta hydrolase fold-3  37.89 
 
 
375 aa  161  2e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.50518  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2599  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35.51 
 
 
370 aa  161  2e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1986  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.89 
 
 
375 aa  161  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1487  putative lipase/esterase  36.72 
 
 
305 aa  159  6e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0809512  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1935  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  34.6 
 
 
319 aa  159  8e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0879113  normal  0.508771 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1786  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  33.73 
 
 
317 aa  158  1e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.193562  hitchhiker  0.00646519 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4321  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.19 
 
 
325 aa  157  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.164009 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12985  lipase/esterase lipN  32.55 
 
 
376 aa  157  2e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2267  putative esterase/lipase  34.6 
 
 
321 aa  157  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.170928 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4431  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.19 
 
 
325 aa  157  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.31619  normal  0.530483 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1419  lipolytic protein  33.22 
 
 
383 aa  157  3e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.252701  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3090  esterase/lipase/thioesterase  35.77 
 
 
312 aa  157  3e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.110672 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1475  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  30.77 
 
 
326 aa  157  3e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.617097  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1772  esterase/lipase protein  30.5 
 
 
344 aa  156  6e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2860  carboxylesterase Est2  31.56 
 
 
321 aa  156  6e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.79214  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7998  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  38.11 
 
 
316 aa  155  8e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4552  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.14 
 
 
307 aa  155  8e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0574937 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1376  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.47 
 
 
319 aa  155  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1434  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  31.1 
 
 
326 aa  155  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0842646 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3064  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35.63 
 
 
355 aa  155  1e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000554719  hitchhiker  0.000820909 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1441  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  33.33 
 
 
317 aa  155  1e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1921  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.47 
 
 
319 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.458098 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3428  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36.97 
 
 
322 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6775  esterase/lipase/thioesterase  38.01 
 
 
327 aa  153  4e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.641311  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5198  esterase/lipase/thioesterase  38.01 
 
 
319 aa  153  4e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.379534 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0890  putative lipase  35.85 
 
 
310 aa  153  4e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.120136  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6313  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  35.25 
 
 
311 aa  153  5e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.179325  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1620  lipolytic protein  34.91 
 
 
312 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0105415  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1944  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.11 
 
 
321 aa  152  8.999999999999999e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1039  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.15 
 
 
319 aa  152  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.240306  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6181  Alpha/beta hydrolase fold-3  34.47 
 
 
338 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1898  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.47 
 
 
338 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2479  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.17 
 
 
313 aa  151  2e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.26249  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0324  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  34.75 
 
 
308 aa  150  3e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3222  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.86 
 
 
316 aa  150  3e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.29245  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0226  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36.99 
 
 
350 aa  150  3e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1839  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35.22 
 
 
311 aa  150  4e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.166294  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3924  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.04 
 
 
326 aa  149  5e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.163224  normal  0.0505631 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5942  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  31.54 
 
 
321 aa  149  6e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.268588  normal  0.0941301 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2671  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.86 
 
 
320 aa  149  6e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.199092  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2828  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  31.29 
 
 
306 aa  149  7e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0689271 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2662  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.65 
 
 
313 aa  149  9e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000201414 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6777  lipolytic protein  33.67 
 
 
316 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1807  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.33 
 
 
319 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.086728  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1843  Alpha/beta hydrolase fold-3  31.16 
 
 
344 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0838402  normal  0.122403 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1835  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.33 
 
 
319 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2768  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  33.59 
 
 
308 aa  147  3e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.718585 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7511  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.79 
 
 
315 aa  147  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5215  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  34.24 
 
 
311 aa  147  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.85138  normal  0.647883 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3384  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  30.25 
 
 
334 aa  147  3e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10878  normal  0.17727 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3416  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  30.87 
 
 
359 aa  146  5e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.733003  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2383  Alpha/beta hydrolase fold-3  34.54 
 
 
327 aa  146  7.0000000000000006e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.150129  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4031  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.85 
 
 
312 aa  145  9e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.834602  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1430  esterase  35.9 
 
 
319 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.482815  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2448  esterase  35.47 
 
 
352 aa  145  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.376855  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2325  carboxylesterase Est2  35.9 
 
 
321 aa  145  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.152899  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>