More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0226 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_0226  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  100 
 
 
350 aa  682    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3064  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  52.03 
 
 
355 aa  283  4.0000000000000003e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000554719  hitchhiker  0.000820909 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36320  esterase/lipase  55.52 
 
 
353 aa  283  4.0000000000000003e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1654  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  48.81 
 
 
356 aa  268  1e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0299965  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4256  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  49.13 
 
 
347 aa  268  1e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0760103  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0082  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  45.61 
 
 
360 aa  244  9.999999999999999e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2162  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  45.27 
 
 
371 aa  242  7.999999999999999e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12985  lipase/esterase lipN  43.18 
 
 
376 aa  229  4e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4203  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  44.64 
 
 
375 aa  229  7e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.307246  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0443  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  52.14 
 
 
371 aa  225  7e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5462  esterase/lipase/thioesterase  53.81 
 
 
311 aa  218  7.999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.536989  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2010  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  51.26 
 
 
335 aa  211  1e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0445  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  41.83 
 
 
351 aa  211  1e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.215683  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1920  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  53.2 
 
 
340 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.884364 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2512  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  48 
 
 
317 aa  209  5e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.119667  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4942  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  45.02 
 
 
314 aa  207  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1940  Alpha/beta hydrolase fold-3  52.8 
 
 
375 aa  207  3e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.50518  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1986  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  52.8 
 
 
375 aa  207  3e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0645  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.76 
 
 
349 aa  206  6e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.575771 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1841  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  45.87 
 
 
347 aa  203  4e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.126037  normal  0.0700576 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3121  esterase/lipase/thioesterase  44.8 
 
 
321 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1999  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.94 
 
 
352 aa  197  2.0000000000000003e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.027865 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2875  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  45.82 
 
 
310 aa  196  5.000000000000001e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.406722  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0983  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  44.74 
 
 
309 aa  195  1e-48  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.875721 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1665  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  50.21 
 
 
313 aa  195  1e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.414824 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3757  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  46.02 
 
 
311 aa  194  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.315687 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0758  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  39.81 
 
 
376 aa  193  3e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0959861 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0942  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  47.6 
 
 
312 aa  193  4e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.911706  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1827  lipolytic protein  39.02 
 
 
323 aa  189  5e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3098  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.89 
 
 
338 aa  189  7e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.387961  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2006  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  44.62 
 
 
352 aa  189  7e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.368207  normal  0.502337 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1620  lipolytic protein  47.35 
 
 
312 aa  189  8e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0105415  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0952  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  43.16 
 
 
318 aa  188  1e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3028  esterase/lipase/thioesterase  42.54 
 
 
314 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0380453  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2661  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  42.41 
 
 
325 aa  187  3e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1839  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  48.09 
 
 
311 aa  187  3e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.166294  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4552  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  43.75 
 
 
307 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0574937 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1872  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  48.58 
 
 
321 aa  184  1.0000000000000001e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.208365 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2420  Alpha/beta hydrolase fold-3  41.97 
 
 
314 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.40186  normal  0.0240914 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1307  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  43.37 
 
 
313 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0504826 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2632  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40 
 
 
338 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.275441  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3998  esterase/lipase/thioesterase  38.22 
 
 
337 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000526107  normal  0.48129 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1213  lipolytic protein  45.42 
 
 
309 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.583626  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1713  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  43.23 
 
 
329 aa  182  1e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.386293  normal  0.298888 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2517  Alpha/beta hydrolase fold-3  50.43 
 
 
323 aa  181  2e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0314  Alpha/beta hydrolase fold-3  41.58 
 
 
310 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0217857  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0305  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  41.58 
 
 
310 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0324  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  41.58 
 
 
310 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381561  normal  0.441011 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1194  carboxylesterase Est2  38.8 
 
 
321 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.5931  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2325  carboxylesterase Est2  38.8 
 
 
321 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.152899  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1430  esterase  38.8 
 
 
319 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.482815  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2443  putative lipase  45.54 
 
 
292 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1991  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  42.11 
 
 
320 aa  180  2.9999999999999997e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1072  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.97 
 
 
301 aa  180  2.9999999999999997e-44  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1921  carboxylesterase Est2  38.8 
 
 
321 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3384  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.23 
 
 
334 aa  180  2.9999999999999997e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10878  normal  0.17727 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3383  esterase  38.8 
 
 
319 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.418724  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1766  lipase  36.72 
 
 
339 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2448  esterase  38.8 
 
 
352 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.376855  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3113  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  41.9 
 
 
337 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.723098  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2860  carboxylesterase Est2  42.57 
 
 
321 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.79214  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3416  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  46.67 
 
 
359 aa  179  5.999999999999999e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.733003  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0328  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35.92 
 
 
311 aa  178  1e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.195989  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1772  esterase/lipase protein  42.92 
 
 
344 aa  178  1e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2080  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  41.34 
 
 
339 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1487  putative lipase/esterase  44.88 
 
 
305 aa  177  2e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0809512  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2844  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  41.18 
 
 
337 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.446939  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3269  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  43.94 
 
 
328 aa  177  3e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2703  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  48.68 
 
 
316 aa  177  3e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00278676  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2286  carboxylesterase Est2  38.17 
 
 
319 aa  177  3e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.124272  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2828  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  47.11 
 
 
306 aa  176  4e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0689271 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6777  lipolytic protein  39.43 
 
 
316 aa  176  6e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1670  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  41.2 
 
 
309 aa  176  6e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1434  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  42.06 
 
 
326 aa  175  9e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0842646 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4223  putative lipase/esterase  47.79 
 
 
320 aa  175  9e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0880  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  40.8 
 
 
324 aa  175  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.691733  hitchhiker  0.0000246401 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1475  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  42.06 
 
 
326 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.617097  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4089  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.64 
 
 
304 aa  174  1.9999999999999998e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3606  putative esterase/lipase  46.43 
 
 
317 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0140226  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4265  acetyl esterase  42.11 
 
 
309 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1023  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  43.72 
 
 
313 aa  173  2.9999999999999996e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.205112 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2383  Alpha/beta hydrolase fold-3  43.97 
 
 
327 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.150129  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2464  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  49.37 
 
 
317 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000166142  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2306  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.28 
 
 
307 aa  173  2.9999999999999996e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3653  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.62 
 
 
308 aa  173  3.9999999999999995e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2479  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  45.91 
 
 
313 aa  173  3.9999999999999995e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.26249  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0604  esterase/lipase-like protein  44.17 
 
 
346 aa  173  5e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000548029 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2768  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  43.45 
 
 
308 aa  173  5e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.718585 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3090  esterase/lipase/thioesterase  42.17 
 
 
312 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.110672 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2861  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  45.57 
 
 
301 aa  172  5.999999999999999e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2662  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  45.49 
 
 
313 aa  172  5.999999999999999e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000201414 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1345  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  39.62 
 
 
349 aa  172  6.999999999999999e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1958  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  42.54 
 
 
339 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0704762  normal  0.359976 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1786  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  40.43 
 
 
317 aa  172  9e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.193562  hitchhiker  0.00646519 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3812  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  42.54 
 
 
339 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.422077  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7511  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  42.12 
 
 
315 aa  172  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4243  acetyl esterase  41.7 
 
 
309 aa  172  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02616  lipase signal peptide protein  39.1 
 
 
339 aa  171  2e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.83944 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2671  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.28 
 
 
320 aa  171  2e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.199092  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1898  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.79 
 
 
338 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>