More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS02616 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS02616  lipase signal peptide protein  100 
 
 		 339 aa  679    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.83944 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3446  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  85.25 
 
 		 339 aa  577  1.0000000000000001e-163  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0587  lipase  78.5 
 
 		 337 aa  519  1e-146  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0542  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  78.82 
 
 		 337 aa  520  1e-146  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1766  lipase  73.45 
 
 		 339 aa  514  1e-144  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3998  esterase/lipase/thioesterase  71.39 
 
 		 337 aa  497  1e-140  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000526107  normal  0.48129 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1969  esterase/lipase/thioesterase  70.5 
 
 		 338 aa  483  1e-135  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.574416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2094  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  69.03 
 
 		 339 aa  484  1e-135  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.317288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2632  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  68.14 
 
 		 338 aa  478  1e-134  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.275441  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3812  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  68.44 
 
 		 339 aa  477  1e-133  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.422077  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1958  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  67.85 
 
 		 339 aa  474  1e-133  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0704762  normal  0.359976 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3098  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  66.47 
 
 		 338 aa  474  1e-132  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.387961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2080  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  67.85 
 
 		 339 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2661  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  68.55 
 
 		 325 aa  455  1e-127  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2852  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  69.11 
 
 		 324 aa  454  1.0000000000000001e-126  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.255078 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0403  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  67.66 
 
 		 336 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3375  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  66.77 
 
 		 350 aa  443  1e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.354679  normal  0.126247 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6063  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  67.8 
 
 		 344 aa  425  1e-118  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2196  lipase  66.26 
 
 		 341 aa  426  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.56452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7669  esterase/lipase/thioesterase  67.52 
 
 		 348 aa  422  1e-117  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.753901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5712  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  66.67 
 
 		 344 aa  422  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.579878 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5770  Alpha/beta hydrolase fold-3  66.77 
 
 		 344 aa  421  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.950469  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6135  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  66.77 
 
 		 344 aa  421  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.970207  normal  0.96238 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5954  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  66.04 
 
 		 344 aa  418  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350499  normal  0.849659 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1386  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  63.09 
 
 		 326 aa  416  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.372479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6617  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  66.13 
 
 		 344 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.141576 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0839  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  59.53 
 
 		 339 aa  413  1e-114  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0373  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  58.84 
 
 		 339 aa  410  1e-113  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00172019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5601  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  65.59 
 
 		 342 aa  410  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2787  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  62.86 
 
 		 328 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.528915  normal  0.113664 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1345  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  60.25 
 
 		 349 aa  399  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4939  Alpha/beta hydrolase fold-3  62.01 
 
 		 321 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3221  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  62.01 
 
 		 321 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.865641 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3807  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  58.41 
 
 		 330 aa  381  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.136684  normal  0.307308 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5440  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  57.28 
 
 		 330 aa  377  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.165063 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0746  Alpha/beta hydrolase fold-3  56.41 
 
 		 331 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.192331 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2844  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  57.69 
 
 		 337 aa  347  2e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.446939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0880  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  57.28 
 
 		 324 aa  342  5e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.691733  hitchhiker  0.0000246401 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1740  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  53.23 
 
 		 327 aa  342  5e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3113  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  56.73 
 
 		 337 aa  341  1e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.723098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0318  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  51.95 
 
 		 329 aa  337  1.9999999999999998e-91  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1856  hypothetical protein  53.62 
 
 		 321 aa  326  3e-88  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1851  hypothetical protein  53.29 
 
 		 321 aa  325  1e-87  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5453  putative exported lipase/esterase  54.17 
 
 		 319 aa  300  2e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.131781  normal  0.198573 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2316  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  50 
 
 		 321 aa  287  2e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2931  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  51.53 
 
 		 316 aa  285  1.0000000000000001e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.360942  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1940  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  49.07 
 
 		 325 aa  273  4.0000000000000004e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.270718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5060  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  49.83 
 
 		 314 aa  252  7e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0996  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  44.14 
 
 		 321 aa  238  1e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5462  esterase/lipase/thioesterase  43.9 
 
 		 311 aa  219  7e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.536989  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4552  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  41.73 
 
 		 307 aa  210  3e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0574937 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3757  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  40.45 
 
 		 311 aa  205  8e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.315687 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2443  putative lipase  41.4 
 
 		 292 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0314  Alpha/beta hydrolase fold-3  39.73 
 
 		 310 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0217857  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0324  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.73 
 
 		 310 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381561  normal  0.441011 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0305  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.38 
 
 		 310 aa  200  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1441  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  40.62 
 
 		 317 aa  199  3.9999999999999996e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0942  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.93 
 
 		 312 aa  196  3e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.911706  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0604  esterase/lipase-like protein  38.66 
 
 		 346 aa  194  2e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000548029 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1839  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  47.35 
 
 		 311 aa  194  3e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.166294  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4942  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  41.32 
 
 		 314 aa  192  5e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1307  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  42.01 
 
 		 313 aa  191  1e-47  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0504826 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2875  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  38.95 
 
 		 310 aa  192  1e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.406722  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2072  putative fusion protein  40.78 
 
 		 884 aa  189  7e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.987766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0890  putative lipase  38.26 
 
 		 310 aa  187  3e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.120136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1023  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  44.96 
 
 		 313 aa  186  4e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.205112 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0952  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  38.03 
 
 		 318 aa  184  2.0000000000000003e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1665  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.42 
 
 		 313 aa  184  2.0000000000000003e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414824 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1213  lipolytic protein  40.21 
 
 		 309 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.583626  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0328  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  33.21 
 
 		 311 aa  182  6e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.195989  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2888  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.95 
 
 		 315 aa  182  6e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.564555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1072  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.15 
 
 		 301 aa  182  6e-45  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2703  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  39.48 
 
 		 316 aa  182  8.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00278676  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4223  putative lipase/esterase  38.64 
 
 		 320 aa  181  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3653  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.41 
 
 		 308 aa  179  5.999999999999999e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1772  esterase/lipase protein  36.25 
 
 		 344 aa  179  7e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0758  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35.78 
 
 		 376 aa  179  7e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0959861 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2420  Alpha/beta hydrolase fold-3  37.54 
 
 		 314 aa  177  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.40186  normal  0.0240914 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4031  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.16 
 
 		 312 aa  176  4e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.834602  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2623  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  39.69 
 
 		 325 aa  176  5e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.04826  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2010  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.54 
 
 		 335 aa  176  6e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3028  esterase/lipase/thioesterase  36.25 
 
 		 314 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0380453  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7511  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  43.82 
 
 		 315 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1475  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35.65 
 
 		 326 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.617097  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3830  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36.1 
 
 		 311 aa  172  5e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3222  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.59 
 
 		 316 aa  172  5e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.29245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1434  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  34.8 
 
 		 326 aa  172  5.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0842646 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1713  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.42 
 
 		 329 aa  172  6.999999999999999e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.386293  normal  0.298888 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1654  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.69 
 
 		 356 aa  172  1e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0299965  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2671  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.2 
 
 		 320 aa  171  2e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.199092  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1991  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  38.08 
 
 		 320 aa  171  2e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1249  esterase/lipase  34.86 
 
 		 365 aa  169  4e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0945507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2782  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  34.74 
 
 		 320 aa  168  2e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6777  lipolytic protein  38.62 
 
 		 316 aa  166  4e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2863  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35.91 
 
 		 325 aa  166  8e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3924  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.88 
 
 		 326 aa  164  1.0000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.163224  normal  0.0505631 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1217  esterase/lipase/thioesterase  35.92 
 
 		 312 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.265662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2860  carboxylesterase Est2  36.93 
 
 		 321 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.79214  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4747  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.18 
 
 		 321 aa  164  2.0000000000000002e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.340698 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1537  lipolytic protein  40.66 
 
 		 318 aa  164  3e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000528451  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>