More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5440 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5440  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  100 
 
 		 330 aa  682    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.165063 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3375  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  64.76 
 
 		 350 aa  437  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.354679  normal  0.126247 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1386  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  62.26 
 
 		 326 aa  420  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.372479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1740  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  60.06 
 
 		 327 aa  409  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1345  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  57.5 
 
 		 349 aa  400  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2787  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  60.69 
 
 		 328 aa  396  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.528915  normal  0.113664 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2094  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  56.96 
 
 		 339 aa  391  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.317288  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1766  lipase  57.59 
 
 		 339 aa  389  1e-107  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3807  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  58.28 
 
 		 330 aa  389  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.136684  normal  0.307308 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3098  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  56.01 
 
 		 338 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.387961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2632  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  57.28 
 
 		 338 aa  390  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.275441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1958  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  56.33 
 
 		 339 aa  386  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0704762  normal  0.359976 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3812  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  56.33 
 
 		 339 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.422077  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3446  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  58.47 
 
 		 339 aa  385  1e-106  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2196  lipase  59.18 
 
 		 341 aa  385  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.56452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2852  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  57.28 
 
 		 324 aa  380  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.255078 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3998  esterase/lipase/thioesterase  57.56 
 
 		 337 aa  380  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000526107  normal  0.48129 
 
 
-
 
NC_003296  RS02616  lipase signal peptide protein  57.32 
 
 		 339 aa  376  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.83944 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1969  esterase/lipase/thioesterase  56.33 
 
 		 338 aa  377  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.574416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7669  esterase/lipase/thioesterase  59.67 
 
 		 348 aa  375  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.753901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2080  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  55.38 
 
 		 339 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0318  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  55.66 
 
 		 329 aa  377  1e-103  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5770  Alpha/beta hydrolase fold-3  58.79 
 
 		 344 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.950469  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5601  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  58.58 
 
 		 342 aa  377  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6135  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  58.79 
 
 		 344 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.970207  normal  0.96238 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6063  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  59.21 
 
 		 344 aa  377  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0542  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  57.59 
 
 		 337 aa  374  1e-102  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5712  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  59.34 
 
 		 344 aa  372  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.579878 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0587  lipase  57.59 
 
 		 337 aa  374  1e-102  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2661  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  53.8 
 
 		 325 aa  372  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6617  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  58.15 
 
 		 344 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.141576 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5954  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  59.02 
 
 		 344 aa  370  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350499  normal  0.849659 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4939  Alpha/beta hydrolase fold-3  57.24 
 
 		 321 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3221  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  57.24 
 
 		 321 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.865641 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0403  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  55.59 
 
 		 336 aa  362  5.0000000000000005e-99  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0839  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  52.4 
 
 		 339 aa  347  2e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0746  Alpha/beta hydrolase fold-3  51.28 
 
 		 331 aa  333  3e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.192331 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0373  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  49.2 
 
 		 339 aa  328  9e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00172019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2844  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  49.53 
 
 		 337 aa  298  1e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.446939  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3113  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  49.53 
 
 		 337 aa  297  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.723098  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1851  hypothetical protein  45.42 
 
 		 321 aa  284  1.0000000000000001e-75  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1856  hypothetical protein  45.42 
 
 		 321 aa  283  4.0000000000000003e-75  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0880  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  44.84 
 
 		 324 aa  282  6.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.691733  hitchhiker  0.0000246401 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5453  putative exported lipase/esterase  50.99 
 
 		 319 aa  265  7e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.131781  normal  0.198573 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2931  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  49.44 
 
 		 316 aa  258  7e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.360942  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2316  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  47.58 
 
 		 321 aa  255  6e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1940  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  47.62 
 
 		 325 aa  237  2e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.270718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5060  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  45.62 
 
 		 314 aa  234  2.0000000000000002e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0996  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  41.15 
 
 		 321 aa  205  9e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5462  esterase/lipase/thioesterase  35.74 
 
 		 311 aa  199  7.999999999999999e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.536989  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4552  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.16 
 
 		 307 aa  187  1e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0574937 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0314  Alpha/beta hydrolase fold-3  38.27 
 
 		 310 aa  186  6e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0217857  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0324  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.27 
 
 		 310 aa  186  6e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381561  normal  0.441011 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0305  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.86 
 
 		 310 aa  183  3e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1441  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  34.42 
 
 		 317 aa  178  1e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1665  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.13 
 
 		 313 aa  177  3e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414824 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2888  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.89 
 
 		 315 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.564555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3028  esterase/lipase/thioesterase  32.69 
 
 		 314 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0380453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1072  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40 
 
 		 301 aa  169  7e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2443  putative lipase  37.8 
 
 		 292 aa  167  2e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0604  esterase/lipase-like protein  35.59 
 
 		 346 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000548029 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2420  Alpha/beta hydrolase fold-3  31.41 
 
 		 314 aa  166  4e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.40186  normal  0.0240914 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0942  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.81 
 
 		 312 aa  166  4e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.911706  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3222  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  31.96 
 
 		 316 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.29245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2875  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  31.21 
 
 		 310 aa  164  1.0000000000000001e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.406722  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1839  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  38.22 
 
 		 311 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.166294  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2671  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.68 
 
 		 320 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.199092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7511  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  41.74 
 
 		 315 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2623  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36.15 
 
 		 325 aa  164  2.0000000000000002e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.04826  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3090  esterase/lipase/thioesterase  34.04 
 
 		 312 aa  163  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.110672 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1213  lipolytic protein  33.45 
 
 		 309 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.583626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3653  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.33 
 
 		 308 aa  162  5.0000000000000005e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1307  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.92 
 
 		 313 aa  162  6e-39  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0504826 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2703  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  32.89 
 
 		 316 aa  162  7e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00278676  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3757  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  32.71 
 
 		 311 aa  162  9e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.315687 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2782  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  31.58 
 
 		 320 aa  162  1e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4942  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  32.06 
 
 		 314 aa  161  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2072  putative fusion protein  34.04 
 
 		 884 aa  160  4e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.987766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4884  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.67 
 
 		 289 aa  159  5e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1023  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  32.26 
 
 		 313 aa  159  6e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.205112 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0952  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  31.23 
 
 		 318 aa  155  1e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2863  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  30.56 
 
 		 325 aa  155  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4223  putative lipase/esterase  32.06 
 
 		 320 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1039  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  30.41 
 
 		 319 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.240306  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1772  esterase/lipase protein  30.43 
 
 		 344 aa  153  4e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0328  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  33.9 
 
 		 311 aa  152  5e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.195989  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0758  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  31.21 
 
 		 376 aa  152  8e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0959861 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3924  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.72 
 
 		 326 aa  151  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.163224  normal  0.0505631 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1620  lipolytic protein  33.71 
 
 		 312 aa  150  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0105415  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1475  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  29.81 
 
 		 326 aa  150  3e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.617097  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2286  carboxylesterase Est2  32.29 
 
 		 319 aa  150  3e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.124272  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4747  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  30.03 
 
 		 321 aa  150  3e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.340698 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2325  carboxylesterase Est2  31.97 
 
 		 321 aa  149  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.152899  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1921  carboxylesterase Est2  31.97 
 
 		 321 aa  149  5e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1194  carboxylesterase Est2  31.97 
 
 		 321 aa  149  5e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.5931  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2448  esterase  31.97 
 
 		 352 aa  149  6e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.376855  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1430  esterase  31.97 
 
 		 319 aa  149  7e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.482815  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3383  esterase  31.97 
 
 		 319 aa  149  7e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.418724  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2218  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  33.9 
 
 		 382 aa  149  7e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000644131  normal  0.0211816 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2542  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  30.52 
 
 		 304 aa  149  9e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.311533  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>