More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2316 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_2316  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  100 
 
 
321 aa  647    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5453  putative exported lipase/esterase  65.79 
 
 
319 aa  409  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.131781  normal  0.198573 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2931  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  60.45 
 
 
316 aa  381  1e-105  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.360942  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1940  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  61.72 
 
 
325 aa  373  1e-102  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.270718  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1851  hypothetical protein  52.98 
 
 
321 aa  327  1.0000000000000001e-88  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1856  hypothetical protein  52.66 
 
 
321 aa  325  9e-88  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3113  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  56.15 
 
 
337 aa  324  1e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.723098  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2844  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  56.15 
 
 
337 aa  324  1e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.446939  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0880  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  53.35 
 
 
324 aa  315  7e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.691733  hitchhiker  0.0000246401 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5060  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  55.33 
 
 
314 aa  315  8e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0996  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  52.81 
 
 
321 aa  313  1.9999999999999998e-84  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1766  lipase  52.77 
 
 
339 aa  311  1e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3998  esterase/lipase/thioesterase  52.61 
 
 
337 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000526107  normal  0.48129 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1969  esterase/lipase/thioesterase  49.84 
 
 
338 aa  290  3e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.574416  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2632  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  48.59 
 
 
338 aa  289  6e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.275441  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3098  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  50.16 
 
 
338 aa  287  1e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.387961  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3375  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  49.84 
 
 
350 aa  287  2e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.354679  normal  0.126247 
 
 
-
 
NC_003296  RS02616  lipase signal peptide protein  50.16 
 
 
339 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.83944 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2852  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  47.6 
 
 
324 aa  284  2.0000000000000002e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.255078 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3812  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  49.51 
 
 
339 aa  282  6.000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.422077  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3446  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  49.03 
 
 
339 aa  282  6.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2094  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  49.19 
 
 
339 aa  281  1e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.317288  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2080  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  49.19 
 
 
339 aa  280  2e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1958  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  49.19 
 
 
339 aa  280  3e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0704762  normal  0.359976 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2661  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  49.17 
 
 
325 aa  279  4e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1386  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  50.7 
 
 
326 aa  278  7e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.372479  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0403  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  48.7 
 
 
336 aa  272  6e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2787  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  46.73 
 
 
328 aa  269  4e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.528915  normal  0.113664 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0587  lipase  48.41 
 
 
337 aa  268  1e-70  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0542  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  48.41 
 
 
337 aa  267  2e-70  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7669  esterase/lipase/thioesterase  49.32 
 
 
348 aa  267  2e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.753901  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2196  lipase  48.95 
 
 
341 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.56452  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5601  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  48.26 
 
 
342 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0839  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  47.43 
 
 
339 aa  264  1e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6617  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  48.63 
 
 
344 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.141576 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0746  Alpha/beta hydrolase fold-3  47.4 
 
 
331 aa  263  2e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.192331 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5770  Alpha/beta hydrolase fold-3  48.46 
 
 
344 aa  263  2e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.950469  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6135  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  48.46 
 
 
344 aa  263  2e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.970207  normal  0.96238 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0373  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  44.67 
 
 
339 aa  263  4e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00172019  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3807  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  50 
 
 
330 aa  260  2e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.136684  normal  0.307308 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6063  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  48.59 
 
 
344 aa  259  4e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5712  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  47.6 
 
 
344 aa  258  1e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.579878 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5440  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  47.58 
 
 
330 aa  255  6e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.165063 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1345  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  46.13 
 
 
349 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5954  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  46.92 
 
 
344 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350499  normal  0.849659 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4939  Alpha/beta hydrolase fold-3  43.58 
 
 
321 aa  242  6e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3221  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  43.58 
 
 
321 aa  242  6e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.865641 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1740  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  48.81 
 
 
327 aa  240  2e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5462  esterase/lipase/thioesterase  44.24 
 
 
311 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.536989  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0318  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.24 
 
 
329 aa  201  9.999999999999999e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1839  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  44.49 
 
 
311 aa  197  3e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.166294  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3757  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36.81 
 
 
311 aa  195  7e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.315687 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2888  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.34 
 
 
315 aa  194  1e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.564555  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0305  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.68 
 
 
310 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0324  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.68 
 
 
310 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381561  normal  0.441011 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0314  Alpha/beta hydrolase fold-3  40.68 
 
 
310 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0217857  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3653  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  43.22 
 
 
308 aa  191  1e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1665  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  47.23 
 
 
313 aa  190  2.9999999999999997e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.414824 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0328  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  42.86 
 
 
311 aa  189  5e-47  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.195989  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4942  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  41.13 
 
 
314 aa  188  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2443  putative lipase  40.6 
 
 
292 aa  185  9e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4552  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.64 
 
 
307 aa  183  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0574937 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3830  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  40.5 
 
 
311 aa  181  2e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1441  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.92 
 
 
317 aa  180  4e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2782  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  38.01 
 
 
320 aa  179  5.999999999999999e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6777  lipolytic protein  39.56 
 
 
316 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1023  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  43.85 
 
 
313 aa  177  2e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.205112 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1307  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  43.82 
 
 
313 aa  176  5e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0504826 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1213  lipolytic protein  41.43 
 
 
309 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.583626  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2623  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  44.64 
 
 
325 aa  174  9.999999999999999e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.04826  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3028  esterase/lipase/thioesterase  38.89 
 
 
314 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0380453  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0758  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  38.41 
 
 
376 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0959861 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0890  putative lipase  45.37 
 
 
310 aa  172  5e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.120136  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1537  lipolytic protein  41.8 
 
 
318 aa  172  5.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000528451  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0952  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  38.11 
 
 
318 aa  172  5.999999999999999e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4223  putative lipase/esterase  38.62 
 
 
320 aa  171  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1872  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.63 
 
 
321 aa  171  1e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.208365 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2875  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  38.83 
 
 
310 aa  170  2e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.406722  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3090  esterase/lipase/thioesterase  40.68 
 
 
312 aa  171  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.110672 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2420  Alpha/beta hydrolase fold-3  39.22 
 
 
314 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.40186  normal  0.0240914 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1039  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.45 
 
 
319 aa  170  3e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.240306  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7511  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  42.74 
 
 
315 aa  169  4e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0942  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  41.2 
 
 
312 aa  169  6e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.911706  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1376  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.41 
 
 
319 aa  169  8e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2525  Alpha/beta hydrolase fold-3  36.92 
 
 
320 aa  168  1e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.253728  hitchhiker  0.0086518 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1217  esterase/lipase/thioesterase  38.14 
 
 
312 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.265662  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0604  esterase/lipase-like protein  39.5 
 
 
346 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000548029 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0482  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  43.5 
 
 
332 aa  166  5e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.459032 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3606  putative esterase/lipase  36.95 
 
 
317 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0140226  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2517  Alpha/beta hydrolase fold-3  40.78 
 
 
323 aa  164  1.0000000000000001e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1072  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  41.15 
 
 
301 aa  164  2.0000000000000002e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4747  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.79 
 
 
321 aa  163  3e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.340698 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2149  esterase  36.46 
 
 
327 aa  164  3e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.571697  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2464  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  44.84 
 
 
317 aa  163  3e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000166142  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1430  esterase  36.82 
 
 
319 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.482815  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2448  esterase  36.82 
 
 
352 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.376855  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3383  esterase  36.82 
 
 
319 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.418724  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2662  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.19 
 
 
313 aa  162  5.0000000000000005e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000201414 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2325  carboxylesterase Est2  36.82 
 
 
321 aa  162  6e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.152899  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1194  carboxylesterase Est2  36.82 
 
 
321 aa  162  6e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.5931  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>