More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0839 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012917  PC1_0839  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  100 
 
 
339 aa  698    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0373  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  87.32 
 
 
339 aa  625  1e-178  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00172019  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1766  lipase  67.74 
 
 
339 aa  476  1e-133  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3998  esterase/lipase/thioesterase  67.16 
 
 
337 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000526107  normal  0.48129 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3812  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  64.81 
 
 
339 aa  457  1e-127  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.422077  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1958  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  64.81 
 
 
339 aa  456  1e-127  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0704762  normal  0.359976 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0403  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  66.57 
 
 
336 aa  450  1e-125  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2094  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  63.05 
 
 
339 aa  450  1e-125  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.317288  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2080  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  63.74 
 
 
339 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2632  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  62.87 
 
 
338 aa  444  1e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.275441  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3098  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  61.54 
 
 
338 aa  441  1e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.387961  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2852  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  65.5 
 
 
324 aa  437  1e-121  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.255078 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1969  esterase/lipase/thioesterase  66.34 
 
 
338 aa  436  1e-121  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.574416  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3375  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  62.43 
 
 
350 aa  436  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.354679  normal  0.126247 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2661  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  62.42 
 
 
325 aa  424  1e-118  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0542  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  63.01 
 
 
337 aa  422  1e-117  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0587  lipase  63.01 
 
 
337 aa  424  1e-117  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1386  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  61.66 
 
 
326 aa  420  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.372479  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2196  lipase  60.12 
 
 
341 aa  414  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.56452  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02616  lipase signal peptide protein  64.17 
 
 
339 aa  410  1e-113  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.83944 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6063  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  63.14 
 
 
344 aa  409  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7669  esterase/lipase/thioesterase  62.5 
 
 
348 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.753901  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5954  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  62.18 
 
 
344 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350499  normal  0.849659 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5712  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  62.18 
 
 
344 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.579878 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5770  Alpha/beta hydrolase fold-3  62.18 
 
 
344 aa  403  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.950469  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3446  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  62.54 
 
 
339 aa  402  1e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6135  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  62.18 
 
 
344 aa  403  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.970207  normal  0.96238 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6617  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  61.54 
 
 
344 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.141576 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1345  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  59.12 
 
 
349 aa  396  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2787  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  61.46 
 
 
328 aa  395  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.528915  normal  0.113664 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3807  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  57.45 
 
 
330 aa  391  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.136684  normal  0.307308 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4939  Alpha/beta hydrolase fold-3  57.37 
 
 
321 aa  385  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3221  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  57.37 
 
 
321 aa  385  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.865641 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5601  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  60.66 
 
 
342 aa  384  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0746  Alpha/beta hydrolase fold-3  54.25 
 
 
331 aa  352  5e-96  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.192331 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5440  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  52.4 
 
 
330 aa  347  2e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.165063 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3113  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  51.34 
 
 
337 aa  325  8.000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.723098  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2844  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  54.25 
 
 
337 aa  324  2e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.446939  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0880  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  51.8 
 
 
324 aa  323  3e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.691733  hitchhiker  0.0000246401 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0318  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  48.87 
 
 
329 aa  315  9e-85  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1740  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  48.35 
 
 
327 aa  313  1.9999999999999998e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1856  hypothetical protein  48.14 
 
 
321 aa  292  5e-78  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1851  hypothetical protein  47.97 
 
 
321 aa  288  6e-77  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5453  putative exported lipase/esterase  47.1 
 
 
319 aa  285  1.0000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.131781  normal  0.198573 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2931  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  47.74 
 
 
316 aa  268  8e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.360942  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2316  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  47.43 
 
 
321 aa  264  1e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1940  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  46.42 
 
 
325 aa  264  2e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.270718  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5060  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  44.73 
 
 
314 aa  233  3e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5462  esterase/lipase/thioesterase  40.21 
 
 
311 aa  218  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.536989  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0996  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.43 
 
 
321 aa  215  9e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3653  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.44 
 
 
308 aa  208  1e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3757  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.37 
 
 
311 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.315687 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1441  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  38.26 
 
 
317 aa  200  3.9999999999999996e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0942  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.82 
 
 
312 aa  199  6e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.911706  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2443  putative lipase  40.21 
 
 
292 aa  196  3e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1839  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  40.38 
 
 
311 aa  194  1e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.166294  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1213  lipolytic protein  36.01 
 
 
309 aa  192  5e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.583626  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1665  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.08 
 
 
313 aa  191  2e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.414824 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4223  putative lipase/esterase  36.65 
 
 
320 aa  188  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2072  putative fusion protein  39.21 
 
 
884 aa  186  4e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.987766  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0604  esterase/lipase-like protein  37.07 
 
 
346 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000548029 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2420  Alpha/beta hydrolase fold-3  34.64 
 
 
314 aa  183  3e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.40186  normal  0.0240914 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2875  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  33.01 
 
 
310 aa  181  2e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.406722  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3028  esterase/lipase/thioesterase  36.08 
 
 
314 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0380453  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4942  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  34.3 
 
 
314 aa  180  2.9999999999999997e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0952  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  33.9 
 
 
318 aa  179  4.999999999999999e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0890  putative lipase  36.07 
 
 
310 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.120136  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2703  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.11 
 
 
316 aa  178  9e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00278676  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1023  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  40.89 
 
 
313 aa  177  3e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.205112 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2782  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  31.85 
 
 
320 aa  176  4e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3222  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.06 
 
 
316 aa  175  8e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.29245  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4552  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.86 
 
 
307 aa  175  8e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0574937 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7511  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.55 
 
 
315 aa  174  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4031  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  30.99 
 
 
312 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.834602  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0305  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.96 
 
 
310 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0758  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  33.86 
 
 
376 aa  173  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0959861 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0314  Alpha/beta hydrolase fold-3  35.07 
 
 
310 aa  173  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0217857  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0324  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.07 
 
 
310 aa  173  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381561  normal  0.441011 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0328  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35.25 
 
 
311 aa  172  5.999999999999999e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.195989  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1072  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.41 
 
 
301 aa  172  6.999999999999999e-42  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1620  lipolytic protein  37.89 
 
 
312 aa  171  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0105415  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4747  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.11 
 
 
321 aa  171  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.340698 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1307  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.22 
 
 
313 aa  170  3e-41  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0504826 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1537  lipolytic protein  38.43 
 
 
318 aa  169  4e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000528451  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1872  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.33 
 
 
321 aa  169  7e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.208365 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1475  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  33.22 
 
 
326 aa  167  2e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.617097  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1376  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.4 
 
 
319 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3416  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  30.28 
 
 
359 aa  167  2.9999999999999998e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.733003  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2383  Alpha/beta hydrolase fold-3  33.33 
 
 
327 aa  166  4e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.150129  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0772  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  34.73 
 
 
312 aa  166  5e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000370345 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0613  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.77 
 
 
312 aa  166  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3924  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.23 
 
 
326 aa  166  5.9999999999999996e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.163224  normal  0.0505631 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1772  esterase/lipase protein  31.85 
 
 
344 aa  165  8e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2671  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.52 
 
 
320 aa  165  8e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.199092  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1217  esterase/lipase/thioesterase  34.03 
 
 
312 aa  165  9e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.265662  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2888  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.04 
 
 
315 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.564555  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3830  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  32.62 
 
 
311 aa  165  1.0000000000000001e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1944  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.98 
 
 
321 aa  165  1.0000000000000001e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1843  Alpha/beta hydrolase fold-3  33.22 
 
 
344 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0838402  normal  0.122403 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1434  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  32.52 
 
 
326 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0842646 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>