More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1386 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_1386  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  100 
 
 
326 aa  665    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.372479  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3375  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  73.75 
 
 
350 aa  497  1e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.354679  normal  0.126247 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1345  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  68.85 
 
 
349 aa  467  9.999999999999999e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3807  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  71.11 
 
 
330 aa  461  9.999999999999999e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.136684  normal  0.307308 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2787  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  69.69 
 
 
328 aa  459  9.999999999999999e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.528915  normal  0.113664 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1766  lipase  68.77 
 
 
339 aa  454  1e-127  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2094  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  67.51 
 
 
339 aa  455  1e-127  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.317288  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3812  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  67.82 
 
 
339 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.422077  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2661  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  67.09 
 
 
325 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1958  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  67.19 
 
 
339 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0704762  normal  0.359976 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2852  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  68.34 
 
 
324 aa  451  1e-125  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.255078 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3998  esterase/lipase/thioesterase  69.03 
 
 
337 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000526107  normal  0.48129 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2080  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  65.93 
 
 
339 aa  443  1e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2632  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  66.25 
 
 
338 aa  442  1e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.275441  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3098  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  64.67 
 
 
338 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.387961  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1969  esterase/lipase/thioesterase  65.51 
 
 
338 aa  436  1e-121  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.574416  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2196  lipase  64.15 
 
 
341 aa  422  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.56452  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3446  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  64.76 
 
 
339 aa  424  1e-117  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0839  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  61.66 
 
 
339 aa  420  1e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5440  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  62.26 
 
 
330 aa  420  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.165063 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0373  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  62.89 
 
 
339 aa  418  1e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00172019  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02616  lipase signal peptide protein  63.17 
 
 
339 aa  414  1e-114  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.83944 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7669  esterase/lipase/thioesterase  69.37 
 
 
348 aa  412  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.753901  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0587  lipase  62.78 
 
 
337 aa  414  1e-114  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0542  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  62.78 
 
 
337 aa  413  1e-114  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5770  Alpha/beta hydrolase fold-3  68.04 
 
 
344 aa  411  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.950469  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6135  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  68.04 
 
 
344 aa  411  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.970207  normal  0.96238 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6063  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  65.25 
 
 
344 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5601  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  63.93 
 
 
342 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6617  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  67.35 
 
 
344 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.141576 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0403  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  62.03 
 
 
336 aa  404  1e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5712  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  63.93 
 
 
344 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.579878 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5954  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  63.28 
 
 
344 aa  395  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350499  normal  0.849659 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4939  Alpha/beta hydrolase fold-3  60.13 
 
 
321 aa  393  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3221  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  60.13 
 
 
321 aa  393  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.865641 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1740  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  57.05 
 
 
327 aa  379  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0318  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  53.61 
 
 
329 aa  364  1e-99  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0746  Alpha/beta hydrolase fold-3  55.56 
 
 
331 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.192331 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3113  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  56.01 
 
 
337 aa  336  2.9999999999999997e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.723098  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2844  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  54.92 
 
 
337 aa  331  1e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.446939  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0880  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  54.14 
 
 
324 aa  323  3e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.691733  hitchhiker  0.0000246401 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1856  hypothetical protein  51.86 
 
 
321 aa  305  9.000000000000001e-82  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1851  hypothetical protein  51.53 
 
 
321 aa  303  2.0000000000000002e-81  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5453  putative exported lipase/esterase  51.54 
 
 
319 aa  285  5.999999999999999e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.131781  normal  0.198573 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2931  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  51.53 
 
 
316 aa  282  5.000000000000001e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.360942  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2316  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  50.7 
 
 
321 aa  278  7e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1940  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  48.67 
 
 
325 aa  255  8e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.270718  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5060  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  52.36 
 
 
314 aa  243  3e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0996  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  42.76 
 
 
321 aa  229  3e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5462  esterase/lipase/thioesterase  39.59 
 
 
311 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.536989  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1213  lipolytic protein  39.68 
 
 
309 aa  204  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.583626  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1665  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  41.67 
 
 
313 aa  201  9.999999999999999e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.414824 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0942  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.21 
 
 
312 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.911706  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1839  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  39.78 
 
 
311 aa  196  5.000000000000001e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.166294  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1441  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  38.14 
 
 
317 aa  194  2e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3757  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.67 
 
 
311 aa  194  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.315687 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3653  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40 
 
 
308 aa  189  7e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1023  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  41.15 
 
 
313 aa  189  8e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.205112 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4552  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.72 
 
 
307 aa  187  2e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0574937 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0314  Alpha/beta hydrolase fold-3  38.71 
 
 
310 aa  186  4e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0217857  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0324  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.71 
 
 
310 aa  186  4e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381561  normal  0.441011 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2875  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  38.06 
 
 
310 aa  184  2.0000000000000003e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.406722  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0305  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.31 
 
 
310 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0604  esterase/lipase-like protein  38.21 
 
 
346 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000548029 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2443  putative lipase  38.57 
 
 
292 aa  182  6e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4942  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36.88 
 
 
314 aa  182  8.000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7511  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  45.22 
 
 
315 aa  181  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2888  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.93 
 
 
315 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.564555  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0952  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.46 
 
 
318 aa  179  8e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1487  putative lipase/esterase  38.87 
 
 
305 aa  177  2e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0809512  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4031  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.39 
 
 
312 aa  176  4e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.834602  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0758  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.24 
 
 
376 aa  176  5e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0959861 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1307  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.08 
 
 
313 aa  174  9.999999999999999e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0504826 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2072  putative fusion protein  37.59 
 
 
884 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.987766  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4884  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  41.48 
 
 
289 aa  172  5e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3830  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.28 
 
 
311 aa  172  5.999999999999999e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0890  putative lipase  36.65 
 
 
310 aa  172  7.999999999999999e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.120136  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1072  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.9 
 
 
301 aa  172  9e-42  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3222  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  31.94 
 
 
316 aa  171  1e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.29245  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1713  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.28 
 
 
329 aa  171  2e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.386293  normal  0.298888 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2863  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  32.62 
 
 
325 aa  170  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2782  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  33.44 
 
 
320 aa  170  3e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1991  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  34.28 
 
 
320 aa  170  3e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1772  esterase/lipase protein  33.33 
 
 
344 aa  168  1e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3606  putative esterase/lipase  34.44 
 
 
317 aa  168  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0140226  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2671  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  31.53 
 
 
320 aa  167  2e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.199092  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3924  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.09 
 
 
326 aa  167  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.163224  normal  0.0505631 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2623  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35.88 
 
 
325 aa  168  2e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.04826  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3416  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.04 
 
 
359 aa  167  2.9999999999999998e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.733003  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2517  Alpha/beta hydrolase fold-3  41.3 
 
 
323 aa  167  2.9999999999999998e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4223  putative lipase/esterase  35.45 
 
 
320 aa  166  4e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2662  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.44 
 
 
313 aa  166  5e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000201414 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1475  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  32.6 
 
 
326 aa  165  9e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.617097  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1872  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.92 
 
 
321 aa  165  1.0000000000000001e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.208365 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6777  lipolytic protein  36.98 
 
 
316 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2420  Alpha/beta hydrolase fold-3  34.04 
 
 
314 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.40186  normal  0.0240914 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1654  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.1 
 
 
356 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0299965  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1944  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.33 
 
 
321 aa  165  1.0000000000000001e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2383  Alpha/beta hydrolase fold-3  32.58 
 
 
327 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.150129  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1434  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  32.6 
 
 
326 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0842646 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>