More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3998 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3998  esterase/lipase/thioesterase  100 
 
 
337 aa  692    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000526107  normal  0.48129 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1766  lipase  87.61 
 
 
339 aa  620  1e-176  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3812  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  74.04 
 
 
339 aa  521  1e-147  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.422077  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1958  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  73.45 
 
 
339 aa  518  1e-146  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0704762  normal  0.359976 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2094  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  73.16 
 
 
339 aa  518  1e-146  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.317288  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3098  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  71.73 
 
 
338 aa  512  1e-144  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.387961  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1969  esterase/lipase/thioesterase  73.13 
 
 
338 aa  512  1e-144  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.574416  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2080  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  73.16 
 
 
339 aa  510  1e-143  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2632  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  70.24 
 
 
338 aa  494  1e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.275441  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3375  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  71.99 
 
 
350 aa  494  1e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.354679  normal  0.126247 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2852  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  75.48 
 
 
324 aa  489  1e-137  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.255078 
 
 
-
 
NC_003296  RS02616  lipase signal peptide protein  74.68 
 
 
339 aa  485  1e-136  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.83944 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3446  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  73.08 
 
 
339 aa  477  1e-133  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2661  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  70.42 
 
 
325 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0839  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  67.16 
 
 
339 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0542  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  72.12 
 
 
337 aa  469  1.0000000000000001e-131  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0373  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  67.35 
 
 
339 aa  468  1.0000000000000001e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00172019  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0587  lipase  70.72 
 
 
337 aa  471  1.0000000000000001e-131  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0403  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  69.77 
 
 
336 aa  452  1.0000000000000001e-126  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2196  lipase  67.48 
 
 
341 aa  450  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.56452  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1386  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  69.03 
 
 
326 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.372479  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7669  esterase/lipase/thioesterase  69.13 
 
 
348 aa  442  1e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.753901  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1345  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  68.27 
 
 
349 aa  443  1e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5712  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  69.48 
 
 
344 aa  441  1e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.579878 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5954  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  69.48 
 
 
344 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350499  normal  0.849659 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6063  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  68.81 
 
 
344 aa  436  1e-121  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5770  Alpha/beta hydrolase fold-3  68.49 
 
 
344 aa  437  1e-121  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.950469  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6135  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  68.49 
 
 
344 aa  437  1e-121  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.970207  normal  0.96238 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6617  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  67.85 
 
 
344 aa  432  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.141576 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2787  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  66.77 
 
 
328 aa  431  1e-119  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.528915  normal  0.113664 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5601  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  66.56 
 
 
342 aa  419  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4939  Alpha/beta hydrolase fold-3  63.96 
 
 
321 aa  414  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3221  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  63.96 
 
 
321 aa  414  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.865641 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3807  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  61.88 
 
 
330 aa  409  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.136684  normal  0.307308 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0746  Alpha/beta hydrolase fold-3  58.2 
 
 
331 aa  379  1e-104  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.192331 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5440  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  57.56 
 
 
330 aa  380  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.165063 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0880  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  57.1 
 
 
324 aa  358  7e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.691733  hitchhiker  0.0000246401 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2844  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  59.24 
 
 
337 aa  353  2e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.446939  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3113  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  58.73 
 
 
337 aa  352  5e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.723098  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1740  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  53.27 
 
 
327 aa  342  5e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0318  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  53.25 
 
 
329 aa  340  2e-92  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5453  putative exported lipase/esterase  55.24 
 
 
319 aa  335  3.9999999999999995e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.131781  normal  0.198573 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1856  hypothetical protein  52.13 
 
 
321 aa  327  1.0000000000000001e-88  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1851  hypothetical protein  51.8 
 
 
321 aa  325  5e-88  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2931  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  54.11 
 
 
316 aa  306  4.0000000000000004e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.360942  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2316  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  52.61 
 
 
321 aa  304  2.0000000000000002e-81  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1940  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  51.66 
 
 
325 aa  288  8e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.270718  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5060  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  50.85 
 
 
314 aa  264  2e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0996  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  43.3 
 
 
321 aa  235  6e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5462  esterase/lipase/thioesterase  42.81 
 
 
311 aa  228  9e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.536989  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3757  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  38.91 
 
 
311 aa  218  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.315687 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0942  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.74 
 
 
312 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.911706  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1441  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  38.97 
 
 
317 aa  209  8e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1213  lipolytic protein  38.96 
 
 
309 aa  204  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.583626  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1665  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  42.47 
 
 
313 aa  205  1e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.414824 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4552  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.89 
 
 
307 aa  204  2e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0574937 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4942  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  38.91 
 
 
314 aa  203  4e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0890  putative lipase  41.24 
 
 
310 aa  202  5e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.120136  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0952  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  38.75 
 
 
318 aa  202  6e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1839  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  42.54 
 
 
311 aa  202  6e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.166294  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2072  putative fusion protein  38.59 
 
 
884 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.987766  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2443  putative lipase  41.26 
 
 
292 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3653  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.56 
 
 
308 aa  196  5.000000000000001e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3028  esterase/lipase/thioesterase  37.92 
 
 
314 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0380453  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0604  esterase/lipase-like protein  39 
 
 
346 aa  193  3e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000548029 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2875  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  38.75 
 
 
310 aa  192  5e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.406722  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2420  Alpha/beta hydrolase fold-3  38.3 
 
 
314 aa  192  9e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.40186  normal  0.0240914 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4223  putative lipase/esterase  41.03 
 
 
320 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0758  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36.16 
 
 
376 aa  189  4e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0959861 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0314  Alpha/beta hydrolase fold-3  36.27 
 
 
310 aa  190  4e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0217857  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0324  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.27 
 
 
310 aa  190  4e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381561  normal  0.441011 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2010  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.54 
 
 
335 aa  189  5e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0305  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.54 
 
 
310 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1023  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  42.86 
 
 
313 aa  187  2e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.205112 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2888  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.33 
 
 
315 aa  187  3e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.564555  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2703  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  38.59 
 
 
316 aa  186  4e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00278676  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2623  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  40.08 
 
 
325 aa  186  5e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.04826  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1072  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.59 
 
 
301 aa  185  8e-46  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7511  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  45.04 
 
 
315 aa  185  8e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1307  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  41.64 
 
 
313 aa  183  3e-45  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0504826 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3830  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36.75 
 
 
311 aa  183  4.0000000000000006e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2782  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35.74 
 
 
320 aa  183  4.0000000000000006e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1872  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.1 
 
 
321 aa  178  1e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.208365 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3428  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.37 
 
 
322 aa  177  3e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3606  putative esterase/lipase  36.22 
 
 
317 aa  176  4e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0140226  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1475  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  34.09 
 
 
326 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.617097  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4884  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.29 
 
 
289 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1772  esterase/lipase protein  33.23 
 
 
344 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0983  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.48 
 
 
309 aa  174  1.9999999999999998e-42  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.875721 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4031  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.23 
 
 
312 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.834602  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2006  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36.58 
 
 
352 aa  174  1.9999999999999998e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.368207  normal  0.502337 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0482  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.77 
 
 
332 aa  172  5e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.459032 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1217  esterase/lipase/thioesterase  36.57 
 
 
312 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.265662  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1487  putative lipase/esterase  38.65 
 
 
305 aa  172  7.999999999999999e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0809512  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3924  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.26 
 
 
326 aa  172  7.999999999999999e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.163224  normal  0.0505631 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1620  lipolytic protein  38.28 
 
 
312 aa  172  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0105415  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4203  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.24 
 
 
375 aa  171  1e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.307246  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1713  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.64 
 
 
329 aa  171  1e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.386293  normal  0.298888 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4256  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  41.22 
 
 
347 aa  171  1e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0760103  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11428  lipase lipH  36.71 
 
 
319 aa  171  2e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.13371e-22  normal  0.199346 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>