More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1740 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_1740  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  100 
 
 
327 aa  671    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5440  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  60.06 
 
 
330 aa  409  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.165063 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3375  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  58.1 
 
 
350 aa  392  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.354679  normal  0.126247 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1345  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  56.92 
 
 
349 aa  387  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0318  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  55.76 
 
 
329 aa  382  1e-105  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1386  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  57.05 
 
 
326 aa  379  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.372479  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2196  lipase  56.7 
 
 
341 aa  360  1e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.56452  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3807  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  53.8 
 
 
330 aa  358  6e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.136684  normal  0.307308 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2632  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  56.25 
 
 
338 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.275441  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2787  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  53.54 
 
 
328 aa  355  5e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.528915  normal  0.113664 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1766  lipase  53.8 
 
 
339 aa  354  1e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3446  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  55.59 
 
 
339 aa  352  5e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3098  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  52.31 
 
 
338 aa  350  2e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.387961  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0587  lipase  52.8 
 
 
337 aa  349  4e-95  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0542  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  53.48 
 
 
337 aa  348  1e-94  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2094  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  52 
 
 
339 aa  346  3e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.317288  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0403  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  54.95 
 
 
336 aa  346  3e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7669  esterase/lipase/thioesterase  56.58 
 
 
348 aa  346  4e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.753901  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5601  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  55.59 
 
 
342 aa  344  1e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5712  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  55.19 
 
 
344 aa  343  2e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.579878 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3998  esterase/lipase/thioesterase  53.27 
 
 
337 aa  342  4e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000526107  normal  0.48129 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6063  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  55.59 
 
 
344 aa  342  4e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5770  Alpha/beta hydrolase fold-3  55.26 
 
 
344 aa  342  5e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.950469  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6135  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  55.26 
 
 
344 aa  342  5e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.970207  normal  0.96238 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5954  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  54.87 
 
 
344 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350499  normal  0.849659 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6617  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  55.26 
 
 
344 aa  341  1e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.141576 
 
 
-
 
NC_003296  RS02616  lipase signal peptide protein  54.14 
 
 
339 aa  340  2e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.83944 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3812  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  50.46 
 
 
339 aa  339  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.422077  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2852  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  53.75 
 
 
324 aa  340  2.9999999999999998e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.255078 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1969  esterase/lipase/thioesterase  52.85 
 
 
338 aa  338  7e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.574416  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1958  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  50.46 
 
 
339 aa  338  7e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0704762  normal  0.359976 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2661  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  50.63 
 
 
325 aa  335  9e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2080  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  49.23 
 
 
339 aa  326  3e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0746  Alpha/beta hydrolase fold-3  51.13 
 
 
331 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.192331 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0839  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  48.35 
 
 
339 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4939  Alpha/beta hydrolase fold-3  50.32 
 
 
321 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3221  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  50.32 
 
 
321 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.865641 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0373  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  47.45 
 
 
339 aa  308  6.999999999999999e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00172019  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3113  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  48.41 
 
 
337 aa  295  6e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.723098  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2844  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  48.25 
 
 
337 aa  288  8e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.446939  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0880  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  46.23 
 
 
324 aa  276  5e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.691733  hitchhiker  0.0000246401 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1851  hypothetical protein  43.96 
 
 
321 aa  256  3e-67  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1856  hypothetical protein  43.96 
 
 
321 aa  256  4e-67  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5453  putative exported lipase/esterase  42.95 
 
 
319 aa  249  6e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.131781  normal  0.198573 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2316  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  48.81 
 
 
321 aa  240  2e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2931  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  42.77 
 
 
316 aa  239  5.999999999999999e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.360942  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5060  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  43.33 
 
 
314 aa  231  2e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1940  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  45.6 
 
 
325 aa  219  3.9999999999999997e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.270718  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0996  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.73 
 
 
321 aa  215  7e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5462  esterase/lipase/thioesterase  38.3 
 
 
311 aa  186  3e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.536989  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1839  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  38.08 
 
 
311 aa  181  2e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.166294  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1665  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.92 
 
 
313 aa  179  4e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.414824 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0314  Alpha/beta hydrolase fold-3  34.85 
 
 
310 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0217857  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0324  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.85 
 
 
310 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381561  normal  0.441011 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0305  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.53 
 
 
310 aa  175  7e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3653  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.99 
 
 
308 aa  169  6e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2782  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  33.33 
 
 
320 aa  166  5e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4552  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.04 
 
 
307 aa  165  8e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0574937 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0952  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36.84 
 
 
318 aa  164  1.0000000000000001e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2420  Alpha/beta hydrolase fold-3  33.79 
 
 
314 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.40186  normal  0.0240914 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1441  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36.01 
 
 
317 aa  162  1e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1213  lipolytic protein  33.92 
 
 
309 aa  160  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.583626  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2888  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.97 
 
 
315 aa  159  6e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.564555  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2768  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  32.59 
 
 
308 aa  157  2e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.718585 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3028  esterase/lipase/thioesterase  32.38 
 
 
314 aa  157  3e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0380453  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2703  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  33.12 
 
 
316 aa  155  6e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00278676  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4223  putative lipase/esterase  35 
 
 
320 aa  155  7e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1023  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  32.98 
 
 
313 aa  155  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.205112 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2875  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  34.68 
 
 
310 aa  155  1e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.406722  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2443  putative lipase  36.54 
 
 
292 aa  154  2e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3222  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.67 
 
 
316 aa  154  2e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.29245  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1487  putative lipase/esterase  38.98 
 
 
305 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0809512  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4942  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35.29 
 
 
314 aa  153  4e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3757  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  33.65 
 
 
311 aa  152  7e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.315687 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0328  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35.09 
 
 
311 aa  152  8.999999999999999e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.195989  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0942  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.19 
 
 
312 aa  152  8.999999999999999e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.911706  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3090  esterase/lipase/thioesterase  33.08 
 
 
312 aa  151  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.110672 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2671  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.11 
 
 
320 aa  152  1e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.199092  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2525  Alpha/beta hydrolase fold-3  32.28 
 
 
320 aa  152  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.253728  hitchhiker  0.0086518 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7511  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.26 
 
 
315 aa  151  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1307  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.18 
 
 
313 aa  150  2e-35  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0504826 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2623  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35 
 
 
325 aa  150  3e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.04826  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2072  putative fusion protein  33.69 
 
 
884 aa  149  4e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.987766  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0890  putative lipase  31.72 
 
 
310 aa  149  9e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.120136  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4031  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.89 
 
 
312 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.834602  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1654  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.17 
 
 
356 aa  147  3e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0299965  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1072  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.38 
 
 
301 aa  146  5e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3924  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.67 
 
 
326 aa  145  8.000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.163224  normal  0.0505631 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3830  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35.96 
 
 
311 aa  145  1e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1217  esterase/lipase/thioesterase  33.78 
 
 
312 aa  144  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.265662  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4747  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.88 
 
 
321 aa  144  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.340698 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3606  putative esterase/lipase  31.94 
 
 
317 aa  143  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0140226  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1249  esterase/lipase  32.48 
 
 
365 aa  144  3e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0945507  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1827  lipolytic protein  30.65 
 
 
323 aa  143  5e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2542  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.6 
 
 
304 aa  143  5e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.311533  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0604  esterase/lipase-like protein  31.82 
 
 
346 aa  142  7e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000548029 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3416  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  31.23 
 
 
359 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.733003  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2863  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  32.67 
 
 
325 aa  142  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0482  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.63 
 
 
332 aa  141  9.999999999999999e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.459032 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2861  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.21 
 
 
301 aa  141  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>