More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2080 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_3812  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  89.97 
 
 
339 aa  634    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.422077  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2094  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  90.56 
 
 
339 aa  637    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.317288  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2080  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  100 
 
 
339 aa  693    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1958  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  89.68 
 
 
339 aa  632  1e-180  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0704762  normal  0.359976 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1969  esterase/lipase/thioesterase  79.65 
 
 
338 aa  551  1e-156  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.574416  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3098  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  74.7 
 
 
338 aa  526  1e-148  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.387961  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2632  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  74.63 
 
 
338 aa  525  1e-148  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.275441  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1766  lipase  74.04 
 
 
339 aa  524  1e-147  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3998  esterase/lipase/thioesterase  73.16 
 
 
337 aa  510  1e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000526107  normal  0.48129 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2661  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  73.58 
 
 
325 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3375  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  67.26 
 
 
350 aa  479  1e-134  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.354679  normal  0.126247 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2852  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  69.65 
 
 
324 aa  456  1e-127  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.255078 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3446  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  68.99 
 
 
339 aa  453  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02616  lipase signal peptide protein  67.85 
 
 
339 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.83944 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0587  lipase  65.49 
 
 
337 aa  451  1.0000000000000001e-126  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0542  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  65.19 
 
 
337 aa  451  1e-125  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0839  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  63.74 
 
 
339 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1386  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  65.93 
 
 
326 aa  443  1e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.372479  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0373  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  62.06 
 
 
339 aa  434  1e-120  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00172019  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2787  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  66.35 
 
 
328 aa  429  1e-119  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.528915  normal  0.113664 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2196  lipase  62.54 
 
 
341 aa  425  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.56452  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5712  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  64.49 
 
 
344 aa  422  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.579878 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0403  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  61.83 
 
 
336 aa  423  1e-117  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5601  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  64.63 
 
 
342 aa  419  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7669  esterase/lipase/thioesterase  65.58 
 
 
348 aa  418  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.753901  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5954  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  64.17 
 
 
344 aa  419  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350499  normal  0.849659 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1345  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  63.09 
 
 
349 aa  421  1e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5770  Alpha/beta hydrolase fold-3  64.54 
 
 
344 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.950469  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6063  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  64.09 
 
 
344 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6135  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  64.54 
 
 
344 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.970207  normal  0.96238 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6617  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  64.22 
 
 
344 aa  413  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.141576 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3807  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  60.32 
 
 
330 aa  402  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.136684  normal  0.307308 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4939  Alpha/beta hydrolase fold-3  61.04 
 
 
321 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3221  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  61.04 
 
 
321 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.865641 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0746  Alpha/beta hydrolase fold-3  58.97 
 
 
331 aa  386  1e-106  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.192331 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5440  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  55.38 
 
 
330 aa  375  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.165063 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0880  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  58.06 
 
 
324 aa  347  2e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.691733  hitchhiker  0.0000246401 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3113  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  54.09 
 
 
337 aa  330  2e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.723098  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1740  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  49.23 
 
 
327 aa  326  3e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2844  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  54.11 
 
 
337 aa  326  3e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.446939  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0318  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  48.05 
 
 
329 aa  325  7e-88  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1856  hypothetical protein  50.48 
 
 
321 aa  322  6e-87  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1851  hypothetical protein  50.48 
 
 
321 aa  322  7e-87  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5453  putative exported lipase/esterase  51.13 
 
 
319 aa  299  4e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.131781  normal  0.198573 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2316  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  49.19 
 
 
321 aa  280  2e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2931  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  49.15 
 
 
316 aa  275  7e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.360942  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1940  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  48.87 
 
 
325 aa  270  2e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.270718  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5060  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  48.57 
 
 
314 aa  246  4.9999999999999997e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0996  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  44.49 
 
 
321 aa  226  5.0000000000000005e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5462  esterase/lipase/thioesterase  42.07 
 
 
311 aa  223  4.9999999999999996e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.536989  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0942  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  43.32 
 
 
312 aa  217  2e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.911706  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1665  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  43.6 
 
 
313 aa  209  7e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.414824 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1839  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  42.75 
 
 
311 aa  209  8e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.166294  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1023  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  41.67 
 
 
313 aa  205  8e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.205112 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4942  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  39.87 
 
 
314 aa  205  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3653  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  43.51 
 
 
308 aa  205  1e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3757  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  38.64 
 
 
311 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.315687 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1441  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  39.68 
 
 
317 aa  203  4e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1213  lipolytic protein  43.3 
 
 
309 aa  202  7e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.583626  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0604  esterase/lipase-like protein  39.53 
 
 
346 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000548029 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0890  putative lipase  40.48 
 
 
310 aa  199  6e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.120136  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2875  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  38.19 
 
 
310 aa  196  3e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.406722  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6777  lipolytic protein  39.56 
 
 
316 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4552  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.38 
 
 
307 aa  194  2e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0574937 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2443  putative lipase  41.87 
 
 
292 aa  194  2e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0758  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.9 
 
 
376 aa  192  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0959861 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7511  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  47.33 
 
 
315 aa  191  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2072  putative fusion protein  43.56 
 
 
884 aa  191  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.987766  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1307  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  41.54 
 
 
313 aa  189  5e-47  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0504826 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1072  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.71 
 
 
301 aa  189  9e-47  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0305  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.82 
 
 
310 aa  188  1e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0314  Alpha/beta hydrolase fold-3  40.82 
 
 
310 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0217857  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0324  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.82 
 
 
310 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381561  normal  0.441011 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1475  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35.85 
 
 
326 aa  187  3e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.617097  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2420  Alpha/beta hydrolase fold-3  36.58 
 
 
314 aa  187  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.40186  normal  0.0240914 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0952  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  39.53 
 
 
318 aa  187  3e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2703  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.91 
 
 
316 aa  186  4e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00278676  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3028  esterase/lipase/thioesterase  36.64 
 
 
314 aa  186  5e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0380453  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1434  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35.53 
 
 
326 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0842646 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4223  putative lipase/esterase  37.84 
 
 
320 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4031  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.46 
 
 
312 aa  183  3e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.834602  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0328  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35.11 
 
 
311 aa  182  1e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.195989  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1772  esterase/lipase protein  35.22 
 
 
344 aa  182  1e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1620  lipolytic protein  41.37 
 
 
312 aa  182  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0105415  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1920  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  43.53 
 
 
340 aa  181  1e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.884364 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0482  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  44.3 
 
 
332 aa  180  2.9999999999999997e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.459032 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3428  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  38.79 
 
 
322 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1940  Alpha/beta hydrolase fold-3  43.14 
 
 
375 aa  178  1e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.50518  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3924  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.59 
 
 
326 aa  178  1e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.163224  normal  0.0505631 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1986  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  43.14 
 
 
375 aa  178  1e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2888  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40 
 
 
315 aa  177  2e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.564555  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2010  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.21 
 
 
335 aa  177  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2782  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35.74 
 
 
320 aa  177  2e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4256  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  43.2 
 
 
347 aa  176  4e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0760103  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4747  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.49 
 
 
321 aa  176  7e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.340698 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2861  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.3 
 
 
301 aa  176  7e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1713  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.07 
 
 
329 aa  176  7e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.386293  normal  0.298888 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1537  lipolytic protein  43.04 
 
 
318 aa  175  9e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000528451  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1419  lipolytic protein  34.42 
 
 
383 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.252701  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1376  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.27 
 
 
319 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>