More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5954 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010557  BamMC406_5712  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  98.84 
 
 
344 aa  690    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.579878 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5954  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  100 
 
 
344 aa  698    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350499  normal  0.849659 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6063  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  91.28 
 
 
344 aa  621  1e-177  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7669  esterase/lipase/thioesterase  89.08 
 
 
348 aa  615  1e-175  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.753901  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5770  Alpha/beta hydrolase fold-3  91.28 
 
 
344 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.950469  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6135  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  91.28 
 
 
344 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.970207  normal  0.96238 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6617  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  90.99 
 
 
344 aa  597  1e-170  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.141576 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2196  lipase  78.9 
 
 
341 aa  547  1e-155  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.56452  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5601  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  80.71 
 
 
342 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4939  Alpha/beta hydrolase fold-3  72.12 
 
 
321 aa  473  1e-132  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3221  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  72.12 
 
 
321 aa  473  1e-132  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.865641 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3375  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  67.52 
 
 
350 aa  442  1e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.354679  normal  0.126247 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3998  esterase/lipase/thioesterase  69.48 
 
 
337 aa  441  1e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000526107  normal  0.48129 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1766  lipase  66.46 
 
 
339 aa  431  1e-120  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2094  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  62.79 
 
 
339 aa  433  1e-120  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.317288  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3812  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  61.63 
 
 
339 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.422077  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2080  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  61.92 
 
 
339 aa  424  1e-118  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1958  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  61.92 
 
 
339 aa  427  1e-118  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0704762  normal  0.359976 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3098  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  62.5 
 
 
338 aa  423  1e-117  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.387961  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02616  lipase signal peptide protein  67.21 
 
 
339 aa  414  9.999999999999999e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.83944 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2632  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  62.02 
 
 
338 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.275441  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3446  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  65.72 
 
 
339 aa  412  1e-114  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0839  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  59.01 
 
 
339 aa  410  1e-113  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1969  esterase/lipase/thioesterase  60.41 
 
 
338 aa  409  1e-113  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.574416  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0542  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  63.75 
 
 
337 aa  405  1.0000000000000001e-112  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0373  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  58.5 
 
 
339 aa  404  1e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00172019  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0587  lipase  63.44 
 
 
337 aa  404  1e-111  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2852  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  66.32 
 
 
324 aa  398  9.999999999999999e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.255078 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0403  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  60.3 
 
 
336 aa  399  9.999999999999999e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2661  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  61.29 
 
 
325 aa  395  1e-109  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1345  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  60.45 
 
 
349 aa  395  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1386  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  63.28 
 
 
326 aa  396  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.372479  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2787  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  60.77 
 
 
328 aa  385  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.528915  normal  0.113664 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5440  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  59.02 
 
 
330 aa  371  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.165063 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3807  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  59.34 
 
 
330 aa  372  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.136684  normal  0.307308 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0746  Alpha/beta hydrolase fold-3  56.69 
 
 
331 aa  355  5e-97  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.192331 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1740  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  54.87 
 
 
327 aa  343  2.9999999999999997e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0318  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  50.16 
 
 
329 aa  325  5e-88  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2844  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  54.79 
 
 
337 aa  311  1e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.446939  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0880  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  51.12 
 
 
324 aa  311  1e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.691733  hitchhiker  0.0000246401 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3113  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  54.64 
 
 
337 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.723098  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5453  putative exported lipase/esterase  51.9 
 
 
319 aa  291  1e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.131781  normal  0.198573 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1856  hypothetical protein  45.9 
 
 
321 aa  284  2.0000000000000002e-75  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1851  hypothetical protein  45.57 
 
 
321 aa  281  1e-74  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2931  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  50 
 
 
316 aa  265  8e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.360942  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1940  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  50.53 
 
 
325 aa  259  7e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.270718  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2316  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  46.92 
 
 
321 aa  254  1.0000000000000001e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0996  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  45.75 
 
 
321 aa  235  1.0000000000000001e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5060  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  53.74 
 
 
314 aa  233  3e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1441  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  42.61 
 
 
317 aa  214  1.9999999999999998e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5462  esterase/lipase/thioesterase  42.59 
 
 
311 aa  204  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.536989  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1839  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  42.8 
 
 
311 aa  204  3e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.166294  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4552  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.46 
 
 
307 aa  199  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0574937 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0942  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.3 
 
 
312 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.911706  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1665  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  43.95 
 
 
313 aa  198  1.0000000000000001e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.414824 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0314  Alpha/beta hydrolase fold-3  38.83 
 
 
310 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0217857  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0324  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.83 
 
 
310 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381561  normal  0.441011 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3653  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  43.7 
 
 
308 aa  197  2.0000000000000003e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0305  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.46 
 
 
310 aa  195  9e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1213  lipolytic protein  41.2 
 
 
309 aa  194  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.583626  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1023  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  42.41 
 
 
313 aa  193  3e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.205112 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2443  putative lipase  39.58 
 
 
292 aa  193  3e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0952  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.63 
 
 
318 aa  191  1e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3757  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.37 
 
 
311 aa  191  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.315687 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3222  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.11 
 
 
316 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.29245  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4942  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  38.67 
 
 
314 aa  185  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7511  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  44.13 
 
 
315 aa  184  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4031  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.4 
 
 
312 aa  183  3e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.834602  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2782  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36.88 
 
 
320 aa  181  2e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2072  putative fusion protein  39.42 
 
 
884 aa  179  4.999999999999999e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.987766  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2875  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35.22 
 
 
310 aa  179  7e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.406722  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4223  putative lipase/esterase  37.37 
 
 
320 aa  177  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2888  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.78 
 
 
315 aa  177  2e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.564555  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3830  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35.34 
 
 
311 aa  177  3e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2671  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.48 
 
 
320 aa  176  4e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.199092  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0604  esterase/lipase-like protein  41.41 
 
 
346 aa  175  8e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000548029 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2218  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  41.39 
 
 
382 aa  175  9.999999999999999e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000644131  normal  0.0211816 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1072  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.87 
 
 
301 aa  175  9.999999999999999e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0758  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36.56 
 
 
376 aa  173  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0959861 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2420  Alpha/beta hydrolase fold-3  35.23 
 
 
314 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.40186  normal  0.0240914 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2623  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  40.17 
 
 
325 aa  172  5e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.04826  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0890  putative lipase  35.92 
 
 
310 aa  171  2e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.120136  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2703  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35.93 
 
 
316 aa  169  5e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00278676  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1537  lipolytic protein  41.95 
 
 
318 aa  169  5e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000528451  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3028  esterase/lipase/thioesterase  34.66 
 
 
314 aa  169  9e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0380453  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1249  esterase/lipase  34.47 
 
 
365 aa  168  1e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0945507  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1307  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.49 
 
 
313 aa  167  2e-40  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0504826 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1487  putative lipase/esterase  44.71 
 
 
305 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0809512  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2599  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  38.4 
 
 
370 aa  166  4e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2517  Alpha/beta hydrolase fold-3  39.27 
 
 
323 aa  164  1.0000000000000001e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0328  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  32.55 
 
 
311 aa  161  1e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.195989  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0482  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  42.22 
 
 
332 aa  162  1e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.459032 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3606  putative esterase/lipase  36.43 
 
 
317 aa  161  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0140226  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1872  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.63 
 
 
321 aa  162  1e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.208365 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1772  esterase/lipase protein  34.3 
 
 
344 aa  161  2e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2542  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.1 
 
 
304 aa  160  3e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.311533  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1475  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  34.63 
 
 
326 aa  160  3e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.617097  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1447  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.29 
 
 
308 aa  160  4e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.47859 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5215  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.97 
 
 
311 aa  160  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.85138  normal  0.647883 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1713  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.77 
 
 
329 aa  159  9e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.386293  normal  0.298888 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>