More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2072 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_2072  putative fusion protein  100 
 
 
884 aa  1823    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.987766  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1860  FAD dependent oxidoreductase  52.11 
 
 
554 aa  575  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.135048  normal  0.340753 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0500  cyclohexanone monooxygenase  52.03 
 
 
548 aa  543  1e-153  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0511  cyclohexanone monooxygenase  51.85 
 
 
548 aa  543  1e-153  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.016866  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0522  cyclohexanone monooxygenase  51.85 
 
 
548 aa  543  1e-153  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.430737  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3588  cyclohexanone monooxygenase  50.09 
 
 
540 aa  538  1e-151  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.558327  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0320  FAD dependent oxidoreductase  50.56 
 
 
543 aa  533  1e-150  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0643133  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0330  FAD dependent oxidoreductase  50.56 
 
 
540 aa  533  1e-150  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.282473 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7142  FAD dependent oxidoreductase  49.91 
 
 
555 aa  530  1e-149  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.47055  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0813  cyclohexanone monooxygenase  49.63 
 
 
543 aa  531  1e-149  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0322706  normal  0.777116 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1840  FAD dependent oxidoreductase  48.81 
 
 
573 aa  531  1e-149  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.445434  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0579  cyclohexanone monooxygenase  46.72 
 
 
559 aa  526  1e-148  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000280037 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4546  FAD dependent oxidoreductase  50.48 
 
 
524 aa  527  1e-148  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.326718 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1490  putative monooxygenase  48.87 
 
 
542 aa  523  1e-147  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.211285  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0311  FAD dependent oxidoreductase  51.14 
 
 
540 aa  523  1e-147  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2894  cyclohexanone monooxygenase  49.04 
 
 
536 aa  518  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.293401  normal  0.176776 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0607  cyclohexanone monooxygenase  46.22 
 
 
550 aa  509  1e-143  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00195368 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1038  cyclohexanone monooxygenase  48.15 
 
 
540 aa  512  1e-143  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2176  cyclohexanone monooxygenase  49.24 
 
 
559 aa  506  9.999999999999999e-143  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.665097  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3838  cyclohexanone monooxygenase  46.32 
 
 
554 aa  505  1e-141  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1220  flavin-containing monooxygenase FMO  46.42 
 
 
552 aa  504  1e-141  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.366472  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1530  flavin-containing monooxygenase FMO  46.4 
 
 
540 aa  503  1e-141  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2915  cyclohexanone monooxygenase  48.03 
 
 
546 aa  502  1e-140  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.245138  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3429  FAD dependent oxidoreductase  49.35 
 
 
544 aa  499  1e-140  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5461  flavin-containing monooxygenase FMO  46.97 
 
 
530 aa  494  9.999999999999999e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1558  flavin-containing monooxygenase FMO  45.27 
 
 
567 aa  493  9.999999999999999e-139  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.228791  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0898  steroid monooxygenase  43.91 
 
 
539 aa  463  1e-129  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0124072  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4332  cyclohexanone monooxygenase  46.48 
 
 
541 aa  460  9.999999999999999e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.483661  normal  0.91016 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1771  hypothetical protein  46.2 
 
 
539 aa  458  1e-127  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1837  hypothetical protein  46.2 
 
 
539 aa  457  1e-127  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1790  hypothetical protein  46.2 
 
 
539 aa  457  1e-127  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.784099  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2013  cyclohexanone monooxygenase  45.86 
 
 
542 aa  454  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.157904  normal  0.467237 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5565  flavin-containing monooxygenase FMO  44.01 
 
 
539 aa  444  1e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.192347  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1351  steroid monooxygenase  39.81 
 
 
541 aa  409  1.0000000000000001e-112  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.881234  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5034  Cyclohexanone monooxygenase  41.73 
 
 
541 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.623836 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0337  cyclohexanone monooxygenase  40.15 
 
 
547 aa  409  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000922158  normal  0.0121848 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3904  FAD dependent oxidoreductase  38.67 
 
 
548 aa  408  1.0000000000000001e-112  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.955647  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2283  phenylacetone monooxygenase  41.01 
 
 
554 aa  400  9.999999999999999e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1837  FAD dependent oxidoreductase  39.49 
 
 
547 aa  401  9.999999999999999e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.131168  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0088  steroid monooxygenase  40.19 
 
 
533 aa  402  9.999999999999999e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0276  putative cyclohexanone monooxygenase  37.48 
 
 
551 aa  397  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5297  FAD dependent oxidoreductase  39.92 
 
 
552 aa  399  1e-109  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3461  FAD dependent oxidoreductase  40.18 
 
 
548 aa  397  1e-109  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00115116  normal  0.0283002 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0610  steroid monooxygenase  38.72 
 
 
606 aa  396  1e-108  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0189312 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1781  cyclohexanone monooxygenase  37.66 
 
 
544 aa  384  1e-105  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.177006 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1480  cyclohexanone monooxygenase  39.52 
 
 
549 aa  383  1e-105  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.693995  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00027  steroid monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G00440)  38.09 
 
 
544 aa  380  1e-104  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0766369  normal  0.112462 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0393  steroid monooxygenase  38.76 
 
 
543 aa  378  1e-103  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0510  cyclohexanone monooxygenase  40.19 
 
 
545 aa  349  1e-94  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04151  steroid monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G00440)  34.29 
 
 
542 aa  341  4e-92  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2102  cyclohexanone monooxygenase  39.07 
 
 
517 aa  338  2.9999999999999997e-91  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.200217  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03488  cyclohexanone monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G09400)  33.89 
 
 
554 aa  328  2.0000000000000001e-88  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07793  conserved hypothetical protein  34.1 
 
 
717 aa  310  5.9999999999999995e-83  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.185522 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57936  Cyclopentanone 1,2-monooxygenase (CPMO)  33.03 
 
 
540 aa  310  9e-83  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05421  steroid monooxygenase (CpmA), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G07490)  30.97 
 
 
542 aa  281  3e-74  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.465779  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2514  lipolytic protein  29.62 
 
 
816 aa  269  1e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24723  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3600  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  29.69 
 
 
816 aa  267  7e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.188476  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1088  flavoprotein involved in K+ transport-like protein  36.43 
 
 
499 aa  265  3e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.437859  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5336  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  29.94 
 
 
816 aa  263  1e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.996632 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4269  FAD dependent oxidoreductase  37.05 
 
 
512 aa  260  1e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0844717  normal  0.426386 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3505  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  29 
 
 
818 aa  258  2e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0114186 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3920  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  29.52 
 
 
816 aa  258  3e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.41262  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0366  FAD dependent oxidoreductase  35.67 
 
 
484 aa  258  4e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1697  monooxygenase FAD-binding protein  35.61 
 
 
605 aa  257  8e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.293831 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3819  cyclohexanone monooxygenase  32.65 
 
 
527 aa  256  1.0000000000000001e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0895  cyclohexanone monooxygenase  35.53 
 
 
491 aa  254  3e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.970799 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3696  hypothetical protein  34.88 
 
 
608 aa  252  2e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.761481  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4837  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.05 
 
 
506 aa  251  5e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.685298  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11422  monoxygenase  35.63 
 
 
491 aa  251  6e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.178527  normal  0.251324 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1834  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.73 
 
 
484 aa  247  8e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.112506  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1636  Phenylacetone monooxygenase  33.73 
 
 
603 aa  246  9.999999999999999e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.672961  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6818  putative flavin-binding monooxygenase  35.94 
 
 
479 aa  244  5e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0926246 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0184  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.46 
 
 
495 aa  243  1e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.39474  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3031  FAD dependent oxidoreductase  34.37 
 
 
493 aa  243  1e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2987  FAD dependent oxidoreductase  34.37 
 
 
493 aa  243  1e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.87247  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2421  cyclohexanone monooxygenase  37.5 
 
 
498 aa  241  4e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.423318  normal  0.213742 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2374  cyclohexanone monooxygenase  37.5 
 
 
498 aa  241  4e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.845854  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28920  predicted flavoprotein involved in K+ transport  35.77 
 
 
505 aa  241  4e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.264104 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1145  flavin-containing monooxygenase FMO  32.76 
 
 
529 aa  241  5.999999999999999e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.854282  normal  0.14107 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1471  flavin-binding monooxygenase-like protein  33.05 
 
 
524 aa  241  5.999999999999999e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0890  putative lipase  44.98 
 
 
310 aa  241  5.999999999999999e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.120136  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2415  cyclohexanone monooxygenase  37.5 
 
 
497 aa  240  6.999999999999999e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0558  4-hydroxyacetophenone monooxygenase  33.26 
 
 
529 aa  240  1e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0347496  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1009  flavin-containing monooxygenase FMO  33.26 
 
 
529 aa  240  1e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.449884  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2526  flavin-binding monooxygenase-like protein  33.26 
 
 
524 aa  240  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1347  putative monooxygenase  33.26 
 
 
529 aa  240  1e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4019  FAD dependent oxidoreductase  33.54 
 
 
525 aa  239  1e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.122722  normal  0.797146 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1165  cyclohexanone monooxygenase  32.04 
 
 
604 aa  239  1e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.785376  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2885  putative flavin-binding monooxygenase  35.6 
 
 
489 aa  239  2e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1270  putative monooxygenase  33.26 
 
 
529 aa  239  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3598  flavin-containing monooxygenase FMO  32.33 
 
 
524 aa  238  3e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44560  putative flavin-containing monooxygenase  32.12 
 
 
527 aa  238  4e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.554415 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3530  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.36 
 
 
500 aa  238  5.0000000000000005e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3835  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.4 
 
 
485 aa  237  9e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3747  FAD dependent oxidoreductase  34.02 
 
 
484 aa  237  9e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5462  esterase/lipase/thioesterase  44.9 
 
 
311 aa  236  1.0000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.536989  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1441  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  43.55 
 
 
317 aa  236  1.0000000000000001e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4867  Cyclohexanone monooxygenase  33.72 
 
 
653 aa  236  1.0000000000000001e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3757  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  46.24 
 
 
311 aa  235  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.315687 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3694  flavin-containing monooxygenase FMO  32.33 
 
 
526 aa  236  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.920418  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>