More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5712 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010557  BamMC406_5712  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  100 
 
 
344 aa  697    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.579878 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5954  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  98.84 
 
 
344 aa  690    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350499  normal  0.849659 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6063  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  91.86 
 
 
344 aa  625  1e-178  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7669  esterase/lipase/thioesterase  89.66 
 
 
348 aa  619  1e-176  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.753901  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5770  Alpha/beta hydrolase fold-3  91.57 
 
 
344 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.950469  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6135  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  91.57 
 
 
344 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.970207  normal  0.96238 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6617  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  91.28 
 
 
344 aa  600  1e-170  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.141576 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2196  lipase  79.48 
 
 
341 aa  552  1e-156  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.56452  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5601  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  81.67 
 
 
342 aa  522  1e-147  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4939  Alpha/beta hydrolase fold-3  72.76 
 
 
321 aa  478  1e-134  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3221  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  72.76 
 
 
321 aa  478  1e-134  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.865641 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3375  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  68.17 
 
 
350 aa  448  1e-125  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.354679  normal  0.126247 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3998  esterase/lipase/thioesterase  69.48 
 
 
337 aa  442  1e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000526107  normal  0.48129 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2094  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  63.37 
 
 
339 aa  438  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.317288  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1766  lipase  66.77 
 
 
339 aa  434  1e-121  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1958  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  62.21 
 
 
339 aa  431  1e-119  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0704762  normal  0.359976 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3812  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  61.92 
 
 
339 aa  429  1e-119  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.422077  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2080  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  62.21 
 
 
339 aa  427  1e-119  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3098  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  63.08 
 
 
338 aa  428  1e-119  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.387961  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2632  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  62.61 
 
 
338 aa  420  1e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.275441  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02616  lipase signal peptide protein  67.86 
 
 
339 aa  418  1e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.83944 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3446  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  66.35 
 
 
339 aa  416  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1969  esterase/lipase/thioesterase  60.7 
 
 
338 aa  412  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.574416  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0839  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  59.01 
 
 
339 aa  411  1e-114  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0542  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  64.06 
 
 
337 aa  407  1.0000000000000001e-112  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0587  lipase  63.75 
 
 
337 aa  406  1.0000000000000001e-112  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0373  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  58.5 
 
 
339 aa  405  1.0000000000000001e-112  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00172019  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0403  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  60.6 
 
 
336 aa  402  1e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1386  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  63.93 
 
 
326 aa  401  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.372479  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2852  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  66.67 
 
 
324 aa  402  1e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.255078 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2661  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  61.61 
 
 
325 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1345  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  60.45 
 
 
349 aa  394  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2787  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  61.09 
 
 
328 aa  388  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.528915  normal  0.113664 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3807  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  59.67 
 
 
330 aa  375  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.136684  normal  0.307308 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5440  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  59.34 
 
 
330 aa  374  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.165063 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0746  Alpha/beta hydrolase fold-3  57.01 
 
 
331 aa  358  7e-98  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.192331 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1740  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  55.19 
 
 
327 aa  344  1e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0318  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  50.8 
 
 
329 aa  330  2e-89  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2844  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  55.45 
 
 
337 aa  317  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.446939  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3113  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  55.3 
 
 
337 aa  315  6e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.723098  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0880  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  51.44 
 
 
324 aa  312  4.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.691733  hitchhiker  0.0000246401 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5453  putative exported lipase/esterase  52.6 
 
 
319 aa  296  3e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.131781  normal  0.198573 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1856  hypothetical protein  46.23 
 
 
321 aa  284  1.0000000000000001e-75  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1851  hypothetical protein  45.9 
 
 
321 aa  282  8.000000000000001e-75  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2931  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  50.72 
 
 
316 aa  270  2.9999999999999997e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.360942  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1940  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  50.53 
 
 
325 aa  261  1e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.270718  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2316  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  47.6 
 
 
321 aa  258  9e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5060  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  54.63 
 
 
314 aa  237  2e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0996  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  45.75 
 
 
321 aa  234  1.0000000000000001e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1441  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  42.61 
 
 
317 aa  214  2.9999999999999995e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5462  esterase/lipase/thioesterase  42.96 
 
 
311 aa  207  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.536989  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1839  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  42.8 
 
 
311 aa  202  5e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.166294  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1665  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  43.54 
 
 
313 aa  202  8e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.414824 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0942  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.3 
 
 
312 aa  200  3e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.911706  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3653  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  41.44 
 
 
308 aa  200  3.9999999999999996e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4552  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.46 
 
 
307 aa  198  9e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0574937 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0314  Alpha/beta hydrolase fold-3  41.56 
 
 
310 aa  196  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0217857  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0324  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  41.56 
 
 
310 aa  196  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381561  normal  0.441011 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0305  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  41.15 
 
 
310 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1023  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  42.41 
 
 
313 aa  193  4e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.205112 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2443  putative lipase  39.36 
 
 
292 aa  193  4e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1213  lipolytic protein  41.2 
 
 
309 aa  192  6e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.583626  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3757  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.81 
 
 
311 aa  192  6e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.315687 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0952  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.63 
 
 
318 aa  190  2.9999999999999997e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4942  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  38.67 
 
 
314 aa  186  5e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3222  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.76 
 
 
316 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.29245  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7511  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  44.13 
 
 
315 aa  185  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4031  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.4 
 
 
312 aa  184  3e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.834602  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3830  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35.69 
 
 
311 aa  180  4e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2782  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36.52 
 
 
320 aa  179  5.999999999999999e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2671  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.83 
 
 
320 aa  179  8e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.199092  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2875  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35.22 
 
 
310 aa  178  1e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.406722  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2888  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  42.68 
 
 
315 aa  177  2e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.564555  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4223  putative lipase/esterase  37.37 
 
 
320 aa  178  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0604  esterase/lipase-like protein  41.85 
 
 
346 aa  177  3e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000548029 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0758  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36.88 
 
 
376 aa  177  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0959861 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2072  putative fusion protein  39.05 
 
 
884 aa  176  6e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.987766  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2218  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  41.39 
 
 
382 aa  175  9e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000644131  normal  0.0211816 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2623  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  40.6 
 
 
325 aa  174  1.9999999999999998e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.04826  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1072  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.06 
 
 
301 aa  173  5e-42  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2420  Alpha/beta hydrolase fold-3  34.88 
 
 
314 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.40186  normal  0.0240914 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1537  lipolytic protein  41.95 
 
 
318 aa  170  3e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000528451  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0890  putative lipase  35.92 
 
 
310 aa  169  5e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.120136  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3028  esterase/lipase/thioesterase  38.81 
 
 
314 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0380453  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2599  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  38.4 
 
 
370 aa  167  2.9999999999999998e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1249  esterase/lipase  34.47 
 
 
365 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0945507  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1872  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.36 
 
 
321 aa  166  4e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.208365 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1487  putative lipase/esterase  44.71 
 
 
305 aa  166  4e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0809512  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1307  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.11 
 
 
313 aa  166  5e-40  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0504826 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2703  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35.59 
 
 
316 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00278676  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2517  Alpha/beta hydrolase fold-3  39.39 
 
 
323 aa  164  2.0000000000000002e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0482  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  42.67 
 
 
332 aa  164  3e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.459032 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1772  esterase/lipase protein  34.3 
 
 
344 aa  162  5.0000000000000005e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0328  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  32.55 
 
 
311 aa  162  1e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.195989  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1475  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  34.63 
 
 
326 aa  162  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.617097  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5215  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.97 
 
 
311 aa  161  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.85138  normal  0.647883 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3606  putative esterase/lipase  40.09 
 
 
317 aa  160  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0140226  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1991  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35.77 
 
 
320 aa  160  4e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1713  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.77 
 
 
329 aa  160  4e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.386293  normal  0.298888 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1843  Alpha/beta hydrolase fold-3  33.9 
 
 
344 aa  159  5e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0838402  normal  0.122403 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>