More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2632 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2632  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  100 
 
 		 338 aa  688    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.275441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3098  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  82.84 
 
 		 338 aa  587  1e-166  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.387961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2661  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  82.55 
 
 		 325 aa  546  1e-154  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2094  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  76.4 
 
 		 339 aa  532  1e-150  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.317288  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3812  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  75.52 
 
 		 339 aa  528  1e-149  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.422077  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1958  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  75.52 
 
 		 339 aa  528  1e-149  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0704762  normal  0.359976 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2080  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  74.63 
 
 		 339 aa  525  1e-148  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1969  esterase/lipase/thioesterase  74.18 
 
 		 338 aa  523  1e-147  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.574416  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1766  lipase  71.43 
 
 		 339 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3998  esterase/lipase/thioesterase  70.24 
 
 		 337 aa  494  1e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000526107  normal  0.48129 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3446  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  71.2 
 
 		 339 aa  473  1e-132  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3375  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  66.86 
 
 		 350 aa  468  1.0000000000000001e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.354679  normal  0.126247 
 
 
-
 
NC_003296  RS02616  lipase signal peptide protein  70.16 
 
 		 339 aa  464  1e-129  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.83944 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2852  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  71.05 
 
 		 324 aa  460  9.999999999999999e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.255078 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0542  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  67.08 
 
 		 337 aa  452  1.0000000000000001e-126  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0587  lipase  66.77 
 
 		 337 aa  452  1.0000000000000001e-126  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0373  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  63.16 
 
 		 339 aa  444  1.0000000000000001e-124  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00172019  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1386  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  66.25 
 
 		 326 aa  442  1e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.372479  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0839  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  62.87 
 
 		 339 aa  444  1e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2196  lipase  65.35 
 
 		 341 aa  436  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.56452  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0403  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  62.54 
 
 		 336 aa  425  1e-118  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5601  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  64.95 
 
 		 342 aa  420  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5712  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  64.17 
 
 		 344 aa  418  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.579878 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2787  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  64.42 
 
 		 328 aa  420  1e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.528915  normal  0.113664 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1345  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  61.64 
 
 		 349 aa  415  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3807  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  63.61 
 
 		 330 aa  413  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.136684  normal  0.307308 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6063  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  62.85 
 
 		 344 aa  411  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5954  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  63.55 
 
 		 344 aa  413  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350499  normal  0.849659 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7669  esterase/lipase/thioesterase  64.31 
 
 		 348 aa  410  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.753901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4939  Alpha/beta hydrolase fold-3  63.64 
 
 		 321 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5770  Alpha/beta hydrolase fold-3  62.86 
 
 		 344 aa  408  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.950469  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3221  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  63.64 
 
 		 321 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.865641 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6135  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  62.86 
 
 		 344 aa  408  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.970207  normal  0.96238 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6617  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  62.62 
 
 		 344 aa  404  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.141576 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5440  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  57.28 
 
 		 330 aa  390  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.165063 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0746  Alpha/beta hydrolase fold-3  57.51 
 
 		 331 aa  378  1e-104  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.192331 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3113  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  58.97 
 
 		 337 aa  358  5e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.723098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1740  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  56.25 
 
 		 327 aa  358  9.999999999999999e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2844  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  58.65 
 
 		 337 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.446939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0880  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  55.66 
 
 		 324 aa  343  2e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.691733  hitchhiker  0.0000246401 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0318  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  50.65 
 
 		 329 aa  331  9e-90  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1856  hypothetical protein  51.8 
 
 		 321 aa  326  4.0000000000000003e-88  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1851  hypothetical protein  51.15 
 
 		 321 aa  324  2e-87  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5453  putative exported lipase/esterase  52.74 
 
 		 319 aa  304  2.0000000000000002e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.131781  normal  0.198573 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2931  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  50.85 
 
 		 316 aa  295  8e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.360942  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2316  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  48.59 
 
 		 321 aa  289  6e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1940  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  47.52 
 
 		 325 aa  277  2e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.270718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5060  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  52.36 
 
 		 314 aa  268  1e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0996  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  44.33 
 
 		 321 aa  242  5e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5462  esterase/lipase/thioesterase  41.4 
 
 		 311 aa  217  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.536989  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0942  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.27 
 
 		 312 aa  206  4e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.911706  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1213  lipolytic protein  46.81 
 
 		 309 aa  205  7e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.583626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3653  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  43.02 
 
 		 308 aa  203  4e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1441  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.46 
 
 		 317 aa  199  3.9999999999999996e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1839  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  40.8 
 
 		 311 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.166294  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2420  Alpha/beta hydrolase fold-3  39.15 
 
 		 314 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.40186  normal  0.0240914 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3757  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.29 
 
 		 311 aa  197  3e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.315687 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1665  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  45.06 
 
 		 313 aa  196  5.000000000000001e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414824 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7511  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  43.7 
 
 		 315 aa  195  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0890  putative lipase  37.5 
 
 		 310 aa  194  2e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.120136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1023  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  42.42 
 
 		 313 aa  194  3e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.205112 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4942  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  38.95 
 
 		 314 aa  193  3e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1307  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  42.11 
 
 		 313 aa  192  6e-48  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0504826 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3028  esterase/lipase/thioesterase  37.38 
 
 		 314 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0380453  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2863  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.42 
 
 		 325 aa  190  2.9999999999999997e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1072  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.62 
 
 		 301 aa  188  1e-46  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4223  putative lipase/esterase  38.25 
 
 		 320 aa  187  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2703  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  38.28 
 
 		 316 aa  187  3e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00278676  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0604  esterase/lipase-like protein  39.1 
 
 		 346 aa  186  5e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000548029 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4552  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.1 
 
 		 307 aa  186  6e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0574937 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2072  putative fusion protein  38.33 
 
 		 884 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.987766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1487  putative lipase/esterase  39.86 
 
 		 305 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0809512  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6777  lipolytic protein  38.46 
 
 		 316 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2443  putative lipase  37.54 
 
 		 292 aa  181  2e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2875  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.55 
 
 		 310 aa  180  2.9999999999999997e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.406722  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1772  esterase/lipase protein  35.78 
 
 		 344 aa  180  4e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1475  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35.78 
 
 		 326 aa  179  4.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.617097  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0758  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  38.11 
 
 		 376 aa  179  7e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0959861 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0305  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.06 
 
 		 310 aa  179  8e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2863  esterase/lipase/thioesterase  37.8 
 
 		 284 aa  178  1e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.797997  normal  0.352624 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0314  Alpha/beta hydrolase fold-3  38.31 
 
 		 310 aa  178  1e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0217857  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0324  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.31 
 
 		 310 aa  178  1e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381561  normal  0.441011 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1434  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35.14 
 
 		 326 aa  177  2e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0842646 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3924  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.26 
 
 		 326 aa  177  2e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.163224  normal  0.0505631 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1713  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.79 
 
 		 329 aa  177  2e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.386293  normal  0.298888 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0328  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35.55 
 
 		 311 aa  176  5e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.195989  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0482  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  41.34 
 
 		 332 aa  176  6e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.459032 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1991  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36.43 
 
 		 320 aa  176  7e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4884  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.69 
 
 		 289 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3606  putative esterase/lipase  36.86 
 
 		 317 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0140226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3830  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.77 
 
 		 311 aa  172  5.999999999999999e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4256  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  42.63 
 
 		 347 aa  172  7.999999999999999e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0760103  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0613  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.88 
 
 		 312 aa  171  2e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3222  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  29.65 
 
 		 316 aa  169  4e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.29245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2782  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  33.55 
 
 		 320 aa  170  4e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2010  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.74 
 
 		 335 aa  169  4e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0443  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  39.75 
 
 		 371 aa  169  5e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3428  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35.28 
 
 		 322 aa  169  5e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1872  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.93 
 
 		 321 aa  169  6e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.208365 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4747  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.07 
 
 		 321 aa  169  6e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.340698 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>