More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_1434 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_1434  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  100 
 
 		 326 aa  658    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0842646 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1475  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  96 
 
 		 326 aa  631  1e-180  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.617097  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1772  esterase/lipase protein  89.66 
 
 		 344 aa  575  1.0000000000000001e-163  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1419  lipolytic protein  72.47 
 
 		 383 aa  450  1e-125  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.252701  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1843  Alpha/beta hydrolase fold-3  70.79 
 
 		 344 aa  449  1e-125  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0838402  normal  0.122403 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1376  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  56.33 
 
 		 319 aa  340  2e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1194  carboxylesterase Est2  55.41 
 
 		 321 aa  339  4e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.5931  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1921  carboxylesterase Est2  55.41 
 
 		 321 aa  339  4e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2325  carboxylesterase Est2  55.41 
 
 		 321 aa  339  4e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.152899  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3383  esterase  55.41 
 
 		 319 aa  339  4e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.418724  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1430  esterase  55.41 
 
 		 319 aa  339  4e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.482815  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2286  carboxylesterase Est2  55.41 
 
 		 319 aa  339  4e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.124272  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2448  esterase  55.41 
 
 		 352 aa  339  5e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.376855  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6181  Alpha/beta hydrolase fold-3  55 
 
 		 338 aa  331  1e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1898  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  55 
 
 		 338 aa  331  1e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1713  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  55.35 
 
 		 329 aa  329  4e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.386293  normal  0.298888 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1991  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  55.03 
 
 		 320 aa  327  1.0000000000000001e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2149  esterase  54.79 
 
 		 327 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.571697  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1039  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  52.68 
 
 		 319 aa  323  2e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.240306  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2863  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  53.31 
 
 		 325 aa  322  5e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1935  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  53.85 
 
 		 319 aa  315  8e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0879113  normal  0.508771 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2267  putative esterase/lipase  55.97 
 
 		 321 aa  315  8e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.170928 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2525  Alpha/beta hydrolase fold-3  52.43 
 
 		 320 aa  313  2.9999999999999996e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.253728  hitchhiker  0.0086518 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2383  Alpha/beta hydrolase fold-3  50.8 
 
 		 327 aa  310  2e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.150129  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1921  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  55.33 
 
 		 319 aa  309  4e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.458098 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5198  esterase/lipase/thioesterase  55.18 
 
 		 319 aa  309  5e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.379534 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1835  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  54.67 
 
 		 319 aa  308  5.9999999999999995e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1807  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  54.33 
 
 		 319 aa  308  8e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.086728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3384  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  53.94 
 
 		 334 aa  306  4.0000000000000004e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10878  normal  0.17727 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2828  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  53.79 
 
 		 306 aa  303  3.0000000000000004e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0689271 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1944  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  52.44 
 
 		 321 aa  302  4.0000000000000003e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3416  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  51.85 
 
 		 359 aa  301  8.000000000000001e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.733003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1872  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  48.72 
 
 		 321 aa  287  2e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.208365 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1799  putative esterase/lipase  52.92 
 
 		 320 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1827  lipolytic protein  44.86 
 
 		 323 aa  259  5.0000000000000005e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5942  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  44.22 
 
 		 321 aa  258  9e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.268588  normal  0.0941301 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1090  putative lipase/esterase  46.77 
 
 		 328 aa  257  1e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.644515 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0942  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  45.07 
 
 		 312 aa  247  2e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.911706  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2860  carboxylesterase Est2  42.11 
 
 		 321 aa  229  3e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.79214  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4747  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  42.86 
 
 		 321 aa  224  1e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.340698 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4942  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  41.49 
 
 		 314 aa  220  3e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5462  esterase/lipase/thioesterase  42.16 
 
 		 311 aa  211  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.536989  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0952  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  43.01 
 
 		 318 aa  210  3e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3787  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.65 
 
 		 322 aa  210  3e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4218  lipase/esterase family protein  38.87 
 
 		 318 aa  209  4e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0305  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  41.52 
 
 		 310 aa  205  7e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2875  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  42.01 
 
 		 310 aa  205  8e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.406722  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4223  putative lipase/esterase  39.87 
 
 		 320 aa  205  9e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3028  esterase/lipase/thioesterase  38.41 
 
 		 314 aa  203  3e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0380453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0314  Alpha/beta hydrolase fold-3  40.48 
 
 		 310 aa  200  3e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0217857  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0324  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.48 
 
 		 310 aa  200  3e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381561  normal  0.441011 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2703  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  39.33 
 
 		 316 aa  197  3e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00278676  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2420  Alpha/beta hydrolase fold-3  38.33 
 
 		 314 aa  195  7e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.40186  normal  0.0240914 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2512  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  34.71 
 
 		 317 aa  195  9e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.119667  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1620  lipolytic protein  46.22 
 
 		 312 aa  194  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0105415  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1999  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.22 
 
 		 352 aa  194  2e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.027865 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0328  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36.13 
 
 		 311 aa  193  4e-48  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.195989  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3090  esterase/lipase/thioesterase  41.45 
 
 		 312 aa  192  9e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.110672 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4552  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.51 
 
 		 307 aa  191  1e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0574937 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2782  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  41.22 
 
 		 320 aa  191  2e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4256  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  45.71 
 
 		 347 aa  191  2e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0760103  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2010  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.56 
 
 		 335 aa  190  2.9999999999999997e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1654  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  42.09 
 
 		 356 aa  189  5e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0299965  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2162  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  43.75 
 
 		 371 aa  189  7e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0758  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35.91 
 
 		 376 aa  188  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0959861 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3543  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.81 
 
 		 315 aa  186  5e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.560296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3653  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  43.75 
 
 		 308 aa  186  6e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2094  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.96 
 
 		 339 aa  186  7e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.317288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1665  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  41.55 
 
 		 313 aa  185  1.0000000000000001e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414824 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36320  esterase/lipase  45.21 
 
 		 353 aa  185  1.0000000000000001e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1307  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.85 
 
 		 313 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0504826 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2080  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.53 
 
 		 339 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0983  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.13 
 
 		 309 aa  183  3e-45  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.875721 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2443  putative lipase  38.49 
 
 		 292 aa  183  3e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1072  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.81 
 
 		 301 aa  183  3e-45  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0613  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40 
 
 		 312 aa  183  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3812  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35.33 
 
 		 339 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.422077  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1023  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  41.3 
 
 		 313 aa  182  8.000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.205112 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1958  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.02 
 
 		 339 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0704762  normal  0.359976 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0890  putative lipase  42.7 
 
 		 310 aa  181  2e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.120136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6777  lipolytic protein  36.99 
 
 		 316 aa  181  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3735  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  42.86 
 
 		 310 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0759445 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1969  esterase/lipase/thioesterase  36.36 
 
 		 338 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.574416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0645  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.04 
 
 		 349 aa  178  9e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.575771 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3098  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.11 
 
 		 338 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.387961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12985  lipase/esterase lipN  43.82 
 
 		 376 aa  178  1e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2661  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.7 
 
 		 325 aa  177  2e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5478  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  43.83 
 
 		 317 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.157645 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2632  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.14 
 
 		 338 aa  177  2e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.275441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3992  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  45.39 
 
 		 304 aa  177  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.292538  normal  0.502023 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0443  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  41.41 
 
 		 371 aa  177  3e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7998  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36.04 
 
 		 316 aa  176  3e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4203  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  41.18 
 
 		 375 aa  176  5e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.307246  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1766  lipase  33.96 
 
 		 339 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0445  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.51 
 
 		 351 aa  174  1.9999999999999998e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.215683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1213  lipolytic protein  41.35 
 
 		 309 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.583626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1920  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  46.64 
 
 		 340 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.884364 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2671  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.94 
 
 		 320 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.199092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11428  lipase lipH  41.34 
 
 		 319 aa  173  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.13371e-22  normal  0.199346 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1537  lipolytic protein  42.52 
 
 		 318 aa  172  5.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000528451  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>