More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1766 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1766  lipase  100 
 
 		 339 aa  696    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3998  esterase/lipase/thioesterase  87.61 
 
 		 337 aa  620  1e-176  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000526107  normal  0.48129 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3812  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  73.75 
 
 		 339 aa  526  1e-148  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.422077  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2094  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  73.45 
 
 		 339 aa  526  1e-148  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.317288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2080  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  74.04 
 
 		 339 aa  524  1e-147  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1958  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  73.16 
 
 		 339 aa  523  1e-147  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0704762  normal  0.359976 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1969  esterase/lipase/thioesterase  72.92 
 
 		 338 aa  520  1e-146  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.574416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3098  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  70.83 
 
 		 338 aa  514  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.387961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2632  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  71.43 
 
 		 338 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.275441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0542  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  75.39 
 
 		 337 aa  503  1e-141  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0587  lipase  75.39 
 
 		 337 aa  503  1e-141  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3446  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  72.86 
 
 		 339 aa  500  1e-140  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2852  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  75.4 
 
 		 324 aa  495  1e-139  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.255078 
 
 
-
 
NC_003296  RS02616  lipase signal peptide protein  73.45 
 
 		 339 aa  494  9.999999999999999e-139  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.83944 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3375  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  69.3 
 
 		 350 aa  489  1e-137  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.354679  normal  0.126247 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0839  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  67.74 
 
 		 339 aa  476  1e-133  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2661  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  69.5 
 
 		 325 aa  473  1e-132  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0373  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  67.16 
 
 		 339 aa  474  1e-132  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00172019  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1386  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  68.77 
 
 		 326 aa  454  1e-127  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.372479  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0403  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  66.67 
 
 		 336 aa  453  1.0000000000000001e-126  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2196  lipase  67.78 
 
 		 341 aa  450  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.56452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2787  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  67.3 
 
 		 328 aa  438  9.999999999999999e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.528915  normal  0.113664 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1345  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  65.62 
 
 		 349 aa  439  9.999999999999999e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7669  esterase/lipase/thioesterase  68.83 
 
 		 348 aa  432  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.753901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5712  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  66.67 
 
 		 344 aa  432  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.579878 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5954  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  66.36 
 
 		 344 aa  429  1e-119  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350499  normal  0.849659 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5770  Alpha/beta hydrolase fold-3  67.2 
 
 		 344 aa  424  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.950469  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6063  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  66.56 
 
 		 344 aa  427  1e-118  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6135  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  67.2 
 
 		 344 aa  424  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.970207  normal  0.96238 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5601  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  66.88 
 
 		 342 aa  421  1e-117  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6617  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  66.88 
 
 		 344 aa  424  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.141576 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3807  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  62.86 
 
 		 330 aa  416  9.999999999999999e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.136684  normal  0.307308 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4939  Alpha/beta hydrolase fold-3  62.66 
 
 		 321 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3221  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  62.66 
 
 		 321 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.865641 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5440  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  57.59 
 
 		 330 aa  389  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.165063 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0746  Alpha/beta hydrolase fold-3  57.23 
 
 		 331 aa  373  1e-102  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.192331 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2844  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  59.37 
 
 		 337 aa  363  2e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.446939  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3113  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  58.54 
 
 		 337 aa  360  1e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.723098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0880  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  56.59 
 
 		 324 aa  356  3.9999999999999996e-97  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.691733  hitchhiker  0.0000246401 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1740  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  53.8 
 
 		 327 aa  354  1e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1856  hypothetical protein  53.49 
 
 		 321 aa  337  9.999999999999999e-92  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5453  putative exported lipase/esterase  55.24 
 
 		 319 aa  337  9.999999999999999e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.131781  normal  0.198573 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0318  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  51.43 
 
 		 329 aa  337  1.9999999999999998e-91  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1851  hypothetical protein  53.16 
 
 		 321 aa  335  5e-91  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2316  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  52.77 
 
 		 321 aa  311  1e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2931  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  52.61 
 
 		 316 aa  309  4e-83  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.360942  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1940  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  50.65 
 
 		 325 aa  292  5e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.270718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5060  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  46.69 
 
 		 314 aa  259  6e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0996  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  44.48 
 
 		 321 aa  249  5e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3757  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  40.84 
 
 		 311 aa  231  1e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.315687 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5462  esterase/lipase/thioesterase  42.91 
 
 		 311 aa  229  3e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.536989  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1441  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.25 
 
 		 317 aa  208  8e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3653  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  42.97 
 
 		 308 aa  205  7e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1839  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  43.3 
 
 		 311 aa  205  9e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.166294  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0942  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.12 
 
 		 312 aa  204  2e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.911706  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4552  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.81 
 
 		 307 aa  204  2e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0574937 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2072  putative fusion protein  40.21 
 
 		 884 aa  202  7e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.987766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0890  putative lipase  40.28 
 
 		 310 aa  200  3e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.120136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1665  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.27 
 
 		 313 aa  199  6e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414824 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1213  lipolytic protein  40.15 
 
 		 309 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.583626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3028  esterase/lipase/thioesterase  36.91 
 
 		 314 aa  197  3e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0380453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2420  Alpha/beta hydrolase fold-3  37.87 
 
 		 314 aa  197  3e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.40186  normal  0.0240914 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2443  putative lipase  39.3 
 
 		 292 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0952  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  38.52 
 
 		 318 aa  196  6e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2875  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36.08 
 
 		 310 aa  195  8.000000000000001e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.406722  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4942  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.3 
 
 		 314 aa  193  3e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4223  putative lipase/esterase  40.29 
 
 		 320 aa  192  5e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0758  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36.51 
 
 		 376 aa  192  6e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0959861 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1023  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  44.17 
 
 		 313 aa  191  2e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.205112 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0604  esterase/lipase-like protein  37.46 
 
 		 346 aa  188  9e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000548029 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0314  Alpha/beta hydrolase fold-3  33.44 
 
 		 310 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0217857  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0324  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.44 
 
 		 310 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381561  normal  0.441011 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7511  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  45.45 
 
 		 315 aa  187  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2888  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.16 
 
 		 315 aa  186  4e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.564555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2703  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.54 
 
 		 316 aa  186  7e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00278676  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1307  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.67 
 
 		 313 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0504826 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1072  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  41.3 
 
 		 301 aa  184  2.0000000000000003e-45  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0305  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.12 
 
 		 310 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2623  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  39.69 
 
 		 325 aa  184  3e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.04826  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3924  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.64 
 
 		 326 aa  183  4.0000000000000006e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.163224  normal  0.0505631 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0482  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.53 
 
 		 332 aa  183  4.0000000000000006e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.459032 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3428  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.2 
 
 		 322 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2010  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.82 
 
 		 335 aa  182  7e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2782  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  34.03 
 
 		 320 aa  182  1e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1772  esterase/lipase protein  34.59 
 
 		 344 aa  179  4e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1475  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  34.91 
 
 		 326 aa  180  4e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.617097  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3830  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36.1 
 
 		 311 aa  179  4e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1620  lipolytic protein  42.24 
 
 		 312 aa  179  9e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0105415  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0983  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.95 
 
 		 309 aa  177  2e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.875721 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1872  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.25 
 
 		 321 aa  177  2e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.208365 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0328  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  33.84 
 
 		 311 aa  177  3e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.195989  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1217  esterase/lipase/thioesterase  35.87 
 
 		 312 aa  176  4e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.265662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3606  putative esterase/lipase  36.6 
 
 		 317 aa  176  4e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0140226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1434  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  33.96 
 
 		 326 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0842646 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3222  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.77 
 
 		 316 aa  172  5e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.29245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1713  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.37 
 
 		 329 aa  171  1e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.386293  normal  0.298888 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1487  putative lipase/esterase  38.1 
 
 		 305 aa  171  1e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0809512  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2006  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  40.43 
 
 		 352 aa  171  2e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.368207  normal  0.502337 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1991  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.37 
 
 		 320 aa  171  2e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2671  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.89 
 
 		 320 aa  171  2e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.199092  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>