More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0082 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_0082  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  100 
 
 
360 aa  705    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1654  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  43.62 
 
 
356 aa  242  7e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0299965  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0226  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  45.61 
 
 
350 aa  242  7.999999999999999e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36320  esterase/lipase  43.51 
 
 
353 aa  224  1e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4256  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  44.2 
 
 
347 aa  224  2e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0760103  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3064  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  44.61 
 
 
355 aa  223  3e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000554719  hitchhiker  0.000820909 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12985  lipase/esterase lipN  41.31 
 
 
376 aa  222  6e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2162  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  43.98 
 
 
371 aa  219  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4203  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  43.98 
 
 
375 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.307246  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1537  lipolytic protein  54.07 
 
 
318 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000528451  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1920  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  44.94 
 
 
340 aa  209  7e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.884364 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1940  Alpha/beta hydrolase fold-3  44.35 
 
 
375 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.50518  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1986  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  44.35 
 
 
375 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0443  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  44.18 
 
 
371 aa  203  4e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2860  carboxylesterase Est2  45.63 
 
 
321 aa  203  5e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.79214  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1839  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  46.3 
 
 
311 aa  202  7e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.166294  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3653  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  47.04 
 
 
308 aa  202  9e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2010  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  47.58 
 
 
335 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0942  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  41.96 
 
 
312 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.911706  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2517  Alpha/beta hydrolase fold-3  47.37 
 
 
323 aa  193  3e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3028  esterase/lipase/thioesterase  44.81 
 
 
314 aa  192  6e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0380453  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2420  Alpha/beta hydrolase fold-3  43.87 
 
 
314 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.40186  normal  0.0240914 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1665  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  44.79 
 
 
313 aa  189  7e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.414824 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1841  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  42.2 
 
 
347 aa  188  1e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.126037  normal  0.0700576 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2006  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  38.63 
 
 
352 aa  187  2e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.368207  normal  0.502337 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3121  esterase/lipase/thioesterase  43.7 
 
 
321 aa  187  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1213  lipolytic protein  48.23 
 
 
309 aa  187  3e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.583626  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4552  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  46.7 
 
 
307 aa  184  3e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0574937 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2599  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  41.98 
 
 
370 aa  183  5.0000000000000004e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3757  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  44.34 
 
 
311 aa  183  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.315687 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2443  putative lipase  40.62 
 
 
292 aa  181  2e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0952  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  40.35 
 
 
318 aa  181  2e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0305  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  45.26 
 
 
310 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3113  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  40.47 
 
 
337 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.723098  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2844  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  40.47 
 
 
337 aa  179  7e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.446939  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0890  putative lipase  41.1 
 
 
310 aa  178  1e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.120136  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0758  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  39.18 
 
 
376 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0959861 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2875  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  40.6 
 
 
310 aa  177  2e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.406722  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1487  putative lipase/esterase  40.49 
 
 
305 aa  177  3e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0809512  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5215  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  43.88 
 
 
311 aa  177  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.85138  normal  0.647883 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0314  Alpha/beta hydrolase fold-3  44.83 
 
 
310 aa  176  4e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0217857  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0324  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  44.83 
 
 
310 aa  176  4e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381561  normal  0.441011 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0613  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  44.44 
 
 
312 aa  177  4e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0445  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.44 
 
 
351 aa  176  6e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.215683  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2703  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  43.68 
 
 
316 aa  175  9e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00278676  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1772  esterase/lipase protein  44.16 
 
 
344 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4223  putative lipase/esterase  45.75 
 
 
320 aa  175  9.999999999999999e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4942  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  40.26 
 
 
314 aa  174  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5462  esterase/lipase/thioesterase  44.12 
 
 
311 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.536989  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1713  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  45.13 
 
 
329 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.386293  normal  0.298888 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0880  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  38.7 
 
 
324 aa  173  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.691733  hitchhiker  0.0000246401 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3090  esterase/lipase/thioesterase  43.36 
 
 
312 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.110672 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5286  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.95 
 
 
362 aa  173  5e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.365819  normal  0.925115 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1475  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  39.56 
 
 
326 aa  172  5.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.617097  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1434  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  42.42 
 
 
326 aa  172  5.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0842646 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2512  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  41.34 
 
 
317 aa  172  6.999999999999999e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.119667  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1991  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  44.69 
 
 
320 aa  172  6.999999999999999e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1266  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  43.73 
 
 
628 aa  172  1e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.19561  hitchhiker  0.00155525 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1419  lipolytic protein  43.72 
 
 
383 aa  171  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.252701  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1620  lipolytic protein  45.19 
 
 
312 aa  171  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0105415  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1999  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.43 
 
 
352 aa  171  2e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.027865 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2672  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  42.75 
 
 
309 aa  171  2e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.795558  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1023  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  49.78 
 
 
313 aa  170  3e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.205112 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0645  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.33 
 
 
349 aa  170  3e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.575771 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1872  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  46.22 
 
 
321 aa  169  5e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.208365 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0983  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.15 
 
 
309 aa  169  9e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.875721 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2525  Alpha/beta hydrolase fold-3  41.88 
 
 
320 aa  168  1e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.253728  hitchhiker  0.0086518 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5478  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  45.79 
 
 
317 aa  168  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.157645 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6777  lipolytic protein  43.31 
 
 
316 aa  167  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2306  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.85 
 
 
307 aa  167  2e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2418  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.14 
 
 
300 aa  166  4e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.382013  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2377  Alpha/beta hydrolase fold-3  40.14 
 
 
300 aa  166  4e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0604  esterase/lipase-like protein  40.15 
 
 
346 aa  166  4e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000548029 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2424  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.14 
 
 
300 aa  166  4e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.0082744  normal  0.188139 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1843  Alpha/beta hydrolase fold-3  41.99 
 
 
344 aa  166  6.9999999999999995e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0838402  normal  0.122403 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2632  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.72 
 
 
338 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.275441  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3606  putative esterase/lipase  45.45 
 
 
317 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0140226  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2782  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  41.02 
 
 
320 aa  164  2.0000000000000002e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4218  lipase/esterase family protein  35.66 
 
 
318 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1944  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  43.56 
 
 
321 aa  164  3e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1307  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.49 
 
 
313 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0504826 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7511  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  42.15 
 
 
315 aa  163  5.0000000000000005e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11429  lipase lipH  39.44 
 
 
320 aa  162  7e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.4414e-17  normal  0.258557 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3098  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.26 
 
 
338 aa  162  9e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.387961  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2768  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  40.55 
 
 
308 aa  162  9e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.718585 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0324  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  38.74 
 
 
308 aa  161  1e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1555  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  42.69 
 
 
316 aa  162  1e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4595  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  43.7 
 
 
305 aa  162  1e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.259573 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1249  esterase/lipase  36.51 
 
 
365 aa  162  1e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0945507  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3924  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  41.11 
 
 
326 aa  161  2e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.163224  normal  0.0505631 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3830  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  40.93 
 
 
311 aa  161  2e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1827  lipolytic protein  40 
 
 
323 aa  161  2e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3735  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.14 
 
 
310 aa  160  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0759445 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3416  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  43.11 
 
 
359 aa  161  2e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.733003  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3222  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.21 
 
 
316 aa  160  3e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.29245  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3590  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.68 
 
 
305 aa  160  3e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4031  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.48 
 
 
312 aa  160  3e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.834602  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2863  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  43.56 
 
 
325 aa  160  4e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2267  putative esterase/lipase  39.11 
 
 
321 aa  160  4e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.170928 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2888  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  41.5 
 
 
315 aa  160  4e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.564555  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>