More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0445 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_0445  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  100 
 
 
351 aa  710    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.215683  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0645  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  54.44 
 
 
349 aa  348  8e-95  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.575771 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12985  lipase/esterase lipN  41.69 
 
 
376 aa  225  1e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4203  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  41.37 
 
 
375 aa  216  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.307246  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1654  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  42.22 
 
 
356 aa  211  1e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0299965  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4942  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  43.09 
 
 
314 aa  209  7e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2162  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.6 
 
 
371 aa  209  8e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3028  esterase/lipase/thioesterase  43.67 
 
 
314 aa  208  9e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0380453  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2703  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  45 
 
 
316 aa  207  3e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00278676  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1841  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  42.81 
 
 
347 aa  206  4e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.126037  normal  0.0700576 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1920  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  46.01 
 
 
340 aa  206  4e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.884364 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5462  esterase/lipase/thioesterase  44.8 
 
 
311 aa  203  3e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.536989  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1940  Alpha/beta hydrolase fold-3  45.25 
 
 
375 aa  203  3e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.50518  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1665  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  45.52 
 
 
313 aa  203  3e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.414824 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1986  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  45.25 
 
 
375 aa  203  3e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2006  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  38.42 
 
 
352 aa  202  8e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.368207  normal  0.502337 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2420  Alpha/beta hydrolase fold-3  43 
 
 
314 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.40186  normal  0.0240914 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4223  putative lipase/esterase  42.95 
 
 
320 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4256  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.02 
 
 
347 aa  199  6e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0760103  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3757  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  38.51 
 
 
311 aa  199  9e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.315687 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0942  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  41.32 
 
 
312 aa  196  4.0000000000000005e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.911706  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0226  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  41.83 
 
 
350 aa  194  1e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2860  carboxylesterase Est2  41.72 
 
 
321 aa  193  4e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.79214  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36320  esterase/lipase  40.46 
 
 
353 aa  193  4e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0758  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37 
 
 
376 aa  191  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0959861 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2875  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  39.29 
 
 
310 aa  191  2e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.406722  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0890  putative lipase  39.71 
 
 
310 aa  189  5e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.120136  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1307  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.94 
 
 
313 aa  189  5e-47  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0504826 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0952  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  42.86 
 
 
318 aa  189  8e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2517  Alpha/beta hydrolase fold-3  42.27 
 
 
323 aa  187  3e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1376  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  41.18 
 
 
319 aa  186  6e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1620  lipolytic protein  46.24 
 
 
312 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0105415  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6181  Alpha/beta hydrolase fold-3  39.79 
 
 
338 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1898  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.79 
 
 
338 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2782  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  39.32 
 
 
320 aa  182  1e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1537  lipolytic protein  47.54 
 
 
318 aa  180  4e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000528451  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2149  esterase  39.52 
 
 
327 aa  178  1e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.571697  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1839  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  40.89 
 
 
311 aa  178  1e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.166294  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3121  esterase/lipase/thioesterase  39.43 
 
 
321 aa  177  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2010  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.48 
 
 
335 aa  177  3e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0443  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  42.59 
 
 
371 aa  177  3e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3830  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  40.55 
 
 
311 aa  177  3e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1921  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.14 
 
 
319 aa  176  5e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.458098 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1807  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.14 
 
 
319 aa  176  8e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.086728  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3651  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.14 
 
 
373 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1835  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.79 
 
 
319 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2325  carboxylesterase Est2  39.18 
 
 
321 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.152899  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1441  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  39.16 
 
 
317 aa  174  1.9999999999999998e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4595  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  43.06 
 
 
305 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.259573 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1999  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.22 
 
 
352 aa  174  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.027865 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1434  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36.51 
 
 
326 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0842646 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1807  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  42.66 
 
 
306 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1194  carboxylesterase Est2  39.18 
 
 
321 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.5931  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1921  carboxylesterase Est2  39.18 
 
 
321 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1430  esterase  39.18 
 
 
319 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.482815  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3383  esterase  39.18 
 
 
319 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.418724  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2448  esterase  39.18 
 
 
352 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.376855  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1475  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.13 
 
 
326 aa  172  5e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.617097  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1772  esterase/lipase protein  37.07 
 
 
344 aa  172  5.999999999999999e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1827  lipolytic protein  35.02 
 
 
323 aa  172  6.999999999999999e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6777  lipolytic protein  45.06 
 
 
316 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3064  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.61 
 
 
355 aa  172  9e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000554719  hitchhiker  0.000820909 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5056  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  43.75 
 
 
305 aa  172  1e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.23715  normal  0.694103 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1991  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  39.78 
 
 
320 aa  171  2e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3222  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.9 
 
 
316 aa  170  3e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.29245  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2286  carboxylesterase Est2  38.49 
 
 
319 aa  170  3e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.124272  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2306  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.57 
 
 
307 aa  170  3e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1670  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.29 
 
 
309 aa  170  4e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1713  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.78 
 
 
329 aa  170  4e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.386293  normal  0.298888 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2863  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36.77 
 
 
325 aa  170  4e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3416  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.29 
 
 
359 aa  170  4e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.733003  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3269  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  38.83 
 
 
328 aa  169  5e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1872  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.87 
 
 
321 aa  169  6e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.208365 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5942  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.64 
 
 
321 aa  169  8e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.268588  normal  0.0941301 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5198  esterase/lipase/thioesterase  39.1 
 
 
319 aa  169  8e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.379534 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0305  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.04 
 
 
310 aa  169  9e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1487  putative lipase/esterase  39.15 
 
 
305 aa  167  2e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0809512  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4031  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.15 
 
 
312 aa  168  2e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.834602  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1072  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.58 
 
 
301 aa  167  2e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1213  lipolytic protein  42.41 
 
 
309 aa  167  4e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.583626  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2525  Alpha/beta hydrolase fold-3  38.59 
 
 
320 aa  167  4e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.253728  hitchhiker  0.0086518 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5283  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  40 
 
 
340 aa  167  4e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.966169  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3653  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.93 
 
 
308 aa  166  5.9999999999999996e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0328  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  33.09 
 
 
311 aa  166  6.9999999999999995e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.195989  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2662  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  42.86 
 
 
313 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000201414 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0314  Alpha/beta hydrolase fold-3  38.7 
 
 
310 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0217857  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0324  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.7 
 
 
310 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381561  normal  0.441011 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2464  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  42.22 
 
 
317 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000166142  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1843  Alpha/beta hydrolase fold-3  36.56 
 
 
344 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0838402  normal  0.122403 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2418  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  41.04 
 
 
300 aa  164  3e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.382013  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2424  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  41.04 
 
 
300 aa  164  3e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.0082744  normal  0.188139 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2377  Alpha/beta hydrolase fold-3  41.04 
 
 
300 aa  164  3e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7511  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.37 
 
 
315 aa  164  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1266  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  41.29 
 
 
628 aa  163  4.0000000000000004e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.19561  hitchhiker  0.00155525 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4552  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.2 
 
 
307 aa  163  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0574937 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1039  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.27 
 
 
319 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.240306  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2443  putative lipase  40.22 
 
 
292 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2479  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  41.77 
 
 
313 aa  163  4.0000000000000004e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.26249  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2267  putative esterase/lipase  37.41 
 
 
321 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.170928 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1935  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36.97 
 
 
319 aa  162  6e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0879113  normal  0.508771 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>