More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_4321 on replicon NC_010678
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010678  Rpic_4321  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  100 
 
 
325 aa  655    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.164009 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4431  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  100 
 
 
325 aa  655    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.31619  normal  0.530483 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6775  esterase/lipase/thioesterase  69.3 
 
 
327 aa  414  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.641311  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3028  esterase/lipase/thioesterase  36.16 
 
 
314 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0380453  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4223  putative lipase/esterase  33.97 
 
 
320 aa  181  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3121  esterase/lipase/thioesterase  34.31 
 
 
321 aa  179  7e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2420  Alpha/beta hydrolase fold-3  35.39 
 
 
314 aa  179  8e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.40186  normal  0.0240914 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0758  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.73 
 
 
376 aa  178  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0959861 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0328  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  39.64 
 
 
311 aa  177  2e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.195989  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2703  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35.5 
 
 
316 aa  176  7e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00278676  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5462  esterase/lipase/thioesterase  40.21 
 
 
311 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.536989  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1039  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.05 
 
 
319 aa  170  3e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.240306  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3428  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.15 
 
 
322 aa  168  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1665  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.41 
 
 
313 aa  168  1e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.414824 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7998  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36.89 
 
 
316 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1935  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35.97 
 
 
319 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0879113  normal  0.508771 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36320  esterase/lipase  42.28 
 
 
353 aa  164  1.0000000000000001e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2267  putative esterase/lipase  35.25 
 
 
321 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.170928 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0952  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.59 
 
 
318 aa  162  6e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2010  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.11 
 
 
335 aa  158  9e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1487  putative lipase/esterase  38.93 
 
 
305 aa  158  1e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0809512  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0226  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  40.3 
 
 
350 aa  158  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1991  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35.03 
 
 
320 aa  157  2e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3651  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.19 
 
 
373 aa  157  2e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1072  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.63 
 
 
301 aa  157  3e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3090  esterase/lipase/thioesterase  36.96 
 
 
312 aa  157  3e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.110672 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1807  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.94 
 
 
319 aa  157  3e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.086728  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1713  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.69 
 
 
329 aa  156  5.0000000000000005e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.386293  normal  0.298888 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2662  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.24 
 
 
313 aa  155  6e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000201414 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4942  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.05 
 
 
314 aa  155  6e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5198  esterase/lipase/thioesterase  35.23 
 
 
319 aa  155  6e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.379534 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1376  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.04 
 
 
319 aa  155  6e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1835  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.94 
 
 
319 aa  155  7e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2512  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36.82 
 
 
317 aa  155  8e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.119667  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2782  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  38.78 
 
 
320 aa  154  1e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2672  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.07 
 
 
309 aa  154  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.795558  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3653  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.77 
 
 
308 aa  155  1e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0942  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.8 
 
 
312 aa  154  2e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.911706  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1194  carboxylesterase Est2  35.25 
 
 
321 aa  153  4e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.5931  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2325  carboxylesterase Est2  35.25 
 
 
321 aa  153  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.152899  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1430  esterase  35.25 
 
 
319 aa  153  4e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.482815  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6777  lipolytic protein  37.08 
 
 
316 aa  153  4e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1921  carboxylesterase Est2  35.25 
 
 
321 aa  153  4e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3383  esterase  35.25 
 
 
319 aa  153  4e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.418724  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2448  esterase  35.25 
 
 
352 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.376855  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3222  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  31.35 
 
 
316 aa  152  7e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.29245  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5478  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  38.72 
 
 
317 aa  152  8.999999999999999e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.157645 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2875  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  38.16 
 
 
310 aa  152  1e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.406722  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2149  esterase  34.89 
 
 
327 aa  151  1e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.571697  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6181  Alpha/beta hydrolase fold-3  34.52 
 
 
338 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1898  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.52 
 
 
338 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1654  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.45 
 
 
356 aa  151  1e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0299965  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0890  putative lipase  35.02 
 
 
310 aa  150  2e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.120136  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1921  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.52 
 
 
319 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.458098 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5215  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.31 
 
 
311 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.85138  normal  0.647883 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2479  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.17 
 
 
313 aa  150  3e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.26249  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2860  carboxylesterase Est2  38.15 
 
 
321 aa  150  3e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.79214  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2286  carboxylesterase Est2  34.53 
 
 
319 aa  150  4e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.124272  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4218  lipase/esterase family protein  34.63 
 
 
318 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1620  lipolytic protein  35.11 
 
 
312 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0105415  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2828  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.56 
 
 
306 aa  148  1.0000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0689271 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1843  Alpha/beta hydrolase fold-3  34.56 
 
 
344 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0838402  normal  0.122403 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3735  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.85 
 
 
310 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0759445 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1920  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.93 
 
 
340 aa  147  3e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.884364 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3269  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  36.75 
 
 
328 aa  147  4.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6313  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  33.72 
 
 
311 aa  146  4.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.179325  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2517  Alpha/beta hydrolase fold-3  39.42 
 
 
323 aa  145  7.0000000000000006e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4552  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.49 
 
 
307 aa  145  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0574937 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1307  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39 
 
 
313 aa  145  1e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0504826 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3357  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.86 
 
 
303 aa  145  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.697717 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3787  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.08 
 
 
322 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1839  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.7 
 
 
311 aa  144  2e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.166294  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4256  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.67 
 
 
347 aa  144  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0760103  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3113  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  33.09 
 
 
337 aa  143  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.723098  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1999  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.09 
 
 
352 aa  142  6e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.027865 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1186  Alpha/beta hydrolase fold-3  32.09 
 
 
311 aa  142  6e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.102278  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2162  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39 
 
 
371 aa  142  6e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1213  lipolytic protein  37.07 
 
 
309 aa  142  8e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.583626  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1940  Alpha/beta hydrolase fold-3  37.24 
 
 
375 aa  142  8e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.50518  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1986  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.24 
 
 
375 aa  142  8e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2844  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  33.83 
 
 
337 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.446939  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3757  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  32.21 
 
 
311 aa  141  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.315687 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3286  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.7 
 
 
329 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2306  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.92 
 
 
307 aa  140  1.9999999999999998e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0305  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.52 
 
 
310 aa  140  3e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1827  lipolytic protein  37.07 
 
 
323 aa  140  3e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1756  lipolytic enzyme  35.1 
 
 
318 aa  140  3e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.211028  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0880  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36.89 
 
 
324 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.691733  hitchhiker  0.0000246401 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0661  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.7 
 
 
329 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.372291 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12985  lipase/esterase lipN  37.5 
 
 
376 aa  139  6e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3606  putative esterase/lipase  35.09 
 
 
317 aa  139  6e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0140226  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0314  Alpha/beta hydrolase fold-3  36.52 
 
 
310 aa  139  6e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0217857  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0324  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.52 
 
 
310 aa  139  6e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381561  normal  0.441011 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3924  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.4 
 
 
326 aa  139  7e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.163224  normal  0.0505631 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2863  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  32.89 
 
 
325 aa  139  7.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1023  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36.21 
 
 
313 aa  139  7.999999999999999e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.205112 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2599  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.39 
 
 
370 aa  139  7.999999999999999e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2418  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.31 
 
 
300 aa  139  7.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.382013  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3462  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.53 
 
 
329 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.477584 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2424  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.31 
 
 
300 aa  139  7.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.0082744  normal  0.188139 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>