More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3787 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_3787  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  100 
 
 		 322 aa  646    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3543  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  57.99 
 
 		 315 aa  346  4e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.560296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2860  carboxylesterase Est2  51.42 
 
 		 321 aa  279  5e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.79214  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4218  lipase/esterase family protein  49.06 
 
 		 318 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1827  lipolytic protein  43.3 
 
 		 323 aa  243  3.9999999999999997e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2149  esterase  43.04 
 
 		 327 aa  231  1e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.571697  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1430  esterase  42.39 
 
 		 319 aa  227  2e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.482815  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1194  carboxylesterase Est2  42.39 
 
 		 321 aa  227  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.5931  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2448  esterase  42.39 
 
 		 352 aa  227  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.376855  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1921  carboxylesterase Est2  42.39 
 
 		 321 aa  227  2e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2325  carboxylesterase Est2  42.39 
 
 		 321 aa  227  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.152899  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3383  esterase  42.39 
 
 		 319 aa  227  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.418724  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1419  lipolytic protein  42.95 
 
 		 383 aa  226  3e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.252701  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1090  putative lipase/esterase  43.75 
 
 		 328 aa  224  2e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.644515 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2286  carboxylesterase Est2  41.75 
 
 		 319 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.124272  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6181  Alpha/beta hydrolase fold-3  41.1 
 
 		 338 aa  215  8e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1898  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  41.1 
 
 		 338 aa  215  8e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1376  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  41.42 
 
 		 319 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1713  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  43.59 
 
 		 329 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.386293  normal  0.298888 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1991  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  43.22 
 
 		 320 aa  212  5.999999999999999e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1944  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  41.99 
 
 		 321 aa  212  9e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1843  Alpha/beta hydrolase fold-3  41.75 
 
 		 344 aa  211  1e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0838402  normal  0.122403 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1799  putative esterase/lipase  45.02 
 
 		 320 aa  210  2e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1434  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  38.65 
 
 		 326 aa  210  3e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0842646 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4747  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  43.79 
 
 		 321 aa  208  9e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.340698 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1475  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  39.08 
 
 		 326 aa  208  1e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.617097  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2267  putative esterase/lipase  39.48 
 
 		 321 aa  207  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.170928 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1935  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  38.83 
 
 		 319 aa  207  3e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0879113  normal  0.508771 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1807  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  41.1 
 
 		 319 aa  207  3e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.086728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1835  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  41.42 
 
 		 319 aa  207  3e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1872  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  43.38 
 
 		 321 aa  205  6e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.208365 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2828  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  43.38 
 
 		 306 aa  206  6e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0689271 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2383  Alpha/beta hydrolase fold-3  39.53 
 
 		 327 aa  204  2e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.150129  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1039  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.86 
 
 		 319 aa  204  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.240306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3416  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  42.75 
 
 		 359 aa  203  4e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.733003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1921  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  41.42 
 
 		 319 aa  202  4e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.458098 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2525  Alpha/beta hydrolase fold-3  38.38 
 
 		 320 aa  202  5e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.253728  hitchhiker  0.0086518 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4942  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  39.34 
 
 		 314 aa  202  6e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1772  esterase/lipase protein  37.85 
 
 		 344 aa  202  7e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5198  esterase/lipase/thioesterase  40.45 
 
 		 319 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.379534 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4223  putative lipase/esterase  40.62 
 
 		 320 aa  199  5e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0942  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.67 
 
 		 312 aa  196  3e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.911706  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3384  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.54 
 
 		 334 aa  196  6e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10878  normal  0.17727 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2863  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  40.75 
 
 		 325 aa  191  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5942  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.46 
 
 		 321 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.268588  normal  0.0941301 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3121  esterase/lipase/thioesterase  37.11 
 
 		 321 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1999  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.15 
 
 		 352 aa  181  1e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.027865 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2703  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36.52 
 
 		 316 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00278676  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2010  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.36 
 
 		 335 aa  176  4e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1654  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.07 
 
 		 356 aa  176  5e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0299965  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3028  esterase/lipase/thioesterase  34.27 
 
 		 314 aa  176  6e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0380453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2420  Alpha/beta hydrolase fold-3  34.95 
 
 		 314 aa  175  7e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.40186  normal  0.0240914 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7998  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36.75 
 
 		 316 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0890  putative lipase  39.85 
 
 		 310 aa  171  2e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.120136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0443  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  43.59 
 
 		 371 aa  169  5e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2306  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.55 
 
 		 307 aa  169  5e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5462  esterase/lipase/thioesterase  37.5 
 
 		 311 aa  169  6e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.536989  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2782  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  33.75 
 
 		 320 aa  168  1e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1307  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.46 
 
 		 313 aa  167  2e-40  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0504826 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2006  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.27 
 
 		 352 aa  167  2.9999999999999998e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.368207  normal  0.502337 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1670  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.38 
 
 		 309 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3428  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35.33 
 
 		 322 aa  166  5e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2512  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35.13 
 
 		 317 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.119667  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2875  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  41.24 
 
 		 310 aa  164  3e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.406722  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1213  lipolytic protein  35.87 
 
 		 309 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.583626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0952  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35.95 
 
 		 318 aa  163  5.0000000000000005e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1072  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.12 
 
 		 301 aa  162  9e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3446  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  34.97 
 
 		 339 aa  162  9e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0604  esterase/lipase-like protein  34.68 
 
 		 346 aa  161  1e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000548029 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3269  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  37.21 
 
 		 328 aa  160  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1537  lipolytic protein  40.47 
 
 		 318 aa  160  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000528451  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1023  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  41.8 
 
 		 313 aa  160  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.205112 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5215  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  39.38 
 
 		 311 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.85138  normal  0.647883 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5478  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  38.59 
 
 		 317 aa  159  6e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.157645 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2162  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.25 
 
 		 371 aa  159  6e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5453  putative exported lipase/esterase  37.9 
 
 		 319 aa  159  7e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.131781  normal  0.198573 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0880  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  34.97 
 
 		 324 aa  159  7e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.691733  hitchhiker  0.0000246401 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3867  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  41.47 
 
 		 310 aa  159  7e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.695714  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0445  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.75 
 
 		 351 aa  159  8e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.215683  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02616  lipase signal peptide protein  34.27 
 
 		 339 aa  157  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.83944 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1856  hypothetical protein  33.67 
 
 		 321 aa  157  3e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3222  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.02 
 
 		 316 aa  157  3e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.29245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3098  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.27 
 
 		 338 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.387961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3757  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  39.15 
 
 		 311 aa  157  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.315687 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1851  hypothetical protein  33.44 
 
 		 321 aa  156  5.0000000000000005e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1620  lipolytic protein  39.23 
 
 		 312 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0105415  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1487  putative lipase/esterase  38.06 
 
 		 305 aa  156  6e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0809512  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2316  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.5 
 
 		 321 aa  155  6e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0328  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  31.23 
 
 		 311 aa  155  7e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.195989  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3064  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  39.6 
 
 		 355 aa  154  1e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000554719  hitchhiker  0.000820909 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2632  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.94 
 
 		 338 aa  155  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.275441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6777  lipolytic protein  37.78 
 
 		 316 aa  154  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3653  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.16 
 
 		 308 aa  154  2e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2931  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.5 
 
 		 316 aa  154  2e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.360942  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1665  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.29 
 
 		 313 aa  153  2.9999999999999998e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414824 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4031  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.73 
 
 		 312 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.834602  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4203  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39 
 
 		 375 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.307246  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3113  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  31.95 
 
 		 337 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.723098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6775  esterase/lipase/thioesterase  35.82 
 
 		 327 aa  153  4e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.641311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2094  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.26 
 
 		 339 aa  153  4e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.317288  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>