More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_5286 on replicon NC_009507
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009507  Swit_5286  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  100 
 
 		 362 aa  709    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.365819  normal  0.925115 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5283  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  46.13 
 
 		 340 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.966169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1333  putative lipase  47.32 
 
 		 328 aa  295  1e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0109525 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1249  esterase/lipase  46.11 
 
 		 365 aa  287  2e-76  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0945507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5462  esterase/lipase/thioesterase  40.73 
 
 		 311 aa  214  2.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.536989  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0613  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.37 
 
 		 312 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3653  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  45.36 
 
 		 308 aa  197  2.0000000000000003e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3028  esterase/lipase/thioesterase  39.81 
 
 		 314 aa  196  6e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0380453  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1839  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  44.24 
 
 		 311 aa  193  4e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.166294  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4223  putative lipase/esterase  38.8 
 
 		 320 aa  192  6e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0890  putative lipase  38.41 
 
 		 310 aa  192  8e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.120136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0942  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.44 
 
 		 312 aa  190  2.9999999999999997e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.911706  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2420  Alpha/beta hydrolase fold-3  38.87 
 
 		 314 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.40186  normal  0.0240914 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4942  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  40 
 
 		 314 aa  190  2.9999999999999997e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1991  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  39.75 
 
 		 320 aa  190  4e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1713  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.44 
 
 		 329 aa  189  8e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.386293  normal  0.298888 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3757  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  42.29 
 
 		 311 aa  189  9e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.315687 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2782  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  43.02 
 
 		 320 aa  187  3e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1555  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  39.73 
 
 		 316 aa  187  3e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0758  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  34.15 
 
 		 376 aa  186  5e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0959861 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2443  putative lipase  37.63 
 
 		 292 aa  183  3e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3222  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.29 
 
 		 316 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.29245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2703  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  39.24 
 
 		 316 aa  182  1e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00278676  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0983  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  41.53 
 
 		 309 aa  181  2e-44  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.875721 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1944  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.98 
 
 		 321 aa  181  2e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2662  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  43.68 
 
 		 313 aa  180  4e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000201414 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1023  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  45.98 
 
 		 313 aa  179  4.999999999999999e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.205112 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2672  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  42.35 
 
 		 309 aa  179  8e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.795558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0952  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  38.19 
 
 		 318 aa  179  8e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0604  esterase/lipase-like protein  42.24 
 
 		 346 aa  178  2e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000548029 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3992  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  41.81 
 
 		 304 aa  175  9e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.292538  normal  0.502023 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3098  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.33 
 
 		 338 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.387961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2072  putative fusion protein  38.54 
 
 		 884 aa  175  9.999999999999999e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.987766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2464  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  42.91 
 
 		 317 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000166142  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2010  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.02 
 
 		 335 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3867  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  41.38 
 
 		 310 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.695714  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0645  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.1 
 
 		 349 aa  173  2.9999999999999996e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.575771 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1772  esterase/lipase protein  36.69 
 
 		 344 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1537  lipolytic protein  42.68 
 
 		 318 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000528451  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1307  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  41.2 
 
 		 313 aa  172  5e-42  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0504826 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3735  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  41.48 
 
 		 310 aa  173  5e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0759445 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2512  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35.22 
 
 		 317 aa  170  3e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.119667  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1441  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35.96 
 
 		 317 aa  170  3e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6777  lipolytic protein  39.12 
 
 		 316 aa  170  3e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2162  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.16 
 
 		 371 aa  169  6e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1475  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35.39 
 
 		 326 aa  168  1e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.617097  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0305  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.32 
 
 		 310 aa  168  1e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2525  Alpha/beta hydrolase fold-3  37.62 
 
 		 320 aa  168  1e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.253728  hitchhiker  0.0086518 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0314  Alpha/beta hydrolase fold-3  37.06 
 
 		 310 aa  168  1e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0217857  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0324  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.06 
 
 		 310 aa  168  1e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381561  normal  0.441011 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1969  esterase/lipase/thioesterase  34.45 
 
 		 338 aa  167  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.574416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11428  lipase lipH  41.01 
 
 		 319 aa  167  2e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.13371e-22  normal  0.199346 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4031  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.26 
 
 		 312 aa  167  2e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.834602  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2632  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.24 
 
 		 338 aa  167  2e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.275441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3384  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.27 
 
 		 334 aa  167  2.9999999999999998e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10878  normal  0.17727 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3830  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  38.03 
 
 		 311 aa  167  2.9999999999999998e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1665  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  45.15 
 
 		 313 aa  166  4e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414824 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1194  carboxylesterase Est2  36.36 
 
 		 321 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.5931  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1921  carboxylesterase Est2  36.36 
 
 		 321 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2325  carboxylesterase Est2  36.36 
 
 		 321 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.152899  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2875  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  38.19 
 
 		 310 aa  166  6.9999999999999995e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.406722  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1430  esterase  36.36 
 
 		 319 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.482815  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2448  esterase  36.36 
 
 		 352 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.376855  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3383  esterase  36.36 
 
 		 319 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.418724  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3090  esterase/lipase/thioesterase  38.89 
 
 		 312 aa  165  9e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.110672 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0082  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36.5 
 
 		 360 aa  165  9e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4552  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.24 
 
 		 307 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0574937 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2671  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.33 
 
 		 320 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.199092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1434  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  34.74 
 
 		 326 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0842646 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2860  carboxylesterase Est2  37.94 
 
 		 321 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.79214  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1654  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.11 
 
 		 356 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0299965  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3416  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.97 
 
 		 359 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.733003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1376  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.49 
 
 		 319 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5453  putative exported lipase/esterase  36.05 
 
 		 319 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.131781  normal  0.198573 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1620  lipolytic protein  38.55 
 
 		 312 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0105415  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2517  Alpha/beta hydrolase fold-3  44.12 
 
 		 323 aa  164  2.0000000000000002e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4203  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.76 
 
 		 375 aa  163  3e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.307246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2286  carboxylesterase Est2  36.05 
 
 		 319 aa  163  3e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.124272  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2888  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.14 
 
 		 315 aa  161  1e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.564555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1872  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.93 
 
 		 321 aa  161  1e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.208365 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1419  lipolytic protein  34.71 
 
 		 383 aa  161  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.252701  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0880  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  33.55 
 
 		 324 aa  161  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.691733  hitchhiker  0.0000246401 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2267  putative esterase/lipase  37.79 
 
 		 321 aa  161  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.170928 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36320  esterase/lipase  38.46 
 
 		 353 aa  160  2e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0445  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.31 
 
 		 351 aa  161  2e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.215683  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3812  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  32.91 
 
 		 339 aa  160  4e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.422077  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2844  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  34.01 
 
 		 337 aa  160  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.446939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2479  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.08 
 
 		 313 aa  160  4e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.26249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2080  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.49 
 
 		 339 aa  159  5e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1958  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.59 
 
 		 339 aa  159  5e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0704762  normal  0.359976 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2006  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35.94 
 
 		 352 aa  159  7e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.368207  normal  0.502337 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1940  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.96 
 
 		 325 aa  159  7e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.270718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2787  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  33.96 
 
 		 328 aa  159  8e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.528915  normal  0.113664 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1920  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  42.37 
 
 		 340 aa  159  1e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.884364 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0328  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  31.66 
 
 		 311 aa  159  1e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.195989  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2661  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.11 
 
 		 325 aa  159  1e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3998  esterase/lipase/thioesterase  33.44 
 
 		 337 aa  158  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000526107  normal  0.48129 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1090  putative lipase/esterase  38.61 
 
 		 328 aa  159  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.644515 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2094  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.12 
 
 		 339 aa  159  1e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.317288  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1766  lipase  33.33 
 
 		 339 aa  157  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>